Polimeraz zincir reaksiyonu-restriksiyon enzim analizi yöntemi ile mikobakterilerin tür düzeyinde tanımlanması
Identification of mycobacteria to the species level by polymerase chain reaction and restriction enzyme analysis
- Tez No: 88888
- Danışmanlar: DOÇ.DR. A. DÜRDAL US
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Mikrobiyoloji, Microbiology
- Anahtar Kelimeler: Mikobakteriler, PRA, hsp65. iv T.fi. YÜK-:, ü ?.'..? :?-.'.?' r -?=>? öOKtiiiVsKNTASV'öiıl icMİEIİ, Mycobacteria, PRA, hsp65
- Yıl: 1999
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Hacettepe Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 54
Özet
ÖZET Mikobakterileri enfeksiyonlarının laboratuvar tanısında kullanılan kültür yöntemleri ve biyokimyasal testler uzun sürede sonuç vermekte ve özellikle tüberküloz dışı türlerin kesin olarak tanımlanması çoğu zaman mümkün olamamaktadır. Mikobakterilerin tür düzeyinde hızlı ve doğru olarak tanımlanması, gerek epidemiyolojik verilerin toplanması gerekse uygun tedavi protokollerinin oluşturulması açısından önem taşımaktadır. Bu çalışmada, Hacettepe Üniversitesi Hastanesi Klinik Patoloji Laboratuvar ı nda klinik örneklerden izole edilen 102 mikobakteri susu, ortak bir antijen olan 65 kDa'luk ısı şok proteinini (hsp65) kodlayan genin restriksiyon enzimleri ile kesilmesi prensibine dayanan polimeraz zincir reaksiyonu - restriksiyon enzim analizi (PRA) yöntemi ile tiplendirilmiştir. Suşların 80'i (%78.4) Mycobacterium tuberculosis, 22'si (%21.5) ise tüberküloz dışı mikobakteri olarak tanımlanmıştır. Tüberküloz dışı mikobakterilerin 4'ü (%18.2) M.gordonae I, 3'ü (%13.6) M.chelonae, 2'şer adedi (%9.1) M.gordonae III, M.gordonae IV, M.avium, M.pereghnum ve 1'er adedi (%4.5) M.fortuitum, M.fiavescens, M.malmoense, M.mucogenicum olarak tiplendirilmiştir. Ayrıca literatürde bildirilen tür saptama cetvellerinde yer almayan, farklı restriksiyon paterni gösteren 3 farklı tür belirlenmiştir. Tüberküloz dışı mikobakterilerin izole edildiği hastalardan çoğunun altta yatan başka bir hastalığı mevcuttur. Sonuç olarak, PRA yöntemi klinik örneklerden izole edilen mikobakterilerin tür düzeyinde tanımlanmasında hızlı, pratik ve güvenilir bir yöntem olarak görünmektedir.
Özet (Çeviri)
ABSTRACT Classical laboratory methods based on culture and biochemical tests for the diagnosis of mycobacterial infections, take a long time and frequently fail to produce a precise identification especially for non- tuberculous mycobacteria. Mycobacterial identification to the species level is important for both collecting epidemiologic data and selecting a proper treatment regimen. In this study, a total of 102 mycobacterial strains isolated from clinical specimens in Hacettepe University Hospital Clinical Pathology Laboratories, were evaluated by polymerase chain reaction - restriction fragment length polymorphism analysis (PRA) method, which detects common mycobacterial heat shock protein (hsp65). Eighty of 1 02 strains (78.4% ) were identified as Mycobacterium tuberculosis, and 22 (21.5% ) were identified as non-tuberculous mycobacteria (NTM). Most of the NTM strains have been isolated from patients who have underlying disorders and 4 (18.2%) of them were M.gordonae 1, 3 (13.6%) were M.chelonae, 2 of each (9.1%) were M.gordonae III, M.gordonae IV, M.avium, M.peregrinum and one of each (4.5%) were M.fortuitum, M.flavescens, M.malmoense, M.mucogenicum. Three strains of NTM that show different restriction patterns from earlier algorithms described in literature, could not be identified. As a result, PRA seems to be a rapid, practical and safe method for the species level identification of mycobacteria isolated from clinical specimens.
Benzer Tezler
- Androgenetik alopesili hastalarda serum D vitamini düzeyleri ile vitamin D reseptörü ve androjen reseptörü gen polimorfizmlerinin araştırılması
The investigation of serum vitamin D levels, vitamin D receptor gene polymorphisms and androgen receptor gene polymorphisms in patients with androgenetic alopecia
ŞEYMA YILMAZ
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2013
DermatolojiPamukkale ÜniversitesiDeri ve Zührevi Hast. Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. NİDA KAÇAR
- Livedoid vaskülitli hastaların klinik ve demografik özellikleri, faktör V leiden mutasyon sıklığı
Clinical and demographical features of patients with livedoid vasculitis and searching for factor V leiden mutation
SERPİL UYSAL
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2003
Dermatolojiİstanbul ÜniversitesiDermatoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. M. CEM MAT
- Sitokrom P450 2C19 (CYP2C19) genetik polimorfizmlerinin ülseratif kolit ve Crohn hastalığındaki etkileri
Effects of cytochrome P450 2C19 (CYP2C19) genetic polymorphisms in ulcerative colitis and Crohn's disease
SILA SOYLU KOÇOĞLU
Doktora
Türkçe
2023
Eczacılık ve FarmakolojiHacettepe ÜniversitesiTıbbi Farmakoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MELİH ÖNDER BABAOĞLU
- Paraoksonaz polimorfizmleri ile Tip 2 diabetin makro ve mikrovasküler komplikasyonları arasındaki ilişkinin araştırılması
The investigation of association between paraoxonase polymorphisms and the macro and microvascular complications of Type 2 Diabetes mellitus
AKAR KARAKOÇ
Yüksek Lisans
Türkçe
2008
BiyokimyaAtatürk ÜniversitesiBiyokimya Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. ABDULKADİR YILDIRIM
- Thermus aquaticus DNA polimeraz ı enziminin rekombinant DNA teknolojisi ile üretilmesi, saflaştırılması ve analizi
Purification and analysis of thermus aquaticus DNA polymerase i produced by recombinant DNA technologies
BURAK EKEN