Hepatosellüler karsinomada peroksizom ilişkili genlerinekspresyon profillerinin incelenmesi
Investigation of the expression profiles of peroxisomerelated genes in hepatocelllular carcinoma
- Tez No: 896843
- Danışmanlar: PROF. DR. MATEM TUNÇDEMİR, DR. ÖĞR. ÜYESİ FATMA KÜBRA TOMBULTÜRK
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Tıbbi Biyoloji, Medical Biology
- Anahtar Kelimeler: Karsinoma-hepatoselüler, Carcinoma-hepatocellular
- Yıl: 2024
- Dil: Türkçe
- Üniversite: İstanbul Üniversitesi-Cerrahpaşa
- Enstitü: Lisansüstü Eğitim Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Tıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Hepatosellüler karsinom (HCC), karaciğer kanserinin en yaygın türüdür ve dünya çapında kanserden kaynaklanan ölümlerin önde gelen nedenlerinden biridir. Hücre içindeki metabolik aktivitelerde gerçekleşen değişiklikler kanserin en karakterize özelliklerindendir. Peroksizomlar, kanser hücresi büyümesini ve hayatta kalmasını etkileyen organellerdir. Bazı kanser hücreleri, bir enerji kaynağı olarak peroksizomal lipid yıkımına güvenir. Ayrıca, peroksizomal lipid sentezi ve redoks dengesi, genellikle besin ve oksijen eksikliği olan tümör mikroçevresinde kanser hücresinin hayatta kalmasını destekleyebilir. Bu bilgiler doğrultusunda peroksizom biyogenezi ve metabolizmasının HCC patogenezinde rol oynayabileceği muhtemeldir. Bu sebeple çalışmada; kanser ile bu denli önemli ilişkisi olan peroksizom ilişkili genlerin hepatosellüler karsinomda ekspresyon profilleri incelenerek peroksizom yolağının hepatosellüler karsinom ile olan ilişkisinin araştırılması amaçlanmıştır. Bu çalışmada, HCC hücre hattı (HEPG2) ve sağlıklı kontrol hücre hattı (HUVEC) çalışmalarından elde edilen RNA örnekleri kullanılmıştır. cDNA sentezi ardından, RT-PCR yöntemi ile gen ekspresyon düzeyleri belirlenmiştir. ACTB geni, referans gen olarak kullanılmıştır. Gen ekspresyon seviyeleri Ct (threshold cycle) değerleri ile belirlenmiş ve 2^- ΔΔCt yöntemi kullanılarak analiz edilmiştir.PEX ve DHRS genlerinin ACTB genine kıyasla ekspresyon profilleri incelenmesi amacıyla 2^-ΔΔCt yöntemi kullanılarak yapılan analiz sonucunda; hem PEX16 geninin hem de DHRS4 geninin HCC'de ekspresyonu, kontrol grubuna kıyasla anlamlı derecede artmıştır. Bu çalışma, HCC'de peroksizom ilişkili PEX16 ve DHRS4 genlerinin ekspresyon düzeylerinin önemli ölçüde artmış olduğunu göstermektedir. PEX16 ve DHRS4 genlerinin ekspresyon profilleri, HCC patogenezinde önemli bir rol oynayabilir ve bu genler, HCC'nin biyolojik davranışını anlamak ve potansiyel terapötik hedefler geliştirmek için gelecekteki çalışmalarda araştırılması gereken adaylar olarak değerlendirilebilir.
Özet (Çeviri)
Hepatocellular carcinoma (HCC) is the most common type of liver cancer and a leading cause of cancer-related deaths worldwide. Changes in metabolic activities within cells are among the characterized features of cancer. Peroxisomes are organelles that affect cancer cell growth and survival. Some cancer cells rely on peroxisomal lipid breakdown as an energy source. Additionally, peroxisomal lipid synthesis and redox balance can support cancer cell survival in tumor microenvironments typically lacking nutrients and oxygen. Based on this information, it is likely that peroxisome biogenesis and metabolism may play a role in HCC pathogenesis. Therefore, this study aimed to investigate the relationship between peroxisome-associated genes and HCC by examining expression profiles of these genes in hepatocellular carcinoma. In this study, RNA samples obtained from HCC cell line (HEPG2) and healthy control cell line (HUVEC) studies were used. Following cDNA synthesis, gene expression levels were determined using RT-PCR. The ACTB gene was used as a reference gene. Gene expression levels were determined using Ct (threshold cycle) values and analyzed using the 2^-ΔΔCt method.The analysis using the 2^-ΔΔCt method aimed to examine the expression profiles of PEX and DHRS genes compared to the ACTB gene. As a result, both PEX16 and DHRS4 genes showed significantly increased expression in HCC compared to the control group. This study demonstrates that the expression levels of peroxisome-associated genes PEX16 and DHRS4 are significantly elevated in HCC. The expression profiles of PEX16 and DHRS4 genes may play an important role in HCC pathogenesis and could be considered as candidates to be investigated in future studies to understand the biological behavior of HCC and develop potential therapeutic targets.
Benzer Tezler
- Hepatosellüler karsinom prognozunun belirlenmesinde epigenetik faktörlerin ileri biyoinformatik yöntemlerle analizi
Analysis of epigenetic factors determining the hepatocellular carcinoma prognosis with advanced bioinformatics methods
AHMET SAMİ AKBULUT
Yüksek Lisans
Türkçe
2023
Biyoistatistikİnönü ÜniversitesiBiyoistatistik ve Tıbbi Bilişim Ana Bilim Dalı
PROF. DR. CEMİL ÇOLAK
- Endokrin bozucu kimyasal maddelere kombine maruziyetin etkilerinin HEPG2 hücre hattında değerlendirilmesi
Evaluation of the effects of combined exposure to endocrine disruptor chemical substances in HEPG2 cell line
KÜBRA GİZEM ÖZKEMAHLI
Doktora
Türkçe
2018
Eczacılık ve FarmakolojiHacettepe ÜniversitesiFarmasötik Toksikoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. BELMA GÜMÜŞEL
- Hepatosellüler karsinomada FAS, FASL, TGF-beta1'in değerlendirilmesi: immünohistokimyasal çalışma
Assessment of FAS, FASL, TGF-beta 1'in hepatocellular carcinoma
KUDDUSİ PANCAROĞLU
- Hepatosellüler karsinomada p53 kodon72 ve MDM2 SNP309 polimorfizimlerinin sıklığı ve bu polimorfizmlerin tümöre ait karakteristiklerle karşılaştırılması
P53 codon72 and MDM2 SNP309 polymorphisms in hepatocellular carcinoma and comparison of them with tumor characteristics
AHMET TANER SÜMBÜL
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2008
GastroenterolojiÇukurova Üniversitesiİç Hastalıkları Ana Bilim Dalı
PROF. HİKMET AKKIZ
- Hepatosellüler karsinomada Glypican-3 tümör belirtecinin tanısal değeri ve prognostik faktörlerle ilişkisi: Alfa Fetoprotein ile karşılaştırılması
Value of Glypican-3 as a tumor marker and its correlatıon with prognostıc factors in patients with hepatocellular carcinoma and comparison with Alpha Fetoprotein
HARUN ERDAL
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2010
GastroenterolojiAnkara Üniversitesiİç Hastalıkları Ana Bilim Dalı
PROF. DR. HASAN ÖZKAN