Bağdat ilinde yara ve yanık enfeksiyonu olan hastalardan izole edilen Pseudomonas aeruginosa'nın moleküler ve immünolojik çalışması
Molecular and immunological study of Pseudomonas aeruginosa isolated from wound and burn infected patients in Baghdad government
- Tez No: 884923
- Danışmanlar: DOÇ. DR. MELDA DÖLARSLAN, PROF. DR. AMRAN MEZHER LAWAS
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Biyoloji, Biology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2024
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Çankırı Karatekin Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Pseudomonas aeruginosa, bağışıklık sistemi zayıflamış bireyleri, özellikle de ciddi yanık, yara enfeksiyonu ve benzeri rahatsızlıkları olanları fırsatçı bir şekilde enfekte eden önemli bir bakteridir. Çeşitli ilaçlara karşı dirençli olduğu bilinmektedir. Bu bakteriler olumsuz çevresel koşullarına karşı yüksek derecede toleransa sahiptir ve oldukça geniş bir sıcaklık spektrumuna dayanabilir. Çeşitli dezenfektanlara ve antibiyotiklere karşı doğal direncine ek olarak, bu organizma direnç kazandıran genler ve bakteri popülasyonu büyüdükçe hastalığa neden olma ve enfeksiyon başlatma potansiyelini artıran diğer değişkenleri edinme kapasitesine sahiptir. Yanıklar ve yaralar, bütüncül sisteme nüfuz eden, bağışıklık sistemini zayıflatan, hastanede kalış süresini uzatan ve nihayetinde hastanedeyken enfeksiyon kapma olasılığını artıran, deride meydana gelen ciddi travmatik yaralanmalar olarak tanımlanmaktadır. Yanık ve yara enfeksiyonları genellikle sistemik antibiyotiklerin tedbirsizce uygulanması sonucunda sepsise ve ölümlere yol açabilir. Cerrahi debridman ve deri grefti gibi müdahaleler, toplumda çoklu ilaca dirençli Pseudomonas aeruginosa'nın yerleşmesi için ideal koşullar yaratmaktadır. Bu durum, tedavi seçeneklerinin kısıtlı olması üzerinde önemli bir etkiye sahiptir. Bakterinin patojenitesi tamamen virülans faktörlerine bağlıdır ve bunlar akut ve kronik enfeksiyonla ilişkili bileşenler olarak kategorize edilebilir. Birçok çalışma, belirli virülans faktörlerinin Pseudomonas aeruginosa enfeksiyonlarında, özellikle de yanık ve yara enfeksiyonlarında önemli bir rol oynadığını göstermiştir. Bu çalışma, Irak'ın başkenti Bağdat'taki çeşitli hastanelere başvuran 250 yanık ve yara enfeksiyonu hastasını kapsamaktadır. Ayrıca, immünolojik açıdan kontrol amacıyla 76 sağlıklı kişiden oluşan bir kontrol grubu da çalışmaya dahil edilmiştir. İzolatlar, bir dizi biyokimyasal testin yanı sıra kanlı ve MacConkey agar kullanılarak ekilmiş ve tanımlanmıştır. Doğrulayıcı tanıyı ve antibiyotik direnç profilini belirlemek için VITEK-2 kompakt sistemi kullanılmıştır. İzolatların biyofilm oluşturma kapasitesi kantitatif Mikrotitre plakası tekniği ile test edilmiştir. Tüm virülans genlerini tanımlamak için konvansiyonel polimeraz zincir reaksiyonu gerçekleştirilmiştir. Hem enfekte hem de sağlıklı kontrol gruplarında interlökin -1 ve 22'nin kan miktarını değerlendirmek için enzime bağlı immünosorbent test yöntemi kullanılmıştır. Yaşa bağlı olarak, en yüksek bakteri izolat sıklığı %32,9 ile 15-30 yaş grubundan elde edilirken, bunu %26,3 ile 31-50 yaş grubu, %19,7 ile 51-70 yaş grubu ve %14,5 ile >70 yaş grubu izlemiştir. En düşük bakteri sıklığı %6,6 ile <15 yaş grubundan elde edilirken, cinsiyete göre bakıldığında kadınlarda (%60,5) erkeklere (%39,5) kıyasla daha yüksek sıklık görülmüştür. Yanık örneklerinden toplanan bakteriyel izolatlar (%51,3), yaralardan toplanan bakteriyel izolatlara (%48,7) kıyasla daha yüksektir. 76 bakteri izolatının %46,1'i güçlü biyofilm oluşturma kapasitesine, %27,6'sı orta düzeyde biyofilm oluşturma kapasitesine ve %18,4'ü zayıf biyofilm oluşturma kapasitesine sahiptir. Buna karşılık, %7,9'u biyofilm oluşturma yeteneğine sahip değildir. Bakteri izolatları arasında en yüksek direnç oranı Sefotaksim'e (%78,95) karşı görülürken, bunu Norfloksasin (%69,74) izlemiştir. Orta direnç oranı Sefepim'e (%51,32) karşı olup, bunu Seftazidin (%50) ve Piprasilin-Tazobaktam (%48,68) takip etmiştir. Buna karşılık, en düşük direnç oranı sırasıyla Siprofloksasin (%39,47), Gentamisin (%36,84), İmipenem ve Meropenem (%35,53)'dir. Ayrıca, en düşük direnç oranı Amikasin'e (%34,21) karşı görülmüştür. Bakteri izolatları arasında virülans geni prevalansı yüksek olup algD (%90,79), plcH (%59), plcN (%76,32), LasB (%77,63) ve exoS (%73,68) olarak sıralanmıştır. İmmünolojik açıdan, P. aeruginosa ile enfekte hastaların ortalama IL-1 ve IL-22 serum seviyeleri (sırasıyla 5,235±1,160 ve 30,93±4,289 pg/mL) kontrol grubuna (sırasıyla 3,838±1,050 ve 23,39±4.243 pg/mL) göre daha yüksektir. Ayrıca, IL-1 ve IL 22 serum düzeyleri açısından her iki çalışma grubu arasında istatistiksel olarak anlamlı bir fark vardır (p değeri<0,0001). Sonuç olarak, Pseudomonas aeruginosa bakterisi hastane enfeksiyonlarında, özellikle de yanık ve yara vakalarında benzersiz bir rol oynamaktadır. Bunun nedeni, antibiyotiklere karşı geniş bir direnç yelpazesi göstermeleri, ayrıca biyofilm oluşturma kapasiteleri ve enfeksiyonu şiddetlendirmelerine ve tedavisini zorlaştırmalarına olanak tanıyan çok sayıda virülans genine sahip olmalarıdır. Araştırma ayrıca bağışıklık tepkisinin bakteriyel enfeksiyonların patojenitesini azaltmada kayda değer bir rol oynadığını göstermiştir. Bunun nedeni, bağışıklık tepkisinin, yüksek düzeyde virülans ve ilaçlara direnç gösteren izolatların üstesinden gelmede yardımcı olan bir teknik olarak kullanılabilmesidir
Özet (Çeviri)
Pseudomonas aeruginosa is an important bacterium that opportunistically infects individuals with weakened immune systems, especially those with severe burns, wound infections and similar conditions. It is known to be resistant to various drugs. These bacteria have a high degree of tolerance to unfavorable environmental conditions and can withstand a wide spectrum of temperatures. In addition to its natural resistance to various disinfectants and antibiotics, this organism has the capacity to acquire genes that confer resistance and other variants that increase the potential to cause disease and initiate infection as the bacterial population grows. Burns and wounds are defined as serious traumatic injuries to the skin that penetrate the integumentary system, weaken the immune system, prolong hospitalization and ultimately increase the likelihood of infection while in hospital. Burn and wound infections can lead to sepsis and death, often because of imprudent administration of systemic antibiotics. Interventions such as surgical debridement and skin grafting create ideal conditions for the establishment of multidrug-resistant Pseudomonas aeruginosa in the community. This has a significant impact on the limited treatment options. The pathogenicity of the bacterium is entirely dependent on virulence factors, which can be categorized into components associated with acute and chronic infection. Many studies have shown that certain virulence factors play an important role in Pseudomonas aeruginosa infections, especially in burn and wound infections. This study included 250 patients with burn and wound infections admitted to various hospitals in Baghdad, Iraq. In addition, a control group of 76 healthy individuals was also included for immunological control. Isolates were cultured and identified using blood and MacConkey agar as well as a series of biochemical tests. The VITEK-2 compact system was used to determine the confirmatory diagnosis and antibiotic resistance profile. The biofilm forming capacity of the isolates was tested by quantitative Microtiter plate technique. Conventional polymerase chain reaction was performed to identify all virulence genes. Enzyme-linked immunosorbent assay method was used to evaluate blood levels of interleukins -1 and 22 in both infected and healthy control groups. The highest frequency of bacterial isolates was obtained from 15-30 age group with 32.9%, followed by 31-50 age group with 26.3%, 51-70 age group with 19.7% and >70 age group with 14.5%. The lowest bacterial frequency was obtained from the <15 age group with 6.6%, and when analyzed by gender, a higher frequency was observed in females (60.5%) compared to males (39.5%). Bacterial isolates collected from burn samples (51.3%) were higher than bacterial isolates collected from wounds (48.7%). Of the 76 bacterial isolates, 46.1% had strong biofilm forming capacity, 27.6% had moderate biofilm forming capacity and 18.4% had weak biofilm forming capacity. On the other hand, 7.9% were not capable of biofilm formation. The highest resistance rate among bacterial isolates was observed against Cefotaxime (78.95%), followed by Norfloxacin (69.74%). The medium resistance rate was observed against Cefepime (51.32%), followed by Ceftazidime (50%) and Piprasilin-Tazobactam (48.68%). On the other hand, the lowest resistance rates were to Ciprofloxacin (39.47%), Gentamicin (36.84%), Imipenem and Meropenem (35.53%), respectively. In addition, the lowest resistance rate was observed against Amikacin (34.21%). The prevalence of virulence genes among the bacterial isolates was high and ranked as algD (90.79%), plcH (59%), plcN (76.32%), LasB (77.63%) and exoS (73.68%). In immunological terms, the mean IL-1 and IL-22 serum levels of the patients infected with P. aeruginosa (5.235±1.160 and 30.93±4.289 pg/mL, respectively) were higher than the control group (3.838±1.050 and 23.39±4.243 pg/mL, respectively). In addition, there was a statistically significant difference between both study groups in terms of IL-1 and IL-22 serum levels (p value<0.0001). In conclusion, the bacterium Pseudomonas aeruginosa plays a unique role in nosocomial infections, especially in burn and wound cases. This is because they show a wide spectrum of resistance to antibiotics, as well as their capacity to form biofilms and possess many virulence genes that allow them to exacerbate infection and make it difficult to treat. Research has also shown that the immune response plays a notable role in reducing the pathogenicity of bacterial infections. This is because the immune response can be used as a technique to help overcome isolates that show high levels of virulence and resistance to drugs.
Benzer Tezler
- Synthesis of (-)-Camphene derivatives and evaluation of their biological activities
(-)-Kamfen türevlerinin sentezi ve biyolojik aktivitelerinin değerlendirilmesi
ANSAM ALMOTORY
- Fotoğraf sanatında algılama ve görsel dilin kullanımı
Başlık çevirisi yok
ÖNDER ERKARSLAN
Yüksek Lisans
Türkçe
1990
Dokuz Eylül ÜniversitesiSahne ve Görüntü Sanatları Ana Bilim Dalı
Yükleniyor...
- TBMM tutanaklarına göre 1950–1960 döneminde Türkiye'nin dış ilişkileri
Turkey's external relations in period 1950-1960 according to TBMM official reports
Yazar Bilgisi Yok
- Bağdat ilinde yanık ve yaralardan izole edilen antibiyotiklere dirençli Pseudomonas Aerugınosa'ya karşı bazı bitki ekstraktlarının etkinliğinin değerlendirilmesi
Evaluation of the efficacy of some plant extracts against Pseudomonas Aeruginosa after being resistant to antibiotics, isolated from burn and wound in baghdad province
RAYA RIYADH SALMAN AL-RUBAYE
- Scheduling implementation of an anti-corruption strategy in the Governorate of Baghdad
Bağdat ilinde yolsuzlukla mücadele stratejisinin programlanması
TAREQ ZEYAD FAHAD AL-MAJMAIE
