Geri Dön

Şeker pancarında (Beta vulgaris ssp. vulgaris) imidazolinon grubu herbisitlere dayanıklılık oluşturmak için genom düzenlemesi

Genome editing for imidazolonone herbicides resistance in sugar beet (Beta vulgaris ssp. vulgaris)

  1. Tez No: 909159
  2. Yazar: ANIL MEHMET BALTACI
  3. Danışmanlar: PROF. DR. MEHMET ARSLAN
  4. Tez Türü: Doktora
  5. Konular: Biyoteknoloji, Ziraat, Biotechnology, Agriculture
  6. Anahtar Kelimeler: CRISPR/Cas9, Doku Kültürü, Gen Aktarımı, Bitki Islahı, CRISPR/Cas9, Tissue Culture, Gene Transfer, Plant Breeding
  7. Yıl: 2024
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Erciyes Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Tarımsal Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Bitkisel Biyoteknoloji Bilim Dalı
  13. Sayfa Sayısı: 110

Özet

Şeker pancarında verim ve kalite özelliklerinin ıslah çalışmalarıyla iyileştirilmesinin yanı sıra biyotik ve abiyotik stres faktörlerine karşı tolerant ya da dayanıklı çeşitler geliştirilmeye başlanmıştır. Biyotik stres faktörlerinden biri olan yabancı otlara karşı mücadele yöntemlerinin başında herbisit uygulaması gelmektedir. Ancak herbisit uygulaması kültür bitkisine de zarar verebilmektedir. Bu nedenle herbisite dayanıklı çeşitlerin ekimi herbisit uygulaması için oldukça önem arz etmektedir. Çalışmada 3 adet sgRNA tasarlanmıştır ve ALS geni üzerinde C→T nokta mutasyonu oluşturulması amaçlanmıştır. Tasarlanan sgRNA'ları ve Cas9'u içeren plazmit E. coli'de çoğaltıldıktan sonra petiyol eksplantlarına Agrobacterium aracılı aktarım tekniğiyle aktarılmaya çalışılmıştır. AgrobacteriumGV3101 suşu ile inoküle edilen petiyol eksplantları şeker pancarında besin ortamlarının optimizasyonu çalışmasında en yüksek rejenerasyon oranına sahip (%14) selektif antibiyotikler ve 0.5 mg/L KN + 0.25 mg/L NAA içeren ortam içerisinde rejenere edilmiştir. Rejenere olan eksplantlarından 5 adet bitkicik elde edilmiştir ve köklendirilmiştir. Köklendirmeden sonra Aklimatizasyon işlemi yapılmıştır. Moleküler test için yaprak DNA izolasyonu yapılarak ALS bölgesinin dizisinde farklılık oluşup oluşmadığını gözlemlenmiştir. Herbisite dayanıklılık testlerinde imizamox etken maddeli bir herbisit kullanılmıştır. Yapılan uygulamalarda ALS geninin hedef bölgesinde herhangi bir değişiklik olmadığı belirlemiştir ve aynı zaman imizamox uygulaması yapılan bitkilerin de tamamının öldüğü gözlemlenmiştir.

Özet (Çeviri)

In addition to the enhancement of the yield and quality characteristics of sugar beet through breeding studies, the development of tolerant or resistant varieties has commenced in response to the necessity of addressing biotic and abiotic stress factors. Herbicide application represents a principal method of control against weeds, which constitute one of the biotic stress factors. However, the use of herbicides can also result in damage to non-target cultivated plants. Consequently, the deployment of herbicide-resistant varieties is of paramount importance in the context of herbicide application. In this study, 3 sgRNAs were designed and it was aimed to create C→T point mutation on ALS gene. The designed sgRNAs and the plasmid containing Cas9 were amplified in E. coli and then transferred to petiole explants by Agrobacterium-mediated transfer technique. Petiole explants inoculated with AgrobacteriumGV3101 strain were regenerated in the medium containing selective antibiotics and 0.5 mg/L KN + 0.25 mg/L, which had the highest regeneration rate (14%) in the study of optimisation of media in sugar beet. Five regenerated plantlets were obtained from the explants and rooted. After rooting, acclimation was performed. For molecular test, leaf DNA isolation was performed and it was observed whether there was a difference in the sequence of ALS region. Imızamox was used in herbicide resistance test. It was determined that there was no change in the target region of the ALS gene and at the same time, it was observed that all of the plants treated with imizamox died.

Benzer Tezler

  1. Identification of salt stress responsive proteins in wild sugar beet (Beta maritima) using 2D-PAGE with MALDI-TOF/TOF system

    2D-PAGE ile MALDI-TOF/TOF sistemi kullanılarak yabani şeker pancarında (Beta maritima) tuz stresine duyarlı proteinlerin belirlenmesi

    ÇİĞDEM ÇAKIROĞLU

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2012

    Genetikİzmir Yüksek Teknoloji Enstitüsü

    Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. HÜSEYİN ÇAĞLAR KARAKAYA

  2. Azot dozları ve rizobakteri uygulamalarının şeker pancarının (Beta vulgaris L.) agronomik özelliklerine etkisi

    The effect of nitrogen doses and risobacter applications on agronomic characteristics of sugar beet (Beta vulgaris L.)

    ALİ SUSAR

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2021

    ZiraatErciyes Üniversitesi

    Tarla Bitkileri Ana Bilim Dalı

    DR. ÖĞR. ÜYESİ AZİZ ŞATANA

  3. Gynogenesis induction and doubled haploid plant production in sugar beet (Beta vulgaris)

    Şeker pancarında (Beta vulgaris) ginogenezis indüksiyonu ve katlanmış haploid bitki üretimi

    ARMAN PAZUKI

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2019

    BiyolojiBolu Abant İzzet Baysal Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    Prof. Dr. EKREM GÜREL

  4. Şeker pancarında (Beta Vulgaris L.) su-verim ilişkilerinin ve bitki su stres indeksi (CWSI) kullanılarak sulama zamanının belirlenmesi

    Determination of water-yield relationships and irrigation scheduling using crop water stress index (CWSI) in sugar beet (Beta Vulgaris L.)

    ALİ KAAN YETİK

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2021

    ZiraatBursa Uludağ Üniversitesi

    Biyosistem Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. BURAK NAZMİ CANDOĞAN

  5. Şeker pancarında (Beta vulgaris L.) kuraklık stresine tolerans/dayanıklılık üzerine manyetik alanın etkisi

    The effect of magnetic field on tolerance/resistance to drought stress in sugar beet (Beta vulgaris L.)

    İREM POYRAZ

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2021

    ZiraatAnkara Üniversitesi

    Tarla Bitkileri Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. MUSTAFA YILDIZ