Rekombinasyonun stres, mevsim ve kromozomal inversiyonlarla ilişkisinin drosophila melanogaster'de araştırılması
Investigation of the relationship of recombination with stress, season, and chromosomal inversions in drosophila melanogaster
- Tez No: 898589
- Danışmanlar: DOÇ. DR. BANU ŞEBNEM ÖNDER
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoloji, Biology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2024
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Hacettepe Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Genel Biyoloji Bilim Dalı
- Sayfa Sayısı: 72
Özet
Kromozomal inversiyonların heterozigot olarak bulunması durumda rekombinant gametler yaşayamadığı için sadece atasal gametler hayatta kalabilmektedir. Bir haplotip olarak kalıtlanan inversiyonların varlığında o bölge için rekombinasyon frekansını düşürerek adaptif kümeler oluşturmaktadır. İnversiyonun yer aldığı bölgede rekombinasyonla genomun yeninden düzenlenmesi mümkün olamayacağı için, inversiyonlar bu bölgede rekombinasyon frekansının önemli ölçüde azalmasına neden olurken, genomun başka yerlerindeki rekombinasyon frekansına etki edebilirler. İnversiyonların yanı sıra çevresel değişikliklerin de özellikle sıcak, soğuk, açlık ve susuzluk gibi stres faktörlerinin rekombinasyon frekansını etkilediği bilinmektedir. Rekombinasyonda görülen varyasyonların adaptif olduğuna dair güçlü kanıtlar olmakla beraber, değişen çevre koşullarına adaptasyonda rekombinasyon oldukça önemli bir yere sahiptir. Bu çalışma kapsamında Ankara ilinin Yeşilöz mahallesinden farklı zamanlarda toplanan kendileşmiş soy hatları kullanılarak, In(3R)Payne, In(2L)t, In(3R)K, ve In(3L)P inversiyonlarının rekombinasyon frekansı üzerindeki etkisi ve bu etkinin mevsime bağlı olarak bir örüntüye sahip olup olmadığı araştırılmıştır. Ayrıca susuzluk stresinin de rekombinasyon frekansı üzerindeki etkisi araştırılmıştır. Elde edilen sonuçlara göre, In(3R)Payne inversiyonunun hem içinde bulunduğu 3. kromozomdaki, hem de 2. kromozomdaki rekombinasyon frekansını istatistiksel olarak anlamlı bir şekilde etkilediği; In(2L)t inversiyonun da yine içinde yer aldığı 2. kromozomdaki rekombinasyon frekansını istatistiksel olarak anlamlı bir biçimde etkilediği tespit edilmiştir. Kromozomlarda meydana gelen toplam rekombinasyonların mevsimsel varyasyon göstermemesine rağmen kromozom üzerindeki belirli noktaların rekombinasyon frekansında mevsime bağlı olarak değişiklik gösterdiği bulunmuştur. Bu bağlamda en anlamlı mevsimsellik 2. ve 3. kromozomların ucunda bulunan ve en geniş aralığa sahip bölgelerde meydana gelmiştir.
Özet (Çeviri)
In case of heterozygous chromosomal inversions, since the recombinant gametes cannot survive only the ancestral gametes can survive. In the presence of inversions inherited as a haplotype, they form adaptive clusters by reducing the recombination frequency for that region. Since it is not possible to rearrange the genome by recombination in the region where the inversion takes place, while inversions may cause a significant decrease in the recombination frequency in this region, they effect the recombination frequency elsewhere in the genome. In addition to inversions, environmental changes, especially stress factors such as heat, cold, starvation and desiccation, are known to affect the recombination frequency. Although there is strong evidence that the variations seen in recombination are adaptive, recombination has a very important place in adaptation to changing environmental conditions. Within the scope of this study, the effect of In(3R)Payne, In(2L)t, In(3R)K, and In(3L)P inversions on the recombination frequency and whether this effect had a pattern depending on the season were examined by using inbred lines collected from Yeşilöz district of Ankara at different times. Additionally, the effect of desiccation stress on recombination frequency was investigated. According to the results obtained, In(3R)Payne inversion affects the recombination frequency in both chromosome 3, which is involved in, and chromosome 2 in a statistically significant way; It has been determined that In(2L)t inversion also affects, in a statistically significant way, the recombination frequency in chromosome 2 which is involved in. Although the total recombinations occurring in chromosomes do not show seasonal variation, it has been found that certain points on the chromosome vary in recombination frequency depending on the season. In this context, the most significant seasonality occurred in the regions with the largest interval, located at the ends of the 2nd and 3rd chromosomes.
Benzer Tezler
- Evolutionary engineering and physiological analysis of antimycin-a resistant Saccharomyces cerevisiae
Antimisin-a dirençli Saccharomyces cerevisiae'nin evrimsel mühendisliği ve fizyolojik analizi
ALİCAN TOPALOĞLU
Yüksek Lisans
İngilizce
2018
Biyoteknolojiİstanbul Teknik ÜniversitesiMoleküler Biyoloji-Genetik ve Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ZEYNEP PETEK ÇAKAR
- Genetically accurate models of SOD1-based ALS in drosophila: Validation and characterization
SOD1-temelli ALS'nin genetik açıdan hassas drozofila modelleri: Doğrulama ve karakterizasyon
CEREN İSKENDER
Yüksek Lisans
İngilizce
2013
GenetikBoğaziçi ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. AYŞE NAZLI BAŞAK
- Vitreoscilla hemoglobin geni taşıyan stres altındaki rekombinant Pseudomonas aeruginosa'da piyosiyanin üretimi
Piyocyanin production under stress in recombinant Pseudomonas aeruginosa carrying Vitreoscilla hemoglobin gene
DUYGU ÖZCAN
Yüksek Lisans
Türkçe
2011
Biyolojiİnönü ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. HÜSEYİN KAHRAMAN
- Stress resistance analysis of yeast strains with mitotic exit-related gene deletions
Mitozdan çıkışla ilişkili genleri silinmiş maya hücrelerinin stres direnci analizi
RÜVEYDA GARGI
Yüksek Lisans
İngilizce
2023
Mikrobiyolojiİstanbul Teknik ÜniversitesiMoleküler Biyoloji-Genetik ve Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ZEYNEP PETEK ÇAKAR
DR. ÖĞR. ÜYESİ AYŞE KOCA ÇAYDAŞI
- Ortam koşullarının Schizosaccharomyces pombe'de Rec12 gen anlatımı ve homolog rekombinasyon üzerine etkisi
The effect of environmental conditions on Rec12 gene expression and homologous recombination in Schizosaccharomyces pombe
DENİZ YILMAZ
Yüksek Lisans
Türkçe
2016
Biyolojiİstanbul ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. SEMİAN KARAER UZUNER