Su labirenti deneylerinde hayvanların hareketlerini tespit eden, aktivitesini izleyen ve analiz eden video izleme yazılımının tasarlanması
Designing video tracking software for detecting and analyzing animal movements in water maze experiments
- Tez No: 893145
- Danışmanlar: DR. ÖĞR. ÜYESİ VEYSEL GÖKHAN BÖCEKÇİ, DR. ÖĞR. ÜYESİ EYÜP EMRE ÜLKÜ
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Elektrik ve Elektronik Mühendisliği, Electrical and Electronics Engineering
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2024
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Marmara Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Elektrik ve Elektronik Mühendisliği Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Elektrik Elektronik Mühendisliği Bilim Dalı
- Sayfa Sayısı: 56
Özet
Morris Su Tankı (MST), Morris tarafından 1981 ve 1984 yıllarında geliştirilen, kemirgenlerde mekânsal öğrenme ve hafızayı incelemek amacıyla kullanılan bir davranış testidir. Bu test, belirli özelliklere sahip su dolu geniş bir tank ve içine yerleştirilmiş sabit bir platformdan oluşur. Hayvanlar platformun konumunu hareketleri ve çevresel ipuçlarına dayanarak keşfederler. MST testinde, fareler veya sıçanlar gizli ya da görünen platformu bularak sudan kaçmayı öğrenirler. Öğrenmeyi veya MST performansını; tankın özellikleri, eğitim yöntemleri, suyun sıcaklığı ve saflığı, hayvanların cinsiyeti, ırkı ve beslenme durumu gibi pek çok değişken etkiler. Deneyler sırasında hayvanların tank içindeki hareketleri kamera ile kaydedilir. Bu sayede doğrudan gözlem sırasında kaçırılabilecek davranışsal detaylar yakalanabilir. Bu çalışmada, MST testinden elde edilen video kayıtları Python yazılımı kullanılarak analiz edilmiştir. Analizin ilk adımında, tankın konumu bir eşikleme algoritması ile belirlenir ve çizdirilir. Fare, tank içindeki hareketleri süresince sürekli izlenir. Daha sonra, fare tank içinde segmentlenir ve her video karesi için fare konumu belirlenir. Fare hareketlerini daha ayrıntılı incelemek için tank dört bölgeye ayrılır. Her bölgedeki fare hareketleri ve geçirdiği süre kaydedilir ve farenin geçtiği yol çizdirilir. Bu bölgelerdeki bilgilere bakılarak, hangi bölgede daha fazla zaman geçirdiği, yol aldığı, hızının durumu gibi incelemelerle fare hareketleri analiz edilir. Bölgelere ayrılan tank, fare davranışlarının detaylı bir şekilde incelenmesini sağlar. Farenin tank içindeki hareketleri, oluşturulan bölgelerde geçirdiği süreler ve yörüngesi detaylı bir şekilde incelenmiştir. Bu analizler, kemirgenlerde mekânsal öğrenme ve hafızanın değerlendirilmesine yönelik önemli bilgiler sunar. Bootstrap yazılımı ile oluşturulmuş arayüz kullanılarak resim, video analizi ve tablo çıktı görünümlerine internet üzerinden erişilebilir.
Özet (Çeviri)
Morris Water Tank (MST) is a behavioral test developed by Morris between 1981 and 1984 and used to examine spatial learning and memory in rodents. This test consists of a large tank filled with water of certain specifications and a fixed platform placed inside it. Animals discover the position of the platform based on their movements and environmental cues. In the MST test, mice or rats learn to escape from water by finding a hidden or visible platform. Learning or MST performance; Many variables affect it, such as the characteristics of the tank, training methods, temperature and purity of the water, gender, breed and nutritional status of the animals. During the experiments, the movements of the animals in the tank are recorded with a camera. In this way, behavioral details that may be missed during direct observation can be captured. In this study, video recordings obtained from the MST test were analyzed using Python software. In the first step of the analysis, the position of the tank is determined and plotted by a thresholding algorithm. The mouse is constantly monitored throughout its movements in the tank. Next, the mouse is segmented within the tank and the mouse position is determined for each video frame. To study mouse movements in more detail, the tank is divided into four zones. Mouse movements and time spent in each region are recorded and the path the mouse passes is plotted. By looking at the information in these regions, mouse movements are analyzed by examining in which region it spends more time, where it travels, and its speed. The tank, divided into zones, allows mouse behavior to be examined in detail. The mouse's movements in the tank, the time it spent in the created areas and its trajectory were examined in detail. These analyzes provide important information for the assessment of spatial learning and memory in rodents. Image, video analysis and tabular output views can be accessed over the internet using the interface created with Bootstrap software.
Benzer Tezler
- The role of ventral pallidal gabaergic neurons in affective and cognitive processes
Ventral pallidal gabaerjik hücrelerin afektif ve bilişsel süreçlerdeki rolü
CEMAL AKMEŞE
Yüksek Lisans
Türkçe
2022
PsikolojiBoğaziçi ÜniversitesiBilişsel Bilim Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. GÜNEŞ ÜNAL
DOÇ. DR. LUCAS THORPE
- Safra kanalı bağlama yöntemi ile karaciğer fibrozu oluşturulan sıçanlarda Cynara scolymus bitki ekstrelerinin olası koruyucu etkilerinin incelenmesi
Examination of the possible protective effects of Cynara scolymus plant extract on rats with liver fibrosis induced by the duct ligation method
ÖZKAN KAM
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2024
Eczacılık ve Farmakolojiİstanbul Medeniyet ÜniversitesiTıbbi Farmakoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. BERNA TERZİOĞLU BEBİTOĞLU
- Gebelik ve laktasyon döneminde verilen omega 3 desteğinin rat yavrulardaki kognitif fonksiyonlara etkisi
Effect of omega 3 supplementation during pregnancy and lactation on cognitive functions in rat offspring
HANDE NUR ONUR ÖZTÜRK
Doktora
Türkçe
2024
Beslenme ve DiyetetikBaşkent ÜniversitesiBeslenme ve Diyetetik Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. PERİM FATMA TÜRKER
- Sıçanlarda midazolamın nörokognitif fonksiyonlar üzerindeki olumsuz etkisinin melatonin ön tedavisi ile önlenmesi
Prevention of the negative effect of midazolam on neurocognitive functions in rats by melatonin pre-treatment
İBRAHİM KUZU
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2023
Anestezi ve ReanimasyonSağlık BakanlığıAnesteziyoloji ve Reanimasyon Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. HÜSEYİN ALP ALPTEKİN
- Lipopolisakkarit ile indüklenen sıçan nöroinflamasyon modelinde hidrojen sülfür tedavisinin etkilerinin araştırılması
Investigating the effects of hydrogen sulfide treatment on a lipopolysaccharide-induced rat model of neuroinflammation
AYŞE KÜBRA KİBAR GÜZİN
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2024
Eczacılık ve FarmakolojiGazi ÜniversitesiTıbbi Farmakoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. GÖKÇE SEVİM ÖZTÜRK FİNCAN
DOÇ. DR. ERGİN DİLEKÖZ