Pseudomonas aerugınosa lipopolisakkaritinin COVİD-19 spike proteini araştırmalarında yeni bir model olarak değerlendirilmesi
Evaluation of pseudomonas aeruginosa lipopolysaccharide as a new model in COVİD-19 spike protein research
- Tez No: 900158
- Danışmanlar: DOÇ. DR. CAN TÜRK
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Mikrobiyoloji, Microbiology
- Anahtar Kelimeler: Gram negatif bakteriler, Korona virüs enfeksiyonları, Pseudomonas enfeksiyonları, Gram negative bacteria, Coronavirus enfections, Pseudomonas infections
- Yıl: 2024
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Lokman Hekim Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Pseudomonas aeruginosa (P.aeruginosa), birçok virülans faktörüne sahip gram negatif fırsatçı bir patojendir. Özellikle pilus, flagella ve lipopolisakkarit (LPS) gibi yüzey komponentleri ile konak hücre yüzeyine yapışır ve konak immün yanıtına neden olur. Yeni Koronavirüs hastalığı (COVID-19), şiddetli akut solunum sendromu koronavirüs 2'nin (SARS-CoV-2) neden olduğu, yüksek oranda bulaşıcı bir hastalıktır. COVID-19 enfeksiyonunda hücresel immünitenin kontrolsüz inflamatuvar yanıt oluşturması sonucunda sitokin fırtınası meydana gelir. COVID-19 enfeksiyonunda görülen yoğun sitokin salınımı, LPS kaynaklı sepsislerde de görülür. COVID-19 enfeksiyonunun klinik gelişimi ve semptomlarıyla ilişkili üç fazı ve her faz için önem taşıyan genler, birinci faz başlangıç aşaması olarak ACE2 ve ANPEP; ikinci aşama EGFR ve IGF2R olarak belirlendi. Bu çalışmada koronavirüs enfeksiyonunda, ifade değişikliklerinin gözlendiği birinci ve ikinci fazda yer alan nonimmün genlerin, kolon ve akciğer epitel hücrelerinin SARS-CoV-2 spike proteini ve LPS ile ayrı ayrı muamele edilmesiyle ifade değişimleri olup olmadığının belirlenmesi hedeflendi. Bu amaçla BEAS-2B ve CRL-1831 hücreleri kullanılarak 12,24,48 ve 72 saat zaman aralıklarında spike ve LPS muamelesi yapılmıştır. Her zaman aralığı sonunda ACE2, ANPEP, EGFR ve IGF2R gen ekspresyon düzeyleri ve protein düzeyleri belirlendi. Çalışma sonuçları, bu genlerin hem kolon hem akciğer epitel hücrelerinde anlamlı olarak farklı yanıtlar oluşturduğunu gösterdi. Her ne kadar klinik görünümleri benzer olsa da çalışmamızda LPS ve spike proteinin belirlenen genlerde her düzeyde aynı cevapları oluşturmadığı gösterildi. Ayrıca kolon ve akciğer epitel hücrelerindeki LPS ve spike proteini uygulamalarında da anlamlı olarak farklı yanıtlar elde edildi. Bu farklar dikkate alınarak gelecekte yapılacak araştırmalarda çalışmamızdaki bilgiler ışık tutacaktır.
Özet (Çeviri)
Pseudomonas aeruginosa (P. aeruginosa) is a gram-negative opportunistic pathogen with numerous virulence factors. It adheres to host cell surfaces through surface components such as pili, flagella, and lipopolysaccharides (LPS), triggering host immune responses. The novel Coronavirus disease (COVID-19), caused by severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2), is a highly contagious illness. In COVID-19 infections, an uncontrolled inflammatory response of cellular immunity results in a cytokine storm. The intense cytokine release observed in COVID-19 infections is also seen in LPS-induced sepsis. The clinical progression and symptoms of COVID-19 are associated with three phases, with specific genes being significant for each phase: ACE2 and ANPEP in the initial phase, and EGFR and IGF2R in the second phase. This study aimed to determine whether there are expression changes in non-immune genes involved in the first and second phases of coronavirus infection, where expression changes are observed, by treating colon and lung epithelial cells separately with the SARS-CoV-2 spike protein and LPS. For this purpose, BEAS-2B and CRL-1831 cells were treated with spike and LPS at 12, 24, 48, and 72-hour intervals. At the end of each interval, the expression levels of ACE2, ANPEP, EGFR, and IGF2R genes and their protein levels were determined. The results of the study showed that these genes elicited significantly different responses in both colon and lung epithelial cells. Although the clinical manifestations are similar, our study demonstrated that LPS and spike protein did not produce the same responses at all levels in the identified genes. Additionally, significant differences were obtained in the responses to LPS and spike protein applications in colon and lung epithelial cells. These differences will provide insights for future research, considering the findings of our study
Benzer Tezler
- Biochemical and genetical aspects of aminoglycoside beta-lactam and quinolone antibiotics resistance among the clinical isolates of pseudomonas aeruginosa
Pseudomonas aeruginosa'nın klinik izoletlarında aminoglikosit, beta-laktam ve kinolon antibiyotiklere dirençliğin biyokimyasal ve genetik özellikleri
KEMAL MAHİD ADWAN
- Pseudomonas aeruginosa suşlarının piyosinlerine ve antibiyotik direncine göre tiplendirim yöntemlerinin karşılaştırılması
Başlık çevirisi yok
FATMA SERAP ÖNAY
- Pseudomonas Aeruginosa`da beta-laktam antibiyotiklere direncin imipenem ve sefoksitin ile indüklenmesi
Imipenem and cefoxitin induced resistance to beta-lactam antibiotics in Pseudomonas Aeruginosa
GÜLAY BÖREKÇİ
Doktora
Türkçe
1996
MikrobiyolojiErciyes ÜniversitesiMikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ.DR. BÜLENT SÜMERKAN
- Pseudomonas Aeruginosa'da beta-laktamaz aktivitesi ve antipseudomonal ajanlara karşı direncin araştırılması
Başlık çevirisi yok
NUR YAPAR
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
1997
Enfeksiyon Hastalıkları ve Klinik MikrobiyolojiEge ÜniversitesiKlinik Bakteriyoloji ve Enfeksiyon Hastalıkları Ana Bilim Dalı
