Tiopurin S-metil transferaz mutasyonlarının multiplex PCR ile belirlenmesi
Detection of thiopurine S-methyltranseferase mutations by multiplex PCR
- Tez No: 907844
- Danışmanlar: PROF. DR. MEHMET AKİF ÇÜRÜK
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Biyoteknoloji, Biotechnology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2024
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Çukurova Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 62
Özet
Tiyopürin metiltransferaz (TPMT), lösemi ve inflamatuar bağırsak hastalıklarının (IBD) tedavisinde kullanılan tiyopürin grubu ilaçların (azatioprin ve 6-merkaptopürinin) metabolizmasında rol oynayan önemli bir enzimdir. TPMT aktivitesi genetik polimorfizmler ile ilişkili olup tiyopürinlerin bireysel reaksiyonunu ve dozunu belirler. Üç ana TPMT aleli: TPMT*2 (c.238G>C), TPMT*3A (c.460G>A, c.719A>G) ve TPMT*3C (c.719A>G), dünyadaki farklı populasyonlarda TPMT eksikliğinin %80-95'ini oluşturur. Bu çalışmanın amacı, sık görülen TPMT alellerini belirlemek için hızlı ve hassas bir yöntemi uygulamaktı. Burada c.238G>C, c.460G>A ve c.719A>G mutasyonlarının genotip analizi için multipleks yüksek çözünürlüklü erime analizi (HRMA) moleküler testini kullandık. Doksan normal kişiden alınan DNA örneklerini TPMT geninin 238, 460 ve 719 pozisyonlarındaki bilinen mutasyonlarını analiz ettik. Multipleks HRMA ile elde ettiğimiz sonuçlar, DNA dizilemesinden elde edilen verilerle karşılaştırıldığında %100 doğruluk gösterdi. Multipleks HRMA'nın, TPMT*2, TPMT*3A ve TPMT*3C alelleri belirlenmesinde konvansiyonel tekniklere kıyasla hızlı, duyarlı ve etkili bir tanı yöntemi olarak kullanılabileceği sonucuna vardık.
Özet (Çeviri)
Thiopurine methyltransferase (TPMT) is an enzyme involved in the metabolism of thiopurine drugs (azathioprine and 6-mercaptopurine) used in the treatment of leukemia or inflammatory bowel diseases (IBD). The activity in these enzyme correlates with the genetic polymorphism of the TPMT genes, which determines an individual reaction and dosing of thiopurines. Three main TPMT alleles: TPMT*2 (c.238G>C), TPMT*3A (c.460G>A, c.719A>G) and TPMT*3C (c.719A>G) account for 80-95 % of inherited TPMT deficiency in different populations in the world. The aim of this study was to use a quick and highly sensitive method for determining major TPMT alleles. Here we present the molecular test for genotyping c.238G>C, c.460G>A, c.719A>G changes based on multiplex high resolution melting analysis (HRMA). We analyzed 90 DNA samples from normal population a known genotype in the positions 238, 460 and 719 of the TPMT gene. Our results obtained with multiplex HRMA indicated 100 % accuracy in comparison with DNA sequencing. We conclude that multiplex HRMA can be used as a quick, sensitive and efficient diagnostic method compared to conventional techniques for the determination of TPMT*2, TPMT*3A and TPMT*3C alleles.
Benzer Tezler
- Diyarbakır yöresinde tiopürin S-metil transferaz enzim eksikliği ve TPMT*2, *3B ve *3C mutasyonlarının belirlenmesi
The deficiency of thiopurine S-methyl transferase enzyme and determination of TPMT*2, *3B and *3C mutations in diyarbakir region
KORAY GELEN
- Tiopürin S-Metil Transferaz (TMBT) genotiplerinin belirlenmesi
Identification of Thiopurine S-Methyltransferase genotypes
AHMET GENÇ
- Akut lenfoblastik lösemili hastalarda tiopürin s-metiltransferaz gen mutasyonlarının belirlenmesi
Determination of thiopurine s-methyltransferase gene mutation in the patients with acute lymphoblastic leukemia
ERHAN ÖZENÇ
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2010
HematolojiDicle Üniversitesiİç Hastalıkları Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ORHAN AYYILDIZ
- İnflamatuar bağırsak hastalarındatiopurin metiltransferaz varyantları
TPMT gene variants in inflammatory bowel disease patients
AMIN DAEMI
- Çukurova Bölgesi Üniversite hastanesinde inflamatuar bağırsak hastalığı ile takipli hastalarda malignite sıklığı ve ilişkili faktörlerin değerlendirilmesi
The frequency of malignancy and risk factors associated with malignancies in inflammatory bowel disease patients at Çukurova University
ALİ ABBAS GEZGİN
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2023
GastroenterolojiÇukurova Üniversitesiİç Hastalıkları Ana Bilim Dalı
PROF. DR. SEDEF KURAN