Papiller tiroid karsinomlarında braf V600E mutasyonunun realtime PZR analizi
Realtime PCR analysis of braf V600E mutation in papillary thyroid carcinomas
- Tez No: 885771
- Danışmanlar: PROF. DR. LEYLA AÇIK
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoloji, Biology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2024
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Gazi Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 97
Özet
Papiller tiroid karsinomları (PTK) çoğunlukla, genlerdeki BRAF ve RAS mutasyonlarından kaynaklı MAPK aktivasyonuyla hücre bölünmelerinde artışa neden olur. BRAF V600E 'nin PTK'de kötü prognozla ilişkisi olduğu bilinmektedir. Literatürde, PTK hastalarında BRAF V600E mutasyonuyla ilgili yapılmış az sayıda çalışma bulunmakta ve bu çalışmalardan elde edilen bulgular arasında farklılıklar yer almaktadır. Bu çalışmada PTK'de BRAF V600E mutasyonunun realtime PZR (gerçek zamanlı polimeraz zincir reaksiyonu) tekniği kullanılarak tespiti ve toplumdaki sıklığının ortaya konulması ile bugüne kadar elde edilmiş bulgulara yeni bulgular ekleyerek bu alanda var olan literatüre katkı sağlanması hedeflenmiştir. Bu çalışma klasik varyant, folliküler varyant ya da tall cell (uzun hücre) varyant PTK tanısı almış 100 olgudan alınan formalinle fikse edilmiş ve parafine gömülmüş (FFPE) tiroid dokularıyla yapılmıştır. Tümörlü dokuyu örnekleyen kesitlerden yeteri miktarda DNA içeren örneklerden BRAF V600E mutasyon tespit kiti kullanılarak realtime PZR tekniği ile BRAF V600E mutasyonu varlığı araştırılmıştır. Sonuçta, yedi örnekten analiz için yeterli DNA elde edilememiş, geriye kalan 88 örneğin 30'unun (%34,1) BRAF V600E negatif, 58'inin (%65,9) pozitif olduğu tespit edilmiştir. Bu mutasyonun pozitifliğinin PTK varyantlarındaki dağılımı, klasik varyantta %90,4, folliküler varyantta % 11,5 ve uzun hücre varyantta % 80,0 olarak bulunmuştur. Örneklerin BRAF V600E pozitifliği ile yaş, tümör kapsül varlığı, lenf nodu metastazı, yumuşak doku invazyonu ve tiroid kapsül invazyonu değişkeni arasında istatistiksel açıdan anlamlı ilişki tespit edilmiştir (p
Özet (Çeviri)
Papillary thyroid carcinomas (PTC) often cause increased cell divisions through MAPK activation caused by BRAF and RAS mutations in the genes. BRAF V600E is associated with poor prognosis in PTC. There are few studies in the literature on BRAF V600E mutation in PTC patients, and the findings from these studies are different. This study aims to contribute to the existing literature in this field by detecting the BRAF V600E mutation in PTC using the realtime PCR technique and determining its frequency in the population. This study was conducted with formalin-fixed, paraffin-embedded (FFPE) thyroid tissues taken from 100 cases diagnosed with classical, follicular or tall cell variant PTC. DNA was isolated from sections sampling tumor tissue, and the presence of mutation was investigated with realtime PCR in samples containing sufficient DNA. However, sufficient DNA could not be obtained for analysis from 5 samples, in the realtime PCR study performed with 95 samples, no results were obtained in 7 samples, BRAF V600E was negative in 30 of the remaining 88 samples (34.1%), and positive in 58 (65.9%). has been detected. The distribution of the positivity of this mutation in PTK variants was found to be 90.4% in the classical variant, 11.5% in the follicular variant and 80.0% in the tall cell variant. A statistically significant relationship was detected between BRAF V600E positivity of the samples and age, presence of tumor capsule, lymph node metastasis, soft tissue invasion and thyroid capsule invasion variables (p
Benzer Tezler
- Türk toplumunda papiller tiroid karsinomlarında BRAF V600E mutasyon sıklığının incelenmesi
Screening of the BRAF V600E prevalance at papillary thyroid carcinomas in Turkish population
BÜŞRA AYDIN
Yüksek Lisans
Türkçe
2017
BiyolojiNamık Kemal ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. RIFAT BİRCAN
DOÇ. DR. HÜLYA ILIKSU GÖZÜ
- Papiller tiroid karsinomlarında braf V600E ve H-TERT mutasyonlarının histomorfolojik bulgularla ve prognozla ilişkisi
Braf V600E and H-TERT mutations in papillary thyroid carcinomas; and their relations with histomorphologic findings and prognosis
FARUK ERDEM KOMBAK
- Papiller tiroid kanserlerinde pd-l1 ve braf v600e boyanma skorlarının prognostik faktörler ile ilişkisi
The relationship of pd-l1 and braf v600e staining scores with prognostic factors in papillary thyroid cancers
DUYGU TÜRKBEY ŞİMŞEK
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2020
PatolojiBaşkent ÜniversitesiTıbbi Patoloji Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ EDA YILMAZ AKÇAY
- Papiller mikrokarsinomlarda tert mutasyonu sıklığının araştırılması; histopatolojik alt tip ve klinikopatolojik bulgularla ilişkisi
Investigation of tert mutation frequency in papillary microcarcinomas; relationship with histopathological subtype and clinicopathological findings
ASLI AYDOĞDU YEŞİLOĞLU
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2022
PatolojiÇukurova ÜniversitesiTıbbi Patoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. AYSUN HATİCE UĞUZ
- Küçük hücreli dışı akciğer kanserlerindeimmünhistokimyasal ve moleküler yöntem ile ntrk füzyonu
Research of ntrk fusion by immunhistochemical andmolecular methods in non-small cell lung cancers
UBEYDULLAH ÖZTÜRK
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2023
PatolojiPamukkale ÜniversitesiTıbbi Patoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. FERDA BİR