Polimeraz zincir reaksiyonu-restriksiyon enzim analizi yöntemi ile mikobakterilerin tür düzeyinde tanımlanması
Identification of mycobacteria to the species level by polymerase chain reaction and restriction enzyme analysis
- Tez No: 88888
- Danışmanlar: DOÇ.DR. A. DÜRDAL US
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Mikrobiyoloji, Microbiology
- Anahtar Kelimeler: Mikobakteriler, PRA, hsp65. iv T.fi. YÜK-:, ü ?.'..? :?-.'.?' r -?=>? öOKtiiiVsKNTASV'öiıl icMİEIİ, Mycobacteria, PRA, hsp65
- Yıl: 1999
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Hacettepe Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 54
Özet
ÖZET Mikobakterileri enfeksiyonlarının laboratuvar tanısında kullanılan kültür yöntemleri ve biyokimyasal testler uzun sürede sonuç vermekte ve özellikle tüberküloz dışı türlerin kesin olarak tanımlanması çoğu zaman mümkün olamamaktadır. Mikobakterilerin tür düzeyinde hızlı ve doğru olarak tanımlanması, gerek epidemiyolojik verilerin toplanması gerekse uygun tedavi protokollerinin oluşturulması açısından önem taşımaktadır. Bu çalışmada, Hacettepe Üniversitesi Hastanesi Klinik Patoloji Laboratuvar ı nda klinik örneklerden izole edilen 102 mikobakteri susu, ortak bir antijen olan 65 kDa'luk ısı şok proteinini (hsp65) kodlayan genin restriksiyon enzimleri ile kesilmesi prensibine dayanan polimeraz zincir reaksiyonu - restriksiyon enzim analizi (PRA) yöntemi ile tiplendirilmiştir. Suşların 80'i (%78.4) Mycobacterium tuberculosis, 22'si (%21.5) ise tüberküloz dışı mikobakteri olarak tanımlanmıştır. Tüberküloz dışı mikobakterilerin 4'ü (%18.2) M.gordonae I, 3'ü (%13.6) M.chelonae, 2'şer adedi (%9.1) M.gordonae III, M.gordonae IV, M.avium, M.pereghnum ve 1'er adedi (%4.5) M.fortuitum, M.fiavescens, M.malmoense, M.mucogenicum olarak tiplendirilmiştir. Ayrıca literatürde bildirilen tür saptama cetvellerinde yer almayan, farklı restriksiyon paterni gösteren 3 farklı tür belirlenmiştir. Tüberküloz dışı mikobakterilerin izole edildiği hastalardan çoğunun altta yatan başka bir hastalığı mevcuttur. Sonuç olarak, PRA yöntemi klinik örneklerden izole edilen mikobakterilerin tür düzeyinde tanımlanmasında hızlı, pratik ve güvenilir bir yöntem olarak görünmektedir.
Özet (Çeviri)
ABSTRACT Classical laboratory methods based on culture and biochemical tests for the diagnosis of mycobacterial infections, take a long time and frequently fail to produce a precise identification especially for non- tuberculous mycobacteria. Mycobacterial identification to the species level is important for both collecting epidemiologic data and selecting a proper treatment regimen. In this study, a total of 102 mycobacterial strains isolated from clinical specimens in Hacettepe University Hospital Clinical Pathology Laboratories, were evaluated by polymerase chain reaction - restriction fragment length polymorphism analysis (PRA) method, which detects common mycobacterial heat shock protein (hsp65). Eighty of 1 02 strains (78.4% ) were identified as Mycobacterium tuberculosis, and 22 (21.5% ) were identified as non-tuberculous mycobacteria (NTM). Most of the NTM strains have been isolated from patients who have underlying disorders and 4 (18.2%) of them were M.gordonae 1, 3 (13.6%) were M.chelonae, 2 of each (9.1%) were M.gordonae III, M.gordonae IV, M.avium, M.peregrinum and one of each (4.5%) were M.fortuitum, M.flavescens, M.malmoense, M.mucogenicum. Three strains of NTM that show different restriction patterns from earlier algorithms described in literature, could not be identified. As a result, PRA seems to be a rapid, practical and safe method for the species level identification of mycobacteria isolated from clinical specimens.
Benzer Tezler
- Tip 2 diyabetes mellituslu hastalarda anjiyotensinojen m235t, anjiyotensinojen T174M ve anjiyotensin tip 1 reseptör A1166C polimorfizmlerinin diyabetik nefropati gelişimine etkisinin araştırılması
The effects of angiotensinogen M235T, angiotensinogen T174M and angiotensin TYPE 1 receptor A1166C gene polymorphisms on the development of diabetic nephropathy in patients with type 2 diabetes mellitus
FULYA YÜKÇÜ
- Anakardik asidin TNF-α ile indüklenmiş insan safen ven greft endotel kültüründe ICAM-1, vcam-1 ve NF-KB üzerine etkilerinin araştırılması
Investigation of the effect of anacardic acid on icam-1, vcam-1 and NF-KB in human saphenous vein graft endothelial culture induced with TNF-α
BURAK ÖNAL
Doktora
Türkçe
2015
Eczacılık ve Farmakolojiİstanbul ÜniversitesiTıbbi Farmakoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. SİBEL ÖZYAZGAN
- IL–18 geni promotör polimorfizmlerinin alopesi areata ile ilişkisinin araştırılması
Investigation the association of IL–18 gene promoter polymorphisms with alopecia areata
SÜMEYYA DENİZ ÇELİK
Yüksek Lisans
Türkçe
2015
Tıbbi BiyolojiGaziosmanpaşa ÜniversitesiTıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. HACI ÖMER ATEŞ
- Çocukluk çağı obezitesinde anneksin A5 gen polimorfizmlerinin rolü
The role of annexin A5 gene polymorphisms in childhood obesity
EMEL ENSARİ
Yüksek Lisans
Türkçe
2015
Tıbbi BiyolojiGaziosmanpaşa ÜniversitesiTıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. HACI ÖMER ATEŞ
- IL-17, IL-17R, IL-23 VE IL-23R GEN gen polimorfizmlerinin apikal periodontitis hastalarının periapikal lezyonlarında kemik yıkımı oluşması üzerine etkisi
Effect of İL-17, İL-17R, IL-23 and İL-23R gene polymorphisms on the formation of bone destruction at periapical lesions of apical periodontitis patients
ELÇİN TEKİN BULUT
Doktora
Türkçe
2015
Diş Hekimliğiİnönü ÜniversitesiEndodonti Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. NESLİHAN ŞİMŞEK
PROF. DR. SEMA BELLİ