Normal ve kanser kromozomlarında histon modifikasyonlarının ı̇mmunfloresan yöntem ile ı̇ncelenmesi
Examination of histone modifications in normal and cancer chromosomes by immunofluorescence method
- Tez No: 886231
- Danışmanlar: DOÇ. DR. YELDA TARKAN ARGÜDEN, PROF. DR. GAMZE TANRIVERDİ
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Genetik, Tıbbi Biyoloji, Biyoloji, Genetics, Medical Biology, Biology
- Anahtar Kelimeler: Sağlık, Sağlık ve hastalık, Health, Health and disease
- Yıl: 2024
- Dil: Türkçe
- Üniversite: İstanbul Üniversitesi-Cerrahpaşa
- Enstitü: Lisansüstü Eğitim Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Tıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Tıbbi Biyoloji Bilim Dalı
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Bir organizmanın genel epigenetik durumu olan epigenom, normal gelişimde genom kadar önemlidir. Epigenetik, DNA dizisinden ziyade kromatin yapı ve organizayonundaki değişiklikler yoluyla meydana gelen gen ifadesindeki kalıtsal değişikliklerin incelenmesidir. Kromatin iki durumda bulunabilir: gevşek, transkripsiyonel olarak aktif ökromatin veya yoğun, transkripsiyonel olarak inaktif heterokromatin. Histon proteinlerindeki kimyasal modifikasyonlar, transkripsiyon faktörlerinin ve enzimlerin DNA ile etkileşime girmesine izin vererek gen ekspresyonunu kolaylaştıran açık ökromatin durumunun veya transkripsiyonun başlamasını önleyerek gen ekspresyonunu baskılayan kapalı heterokromatin durumunun oluşumunu indükleyebilir. Kanser hem genetik, hem de epigenetik mekanizmalardaki düzensizliklerin rol oynadığı karmaşık bir hastalıktır. İmmünofloresan boyama, biyolojik örneklerdeki çeşitli molekülleri tespit etmek ve görselleştirmek için yaygın olarak kullanılan bir tekniktir. Bu çalışmanın amacı açık ve kapalı kromozom yapısı oluşturan histon modifikasyonlarının normal ve kanser kromozomlarında immunfloresan yöntemlerle incelemek ve aralarında bu açıdan fark olup olmadığını belirlemektir. Çalışmaya normal kromozom elde etmek için sağlıklı bireyler, kanser kromozomları elde etmek için ise K562 hücre hattı dahil edilmiştir. K562 hücre hattının kromozom yapısı laboratuvardan laboratuvara değişebildiğinden, çalışmaya dahil ettiğimiz K562 hücre hattının karyotipi GTL bantlama ve FISH yöntemi ile belirlenmiştir. Sağlıklı olgular ve K562 hücre hattına ait örneklerden elde edilen kromozomlarda açık kromatin işareti olan H3K27ac ve kapalı kromatin işareti H3K27me3 modifikasyonlarının immunfloresan boyama bant paternleri elde edildi ve her iki modifikasyonun gen açısından zengin bölgelerde yoğunlaştığı görüldü. Hem normal, hem de kanser örneklerinde değerlendirilebilen kromozomlarda (1, 12 ve 19. kromozomlar) immunfloresan bant paternlerinde belirgin bir fark gözlemlenmedi.
Özet (Çeviri)
The epigenome, the general epigenetic state of an organism, is as important as the genome in normal development. Epigenetics is the study of heritable changes in gene expression that occur through changes in the structure and organisation of chromatin rather than DNA sequence. Chromatin can exist in two states: loose, transcriptionally active euchromatin or dense, transcriptionally inactive heterochromatin. Chemical modifications in histone proteins can induce the formation of the open euchromatin state, which facilitates gene expression by allowing transcription factors and enzymes to interact with DNA, or the closed heterochromatin state, which represses gene expression by preventing the initiation of transcription. Cancer is a complex disease in which dysregulation of both genetic and epigenetic mechanisms play a role. Immunofluorescence staining is a widely used technique for detecting and visualising various molecules in biological samples. The aim of this study was to investigate the histone modifications that form open and closed chromosome structures in normal and cancer chromosomes by immunofluorescence methods and to determine whether there is a difference between them in this respect. The study included healthy individuals to obtain normal chromosomes and K562 cell line for cancer chromosomes. Since the chromosome structure of K562 cell line may vary from laboratory to laboratory, the karyotype of K562 cell line was determined by GTL banding and FISH method. Immunofluorescence staining band patterns of open chromatin marker H3K27ac and closed chromatin marker H3K27me3 modifications were obtained in the chromosomes from healthy subjects and K562 cell line samples and it was observed that both modifications were concentrated in gene-rich regions. No significant difference was observed in the immunofluorescent band patterns of the chromosomes (chromosomes 1, 12 and 19) that could be evaluated in both normal and cancer samples.
Benzer Tezler
- Kanser hücrelerinde genotoksik stres varlığında uydu DNA transkriptlerinin incelenmesi
Examination of satellite DNA transcripts in the presence of genotoxic stress in cancer cel
EDA YİLMAZ
Yüksek Lisans
Türkçe
2022
Onkolojiİstanbul ÜniversitesiTemel Onkoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. EBRU ESİN YÖRÜKER
- Kimyasal ajanların hücre siklusuna etkisi ve moleküler mekanizmalarının araştırılması
Effect of chemical agents on cell cycle and investigation of molecular mechanisms
GİZEM AKMAN
- Prostat kanserli hastalarda telomeraz aktivitesinin araştırılması
Investigation of telomerase activity in prostate cancer patients
LEVENT ZORBEK
Doktora
Türkçe
2012
BiyolojiHacettepe ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. HATİCE MERGEN
PROF. DR. MÜBECCEL DURUSOY
- Helicobacter pylorisi pozitif olan gastiritli vakalarda telomeraz aktivitesi
Telomerase activity at helicobacter pylori pozitive gastritis
EBRU KALE
- Meme kanseri kök hücrelerinde telomeraz inhibitörü BIBR1532 kullanımının otofajiyle ilişkisi
Relationship of telomerase inhibitor BIBR1532 use with autophagy in breast cancer stem cells
SİNEM ASLAN
Yüksek Lisans
Türkçe
2025
Tıbbi BiyolojiEge ÜniversitesiKök Hücre Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. NUR SELVİ GÜNEL