Molecular detection of Trec gene in biofilm producing multidrug resistant Klebsiella pneumoniae in Iraqi patients
Iraklı hastalarda biyofilm oluşturan çoklu ilaca dirençli klebsiella pneumoniae'da Trec geninin moleküler tespiti
- Tez No: 898539
- Danışmanlar: DR. ÖĞR. ÜYESİ SERDAL TARHANE, DR. ÖĞR. ÜYESİ MARWA HAMEED ALKHAFAJI
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoloji, Biology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2024
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Çankırı Karatekin Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 58
Özet
Biyofilm oluşumu, lokal Klebsiella pneumoniae izolatları arasında antibiyotik direncindeki artış nedeniyle persistan enfeksiyonlarla ilişkili önemli bir virülans faktörüdür. Bu çalışma, bir kontrol stratejisi önermek amacıyla treC geninin varlığını tespit ederek çoklu ilaca dirençli (MDR) Klebsiella izolatlarının hem fenotipik hem de genetik düzeyde biyofilm oluşturma yeteneğini tespit etmeyi amaçlamıştır. Bu amaçla idrar yolu enfeksiyonu nedeniyle hastanede yatan hastalardan toplam iki yüz klinik örnek toplandı. Toplanan tüm örnekler laboratuvara transfer edildi ve ardından K. pneumoniae izolasyonu için seçici kültür ortamlarında kültüre alındı. Sonuçlar 36 K. pneumoniae izolatının izole edildiğini ortaya koydu. On beş K. pneumoniae izolatının (%41,66) çoklu ilaç direnci gösterdiği belirlendi. Bu izolatların biyofilm oluşturma kabiliyetini ölçmek amacıyla kongo red agar ve mikrotitre plak yöntemleri kullanılaraki farklı teste tabi tutuldu. Kongo red testi sonuçları 12/15 (%80) izolatın pozitif sonuç verdiğini gösterirken, mikrotitre plak testi tüm MDR izolatlarının 15/15 (%100) biyofilm üreticisi olduğunu gösterdi. Moleküler tespit için bakteri izolatlarından genomik DNA izole edildi ve izole edilen DNA, Qubit 4.0 testi kullanılarak kalifiye edildi. TreC geni varlığının moleküler tanısı, belirlenmiş bir dizi primer kullanılarak gerçekleştirildi. Elde edilen sonuçlar neticesinde tüm izolatların treC geni taşıdığı gözlemlendi.
Özet (Çeviri)
Biofilm formation is a significant viulence factor associated to persistant infections due to the increase in antibiotic resistance among local Klebsiella pneumoniae isolates. This study aimed to detect the ability of multidrug resistant (MDR) Klebsiella isolates to form biofilm both on the phenotypic and genetic level by detecting the presence of treC gene, in order to propose a control strategy. A total of two hundred clinical samples were collected from hospitalized patients sufferring from urinary tract infections. All the collected samples were transferred immediately to the laboratoey and then cultured on selective culture media to isolate K. pneumoniae. The results revealed the isolation of 36 K. pneumoniae isolates. Fifteen K. pneumoniae isolates (41.66%) were MDR. Theses MDR K. pneumoniae isolates were tested using two assays congo red agar and microtiter plate assay to findout MDR K. pneumoniae biofilm production ability. The results of congo red assay showed that 12/15 (80%) isolates gave positive results while microtiter plate assay showed that all the MDR isolates 15/15 (100%) were biofilm producers. Genomic DNA was extracted from the bacterial isolates, and the extracted DNA was qualified using Qubit 4.0 assay. Molecular detection of treC gene was performed using a set of primers which were designated for this study. As a result of the results obtained, it was observed that all isolates carried the treC gene.
Benzer Tezler
- Gastroenteritli hastaların dışkı örneklerinde human bocavirüs(HBOV)'ün moleküler yöntemle araştırılması
Molecular detecti̇on of human bocavi̇rus(HBOV) i̇n stool samples i̇n pati̇ents wi̇th acute gastroenteri̇ti̇s
FADİME KAHYAOĞLU
Yüksek Lisans
Türkçe
2015
MikrobiyolojiAdnan Menderes ÜniversitesiViroloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. SEVİN KIRDAR
- Bağdat hastalarında caga ve vaca virülans ve gyra antibiyotik direnç genlerinin varlığına dayalı olarak helicobacter pylori'nin moleküler tespiti
Molecular detection of helicobacter pylori based on the presence of caga and vaca virulence and gyra antibiotic resistance genes in Baghdad patients
NIBRAS SARHAN KHUDHAIR KHUDHAIR
Doktora
Türkçe
2024
BiyolojiÇankırı Karatekin ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. TARKAN YORULMAZ
- Irak'ın Thi-Qar eyaletindeki hastalardan izole edilen escherichia coli'de shigatoxin geninin moleküler tespiti
Molecular detection of shigatoxin gene in escherichia coliisolated from patients in Thi-Qar province, Iraq
TALAL HASAN JABER ALFKAWI
Doktora
Türkçe
2024
BiyolojiÇankırı Karatekin ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. SEÇİL AKILLI ŞİMŞEK
- Klinik örneklerden izole edilen staphylococcus aureus arasında toksin genlerinin moleküler tespiti
Molecular detection of toxin genes among staphylococcus aureus isolated from clinical samples
RAWAD MOOSA HUSSEIN AL-IRAYFAWEE
Doktora
Türkçe
2024
BiyolojiÇankırı Karatekin ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. SEÇİL AKILLI ŞİMŞEK
PROF. DR. NAWFAL H. ALDUJAILI
- Arpada Pyrenophora teres f. teres moleküler tespiti: Erken enfeksiyon aşamasında izlenmesine yönelik RT-PCR'ın optimizasyonu
Molecular detection of Pyrenophora teres f. teres in barley: Optimizing RT-PCR for early infection monitoring
MÜBERRA YEKEN
Yüksek Lisans
Türkçe
2025
ZiraatBolu Abant İzzet Baysal ÜniversitesiBitki Koruma Ana Bilim Dalı
PROF. DR. GÖKSEL ÖZER