Glikomik yaklaşımları kullanılarak et ürünlerinin sınıflandırılması
Classification of meat products using glycomic approaches
- Tez No: 905225
- Danışmanlar: DOÇ. DR. HACI MEHMET KAYILI
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyomühendislik, Bioengineering
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2024
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Karabük Üniversitesi
- Enstitü: Lisansüstü Eğitim Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyomedikal Mühendisliği Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 64
Özet
Bu çalışmada temel glikomik yaklaşımlar kullanılarak çeşitli et ürünlerinin (sığır, keçi, tavuk) glikan profillerine dayalı olarak kütle spektrometrik yöntemlerle çıkarılması ve elde edilen profillere bağlı makine öğrenmesi yaklaşımları kullanılarak sınıflandırılması amaçlanmıştır. Bu kapsamda, makine öğrenmesi algoritmaları kullanılarak, et örneklerinin glikan profillerine dayalı sınıflandırılması gerçekleştirilmiştir. MALDI-MS tekniği ile elde edilen glikan profilleri, 20 ortak N-glikan üzerinden analiz edilmiş ve %100 doğruluk oranı ile 3 farklı et türü başarıyla sınıflandırılmıştır. Algoritmaların performansı ROC (alıcı iletişim karakteristiği) eğrileri ve AUC (eğri altındaki alan) değerleriyle değerlendirilmiş, AUC (eğri altındaki alan) değeri 1,00 olarak hesaplanmıştır, bu da modelin yüksek başarısını göstermektedir. Bulgularımız, glikan bazlı sınıflandırmanın kullanılmasının etin kimliğini doğrulamak ve kalitesini sağlamak için güvenilir bir yöntem olabileceğini göstermektedir. Gelecekte, türler arasında korunmuş glikan yapılarına dair çalışmaların, evrimsel biyoloji ve biyokimya gibi alanlara katkı sağlayabileceği öngörülmektedir.
Özet (Çeviri)
This study aimed to classify various meat products (cattle, goat, chicken) based on glycan profiles using mass spectrometric methods, employing fundamental glycomic approaches. In this context, the classification of meat samples based on their glycan profiles was carried out using machine learning algorithms. The glycan profiles obtained through the MALDI-MS technique were analyzed over 20 common N-glycans, and three different meat types were successfully classified with 100% accuracy. The performance of the algorithms was evaluated using ROC (Receiver operating characteristic) curves and AUC (Area under curve) values, with the area under curve value calculated as 1.00, indicating the model's high success. The findings suggest that glycan-based classification can be an effective tool in meat authentication and quality control processes. In the future, studies on conserved glycan structures across species are anticipated to contribute to fields such as evolutionary biology and biochemistry.
Benzer Tezler
- Determination of molecular traces of various snake venomes using proteomics and glycomic approaches based on mass spectrometry
Kütle spektrometrisi temelli proteomik ve glikomik yaklaşımlar kullanılarak çeşitli yılan venomlarının moleküler izlerinin belirlenmesi
MARWA ABU AISHEH
- Denizkestanesi Paracentrotus lividus'un yumurta jel kılıfı glikoproteinlerinin izolasyonu ve glikan profilinin MALDI-TOF-MS ve LC-MS/MS sisteminde glikomik yaklaşımla belirlenmesi
Isolation of egg jelly coat glycoproteins of sea urchin paracentratus lividus and identification of glycan profile by MALDI-TOF/MS and LC-MS/MS system using the glycomics approach
UMUT ŞAHAR
- Otojen Ramus Blok Greft, Poli (Laktik-ko-Glikolikasit) (PLGA) blok greft ile vertikal ve horizontal olarak augmente edilen atrofik alveoler kretlerdeki alıcı sahaların volumetrik değişikliklerinin incelenmesi
Investigation of the volumetric changes of the recipient fields in atrophic alveolar crests that are vertically and horizontally augmented with Autogeneous Ramus Block Graft, Poly (Lactic-co-Glycolicacide) (PLGA) block graft
CANSU ASLAN DİNÇ
Diş Hekimliği Uzmanlık
Türkçe
2024
Diş HekimliğiFırat ÜniversitesiPeriodontoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. FİLİZ ACUN KAYA
PROF. DR. SERKAN DÜNDAR
- Koruyucu yeni nesil peptid aşı modelleri: Viral kuduz hastalığı peptidlerinin çeşitli adjuvantlarla biyokonjugatlarının geliştirilmesi
New generation protective peptide vaccine models: Development of bioconjugates of rabies viral peptides with various adjuvants
PELİN PELİT ARAYICI
Yüksek Lisans
Türkçe
2015
BiyomühendislikYıldız Teknik ÜniversitesiBiyomühendislik Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. ZEYNEP AKDESTE
YRD. DOÇ. DR. MESUT KARAHAN
- Peptit yüklü nano aşı formülasyonunun toksoplazma gondii'ye karşı etkinliğinin ın vivo olarak incelenmesi
Peptide loaded nano vaccine formulation and in vivo examination of efficiency against toxoplasma gondii
ZEYNEP KAYA
Yüksek Lisans
Türkçe
2017
BiyomühendislikYıldız Teknik ÜniversitesiBiyomühendislik Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. RABİA ÇAKIR KOÇ
