Geri Dön

Hepatosellüler karsinomada peroksizom ilişkili genlerinekspresyon profillerinin incelenmesi

Investigation of the expression profiles of peroxisomerelated genes in hepatocelllular carcinoma

  1. Tez No: 896843
  2. Yazar: SEMA ŞABANÇELEBİ
  3. Danışmanlar: PROF. DR. MATEM TUNÇDEMİR, DR. ÖĞR. ÜYESİ FATMA KÜBRA TOMBULTÜRK
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Tıbbi Biyoloji, Medical Biology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2024
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: İstanbul Üniversitesi-Cerrahpaşa
  10. Enstitü: Lisansüstü Eğitim Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Tıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 45

Özet

Hepatosellüler karsinom (HCC), karaciğer kanserinin en yaygın türüdür ve dünya çapında kanserden kaynaklanan ölümlerin önde gelen nedenlerinden biridir. Hücre içindeki metabolik aktivitelerde gerçekleşen değişiklikler kanserin en karakterize özelliklerindendir. Peroksizomlar, kanser hücresi büyümesini ve hayatta kalmasını etkileyen organellerdir. Bazı kanser hücreleri, bir enerji kaynağı olarak peroksizomal lipid yıkımına güvenir. Ayrıca, peroksizomal lipid sentezi ve redoks dengesi, genellikle besin ve oksijen eksikliği olan tümör mikroçevresinde kanser hücresinin hayatta kalmasını destekleyebilir. Bu bilgiler doğrultusunda peroksizom biyogenezi ve metabolizmasının HCC patogenezinde rol oynayabileceği muhtemeldir. Bu sebeple çalışmada; kanser ile bu denli önemli ilişkisi olan peroksizom ilişkili genlerin hepatosellüler karsinomda ekspresyon profilleri incelenerek peroksizom yolağının hepatosellüler karsinom ile olan ilişkisinin araştırılması amaçlanmıştır. Bu çalışmada, HCC hücre hattı (HEPG2) ve sağlıklı kontrol hücre hattı (HUVEC) çalışmalarından elde edilen RNA örnekleri kullanılmıştır. cDNA sentezi ardından, RT-PCR yöntemi ile gen ekspresyon düzeyleri belirlenmiştir. ACTB geni, referans gen olarak kullanılmıştır. Gen ekspresyon seviyeleri Ct (threshold cycle) değerleri ile belirlenmiş ve 2^- ΔΔCt yöntemi kullanılarak analiz edilmiştir.PEX ve DHRS genlerinin ACTB genine kıyasla ekspresyon profilleri incelenmesi amacıyla 2^-ΔΔCt yöntemi kullanılarak yapılan analiz sonucunda; hem PEX16 geninin hem de DHRS4 geninin HCC'de ekspresyonu, kontrol grubuna kıyasla anlamlı derecede artmıştır. Bu çalışma, HCC'de peroksizom ilişkili PEX16 ve DHRS4 genlerinin ekspresyon düzeylerinin önemli ölçüde artmış olduğunu göstermektedir. PEX16 ve DHRS4 genlerinin ekspresyon profilleri, HCC patogenezinde önemli bir rol oynayabilir ve bu genler, HCC'nin biyolojik davranışını anlamak ve potansiyel terapötik hedefler geliştirmek için gelecekteki çalışmalarda araştırılması gereken adaylar olarak değerlendirilebilir.

Özet (Çeviri)

Hepatocellular carcinoma (HCC) is the most common type of liver cancer and a leading cause of cancer-related deaths worldwide. Changes in metabolic activities within cells are among the characterized features of cancer. Peroxisomes are organelles that affect cancer cell growth and survival. Some cancer cells rely on peroxisomal lipid breakdown as an energy source. Additionally, peroxisomal lipid synthesis and redox balance can support cancer cell survival in tumor microenvironments typically lacking nutrients and oxygen. Based on this information, it is likely that peroxisome biogenesis and metabolism may play a role in HCC pathogenesis. Therefore, this study aimed to investigate the relationship between peroxisome-associated genes and HCC by examining expression profiles of these genes in hepatocellular carcinoma. In this study, RNA samples obtained from HCC cell line (HEPG2) and healthy control cell line (HUVEC) studies were used. Following cDNA synthesis, gene expression levels were determined using RT-PCR. The ACTB gene was used as a reference gene. Gene expression levels were determined using Ct (threshold cycle) values and analyzed using the 2^-ΔΔCt method.The analysis using the 2^-ΔΔCt method aimed to examine the expression profiles of PEX and DHRS genes compared to the ACTB gene. As a result, both PEX16 and DHRS4 genes showed significantly increased expression in HCC compared to the control group. This study demonstrates that the expression levels of peroxisome-associated genes PEX16 and DHRS4 are significantly elevated in HCC. The expression profiles of PEX16 and DHRS4 genes may play an important role in HCC pathogenesis and could be considered as candidates to be investigated in future studies to understand the biological behavior of HCC and develop potential therapeutic targets.

Benzer Tezler

  1. Hepatosellüler karsinomada plexin C1'in etkileşim partnerlerinin belirlenmesi

    Identification of plexin C1 interaction partners in hepatocellular carcinoma

    MELİKE BİNNUR BAHÇEKAPILI

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2023

    BiyolojiGebze Teknik Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. TAMER YAĞCI

  2. Hepatosellüler karsinomada üsnik asit ve sorafenib'in kombin tedavi olarak anti-tümöral etkilerinin araştırılması

    Investigation of the anti-tumoral effects of usnic acid and sorafenib as combination therapy on hepatocelluler carcinoma

    BESTE YURDACAN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2017

    Moleküler TıpUludağ Üniversitesi

    Tıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ÜNAL EGELİ

  3. Hepatosellüler karsinomada glukoz metabolizması ve c-met yolağının etkileşiminin irdelenmesi

    Investigating the crosstalk of glucose metabolism and c-met pathway in hepatocellular carcinoma

    YELİZ YILMAZ

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2020

    Tıbbi BiyolojiDokuz Eylül Üniversitesi

    Tıbbi Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. SAFİYE NEŞE ATABEY

    PROF. DR. SULTAN CİNGÖZ

  4. Hepatosellüler karsinomada kemik morfojenik protein 9 (BMP9)'un siRNA ile baskılanarak fonksiyonel analizi

    Functional analysis of siRNA-mediated knock-down of bone morphogenetic protein 9 (BMP9) in hepatocellular carcinoma

    TUĞÇE YAŞAR

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2015

    GenetikTurgut Özal Üniversitesi

    Tıbbi Genetik Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. ÖMER FARUK HATİPOĞLU

  5. Hepatosellüler karsinomada SIP1'in protein etkileşimlerinin ve ifadesini düzenlediği genlerin tanımlanması

    Defining the protein interactions of and regulation of target genes by SIP1 in hepatocellular carcinoma

    PELİN BALÇIK ERÇİN

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2018

    BiyolojiGebze Teknik Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. TAMER YAĞCI