Geri Dön

Characterization of SOX7 transcription factor that is located in recurrently deleted 8p23.1 locus on development and drug resistance of multiple myeloma through molecular, epigenomic, and transcriptomic approaches

Sıklıkla delesyona uğrayan 8p23.1 lokusunda yer alan SOX7 transkripsiyon faktörünün multipl miyelom gelişimi ve tedavi direncindeki rolünün moleküler, epigenomik, ve transkriptomik yöntemlerle karakterizasyonu

  1. Tez No: 897804
  2. Yazar: ARDA CEYLAN
  3. Danışmanlar: DOÇ. DR. CAN KÜÇÜK
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Genetik, Hematoloji, Onkoloji, Genetics, Hematology, Oncology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2024
  8. Dil: İngilizce
  9. Üniversite: Dokuz Eylül Üniversitesi
  10. Enstitü: İzmir Uluslararası Biyotıp ve Genom Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 65

Özet

Multipl miyelom (MM), plazma hücrelerinin anormal çoğalmasından kaynaklanan yaygın bir hematolojik kanserdir. Şifası olmamakla birlikte, nüks hastalarda ilaç direnci görülmektedir. Bu bağlamda, MM gelişimini ve tedavi direncinin ardındaki mekanizmaları araştırmak önem taşımaktadır. SOX7, sıklıkla delesyona uğrayan 8p23.1 lokusunda bulunan bir tümör baskılayıcı gen adayı olup, literatürde çeşitli kanser tipleri için tümör baskılayıcı özellikleri gösterilmiştir. Ancak daha önce multipl miyelomda incelenmemiştir. Bu çalışmada, qPCR ve bisülfit dizileme analizleri ile SOX7'nin MM hücre hatlarında delesyon ve/veya promotör hipermetilasyonu yoluyla sessizleştiğini gösterdik. Western blot ile SOX7'nin MM hücrelerinde protein düzeyinde ifade edilmediği gözlemlendi. Harici SOX7 ifadesinin MM hücrelerinde G1 fazında hücre döngüsü tutuklanmasına yol açabileceğini ve apoptozu tetikleyebileceğini gözlemledik. Panobinostat muamelesinin SOX7 mRNA seviyelerinde artışa neden olduğu, apoptozu tetiklediği ve MM hücre hatlarında G1 veya S fazında hücre döngüsü tutuklanmasına neden olduğu gözlemlendi. Ancak, apoptoz seviyelerinde anlamlı bir artış olmadığından, harici SOX7 ifadesinin bortezomib duyarlılığını arttırmamaktadır. Harici SOX7 ifadesi sonrası farklı ifade edilen genleri ve SOX7 hedef genlerini bulmak için tüm transkriptom dizileme ve kromatin immünopresipitasyon dizileme deneylerini gerçekleştirdik. Sonuç olarak, bulgularımız doğrultusunda SOX7'yi MM'de bir tümör baskılayıcı gen olarak karakterize ettik; ve MM'de prognostik bir biyobelirteç veya terapötik hedef olma potansiyelini gösterdik.

Özet (Çeviri)

Multiple myeloma (MM) is a common hematological cancer, originating from abnormal proliferation of plasma cells. Current treatments do not result in recovery; and cancer relapses with drug resistance. Hence, it is crucial to investigate the mechanism behind MM development and therapy resistance. SOX7 is a candidate tumor suppressor gene in recurrently deleted 8p23.1 locus. Its tumor suppressor properties were shown in various cancer types. However, it was not studied in multiple myeloma before. In this study, qPCR and bisulfite sequencing analyses showed that SOX7 is silenced in MM cell lines via deletion and/or promoter hypermethylation. Western blot showed that SOX7 is not expressed in MM cell lines. We found that ectopic expression of SOX7 can result in cell cycle arrest in G1 phase and trigger apoptosis in MM cells. Panobinostat treatment resulted in increase in SOX7 mRNA levels, triggered apoptosis and caused cell cycle arrest in G1 or S phase in MM cell lines. However, we did not find any additive or synergistic effect between ectopic SOX7 expression and bortezomib as there was no significant increase in apoptosis levels. We performed whole transcriptome sequencing and chromatin immunoprecipitation sequencing to identify differentially expressed genes and SOX7 target genes respectively, when SOX7 was ectopically expressed. In conclusion, we characterized SOX7 in MM as a tumor suppressor gene and showed its potential as a therapeutic target in MM.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    80242

    Vankomisin içeren Poli(D,L-laktik-ko-glikolik asit) implantların karakterizasyonu ve in vitro-in vivo salım davranışlarının incelenmesi

    Characterization of vancomycin containing poly(d,l-lactide-co-glycolide) implants and investigation of their in vitro-in vivo release behaviour

    YILDIZ ÖZALP

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    1997

    Eczacılık ve FarmakolojiAnkara Üniversitesi

    Farmasötik Teknoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. NURTEN ÖZDEMİR

  2. Tez No

    82603

    Characterization of arylamine N-acetyltransferase in tissues from human breast cancer

    İnsan kanserli meme dokusunda arilamin N-asetiltransferaz enziminin karakterizasyonu

    YAŞASIN SENEM GEYLAN

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    1999

    BiyokimyaOrta Doğu Teknik Üniversitesi

    Biyokimya Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. TÜLİN GÜRAY

  3. Tez No

    82785

    Characterization of Aspergillus oryzae transformed with a plasmid carrying alfa-amylase gene

    (Alfa)-amilaz geni taşıyan bir plazmid ile transforme edilmiş aspergillus aryzae'nin karakterizasyonu

    GÖKHAN TOLUN

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    1999

    BiyoteknolojiOrta Doğu Teknik Üniversitesi

    Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. UFUK GÜNDÜZ

  4. Tez No

    82786

    Characterization of membrane phospholipids and proteins of some wheat (Triticum aestivum l.) varieties under salt and drougth stress conditions

    Buğday (Triticum aestivum l.) bazı çeşitlerinin tuz ve kuraklık stresi altında hücre zarı fosfolipitlerinin ve proteinlerinin tanımlanması

    E.SEMA TORAMAN

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    1999

    BiyolojiOrta Doğu Teknik Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. MERAL YÜCEL

  5. Tez No

    82833

    Characterization of the Küçük Menderes River basin aquifer system

    Küçük Menderes Nehri Havzası akifer sisteminin karakterizasyonu

    KORAY KAMİL YILMAZ

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    1999

    Jeoloji MühendisliğiOrta Doğu Teknik Üniversitesi

    Jeoloji Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. HASAN YAZICIGİL

Geri Dön