Aydın ilinde Fusarium oxysporum f. sp. vasinfectum'un pamukta çökerten patojeni olarak rolü ve yaygınlığı
The role and prevalence of Fusarium oxysporum f.sp. vasinfectum as a damping-off pathogen in cotton in Aydın province
- Tez No: 895885
- Danışmanlar: PROF. DR. ÖMER ERİNCİK
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Ziraat, Agriculture
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2024
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Aydın Adnan Menderes Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Bitki Koruma Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Bitki Koruma Bilim Dalı
- Sayfa Sayısı: 75
Özet
Amaç: Bu çalışmada Aydın pamuk ekim alanlarında çökerten hastalığı etmenlerinden birisi olan Fusarium oxysporum f. sp. vasinfectum'un fide dönemindeki rolü ve bulunma sıklığının ilçe bazında belirlenmesi amaçlanmıştır. Materyal ve yöntem: Hastalık etmenlerinin elde edilmesi amacıyla 2022 ve 2023 yıllarında Aydın ili Koçarlı, İncirliova, Germencik, Nazilli, Köşk ve Söke ilçeleri pamuk ekim alanlarından çökerten belirtisi gösteren hastalıklı fide örneklemeleri yapılmıştır. Elde edilen örneklerin izolasyon işlemleri gerçekleştirilerek izolatlar saflaştırılmış ve tek spor izolasyonları yapılmıştır. İzolatların öncelikle cins düzeyinde teşhisi yapılmış ve Fusarium cinsi içerisinde yer alan izolatlardan F. oxysporum f. sp. vasinfectum olanlar morfolojik olarak tanılanmıştır. Kesin tanılamanın sağlanması amacıyla izolatların DNA izolasyonları yapılarak PCR'da moleküler olarak teşhisleri yapılmıştır. Kesin tanısı yapılan F. oxysporum f. sp. vasinfectum izolatlarının patojen olup olmadığının belirlenmesi amacıyla rastgele seçilen temsili izolatlar ile 'Fiona' ticari pamuk çeşidinde patojenisite testleri yürütülmüştür. Bulgular: Aydın ili Koçarlı, İncirliova, Germencik, Nazilli, Köşk ve Söke ilçelerinden 2022 yılında 36 ekim alanından 218 adet izolat, 2023 yılında ise 37 ekim alanından 322 adet izolat elde edilmiştir. 2022 yılında elde edilen izolatlardan Aydın ili genelinde 40 Rhizoctonia spp., 3 Aspergillus spp., 1 Macrophomina spp., 2 Alternaria spp. ve 191 adet Fusarium spp.; 2023 yılında elde edilen izolatlardan ise 71 Rhizoctonia spp., 25 Alternaria spp., 217 Fusarium spp. tanılanmıştır. F. oxysporum f. sp. vasinfectum'un kesin tanısı için 2022 sezonundan elde edilen 191 Fusarium spp. izolatından 135'i için moleküler çalışmalar yürütülmüş ve 111'inden pozitif sonuç elde edilmiştir; 2023 sezonundan elde edilen 227 Fusarium spp. izolatından rastgele seçilen 50 adeti ile yürütülen çalışmalardan ise 49 izolat pozitif bulunmuştur. Patojenisite testine tabi tutulan 45 F. oxysporum f. sp. vasinfectum izolatından biri hariç hepsi patojenik bulunmuştur. İzolatlara ait hastalık şiddeti değerleri %0,00 ile %100 arasında değişkenlik göstermiştir. Sonuç: Elde edilen bulgulara göre Aydın ili pamuk alanlarında çökertene neden olan ana patojenin Fusarium spp. olduğu saptanmıştır. Ayrıca çalışmanın ana konusu olan F. oxysporum f. sp. vasinfectum'un pamukta fide kayıplarındaki rolünün oldukça önemli olduğu ortaya konulmuştur. Pamuk tarlalarında yapılan surveyler doğrultusunda ilçe ve arazilere göre değişmekle beraber Aydın ili pamuk ekim alanlarında çökerten dolayısıyla meydana gelen fide kayıplarının %3.62 olduğu saptanmıştır. Yapılan patojenite testlerinde de elde edilen F. oxysporum f. sp. vasinfectum izolatlarının pamukta 'Fiona' çeşidinde patojenik karaktere sahip oldukları belirlenmiştir.
Özet (Çeviri)
Objective: This study aimed to determine the role of Fusarium oxysporum f. sp. vasinfectum, one of the agents of damping-off disease, during the seedling stage of cotton and its prevalance in the cotton growing areas on a district basis in Aydın Province. Material and method: In order to collect disease agents, diseased seedling samples showing damping-off symptoms were taken from cotton fields in Koçarlı, İncirliova, Germencik, Nazilli, Köşk and Söke districts of Aydın Province in 2022 and 2023. Isolates were recovered from the collected samples and were purified. Single spore isolations were made from the purified isolates. First of all, the isolates were identified at the genus level and among the isolates in the Fusarium genus, F. oxysporum f. sp. vasinfectum were morphologically identified. In order to verify identification, DNA isolation of the isolates was done and molecular identification was performade by PCR. In order to determine whether F. oxysporum f. sp. vasinfectum isolates were pathogenic, pathogenicity tests were conducted on the commercial cotton variety 'Fiona' with randomly selected representative isolates. Results: In 2022, 218 isolates were obtained from 36 fields in Koçarlı, İncirliova, Germencik, Nazilli, Köşk and Söke districts of Aydın province, and 322 isolates were obtained from 37 fields in 2023. Among the isolates obtained in 2022, 40 Rhizoctonia spp., 3 Aspergillus spp., 1 Macrophomina spp., 2 Alternaria spp. and 191 Fusarium spp. were identified in Aydın province; and among the isolates obtained in 2023, 71 Rhizoctonia spp., 25 Alternaria spp., 217 Fusarium spp. were identified. For the verification of the diagnosis of F. oxysporum f. sp. vasinfectum, molecular studies were conducted for 135 of 191 Fusarium spp. isolates obtained from the 2022 growing season and positive results were obtained from 111; 49 isolates were found positive among 50 which were randomly selected from 227 Fusarium spp. isolates collected from the 2023 season. Among 45 F. oxysporum f. sp. vasinfectum isolates subjected to pathogenicity, all but except one were found to be pathogenic. The disease severity values of the isolates varied between 0,00% and 100%. Conclusion: According to the results, the main pathogen causing damping-off in cotton fields of Aydın province was Fusarium spp. In addition, it was revealed that the role of F. oxysporum f. sp. vasinfectum, which is main subject of this study, in seedling death in cotton was found to be significant. According to field surveys, the mean of the seedling losses due to damping-off in cotton fields of Aydın province were 3.62%, but it varied according to districts and fields. In the pathogenicity tests, F. oxysporum f. sp. vasinfectum isolates had pathogenic characteristics on cotton variety 'Fiona'.
Benzer Tezler
- Aydın ilinde karpuz fusarium solgunluğu hastalığının yaygınlık ve yoğunluğu, etmeni Fusarium oxysporum f. sp. niveum (Fon)'un ırkları, vejetatif uyum grupları ve bazı karpuz çeşitlerinin etmene karşı reaksiyonları
Prevalence and incidence of fusarium wilt of watermelon, races and vegetative compatibility groups of the causal agent, Fusarium oxysporum f. sp. niveum (Fon), in the Aydin province and reactions of some watermelon cultivars to fon races
BİRSEN GEÇİOĞLU ERİNCİK
Doktora
Türkçe
2015
ZiraatAdnan Menderes ÜniversitesiBitki Koruma Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MUSTAFA TİMUR DÖKEN
- Antalya ili karanfil seralarında toprak kökenli fungal hastalık etmenlerinin belirlenmesi
Determination of soil-borne fungal disease agent of carnation greenhouses in antalya province
AYDIN ATAKAN
Yüksek Lisans
Türkçe
2014
ZiraatSüleyman Demirel ÜniversitesiBitki Koruma Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. HÜLYA ÖZGÖNEN ÖZKAYA
- Çilek fidelerinde toprak kaynaklı fungal etmenlerin saptanması üzerinde araştırmalar
Studies on the determination of soil-borne fungal pathogens in strawberry seedlings
HAVVA DİNLER
Doktora
Türkçe
2014
ZiraatAdnan Menderes ÜniversitesiBitki Koruma Ana Bilim Dalı
PROF. DR. SEHER BENLİOĞLU
PROF. DR. KEMAL BENLİOĞLU
- Aydın İli domates ekim alanlarında görülen toprak kaynaklı fungal hastalık etmenleri, yaygınlık durumu ve bazı domates çeşitlerinin bu etmenlere karşı reaksiyonlarının belirlenmesi üzerinde çalışmalar
Başlık çevirisi yok
AYHAN YILDIZ
Yüksek Lisans
Türkçe
1999
ZiraatAdnan Menderes ÜniversitesiFitopatoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. M. TİMUR DÖKEN
- Aydın ilinden izole edilen Trichoderma spp. izolatlarının fide kök çürüklüğü hastalığına ve bitki gelişimine etkileri
The effects of Trichoderma spp. isolates from aydin province on seedling root rot disease and plant growth
ALP ER TUNGA DİKMEN
Yüksek Lisans
Türkçe
2024
ZiraatAydın Adnan Menderes ÜniversitesiBitki Koruma Ana Bilim Dalı
PROF. DR. AYHAN YILDIZ