Şeker pancarında (Beta vulgaris ssp. vulgaris) imidazolinon grubu herbisitlere dayanıklılık oluşturmak için genom düzenlemesi
Genome editing for imidazolonone herbicides resistance in sugar beet (Beta vulgaris ssp. vulgaris)
- Tez No: 909159
- Danışmanlar: PROF. DR. MEHMET ARSLAN
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Biyoteknoloji, Ziraat, Biotechnology, Agriculture
- Anahtar Kelimeler: CRISPR/Cas9, Doku Kültürü, Gen Aktarımı, Bitki Islahı, CRISPR/Cas9, Tissue Culture, Gene Transfer, Plant Breeding
- Yıl: 2024
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Erciyes Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Tarımsal Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Bitkisel Biyoteknoloji Bilim Dalı
- Sayfa Sayısı: 110
Özet
Şeker pancarında verim ve kalite özelliklerinin ıslah çalışmalarıyla iyileştirilmesinin yanı sıra biyotik ve abiyotik stres faktörlerine karşı tolerant ya da dayanıklı çeşitler geliştirilmeye başlanmıştır. Biyotik stres faktörlerinden biri olan yabancı otlara karşı mücadele yöntemlerinin başında herbisit uygulaması gelmektedir. Ancak herbisit uygulaması kültür bitkisine de zarar verebilmektedir. Bu nedenle herbisite dayanıklı çeşitlerin ekimi herbisit uygulaması için oldukça önem arz etmektedir. Çalışmada 3 adet sgRNA tasarlanmıştır ve ALS geni üzerinde C→T nokta mutasyonu oluşturulması amaçlanmıştır. Tasarlanan sgRNA'ları ve Cas9'u içeren plazmit E. coli'de çoğaltıldıktan sonra petiyol eksplantlarına Agrobacterium aracılı aktarım tekniğiyle aktarılmaya çalışılmıştır. AgrobacteriumGV3101 suşu ile inoküle edilen petiyol eksplantları şeker pancarında besin ortamlarının optimizasyonu çalışmasında en yüksek rejenerasyon oranına sahip (%14) selektif antibiyotikler ve 0.5 mg/L KN + 0.25 mg/L NAA içeren ortam içerisinde rejenere edilmiştir. Rejenere olan eksplantlarından 5 adet bitkicik elde edilmiştir ve köklendirilmiştir. Köklendirmeden sonra Aklimatizasyon işlemi yapılmıştır. Moleküler test için yaprak DNA izolasyonu yapılarak ALS bölgesinin dizisinde farklılık oluşup oluşmadığını gözlemlenmiştir. Herbisite dayanıklılık testlerinde imizamox etken maddeli bir herbisit kullanılmıştır. Yapılan uygulamalarda ALS geninin hedef bölgesinde herhangi bir değişiklik olmadığı belirlemiştir ve aynı zaman imizamox uygulaması yapılan bitkilerin de tamamının öldüğü gözlemlenmiştir.
Özet (Çeviri)
In addition to the enhancement of the yield and quality characteristics of sugar beet through breeding studies, the development of tolerant or resistant varieties has commenced in response to the necessity of addressing biotic and abiotic stress factors. Herbicide application represents a principal method of control against weeds, which constitute one of the biotic stress factors. However, the use of herbicides can also result in damage to non-target cultivated plants. Consequently, the deployment of herbicide-resistant varieties is of paramount importance in the context of herbicide application. In this study, 3 sgRNAs were designed and it was aimed to create C→T point mutation on ALS gene. The designed sgRNAs and the plasmid containing Cas9 were amplified in E. coli and then transferred to petiole explants by Agrobacterium-mediated transfer technique. Petiole explants inoculated with AgrobacteriumGV3101 strain were regenerated in the medium containing selective antibiotics and 0.5 mg/L KN + 0.25 mg/L, which had the highest regeneration rate (14%) in the study of optimisation of media in sugar beet. Five regenerated plantlets were obtained from the explants and rooted. After rooting, acclimation was performed. For molecular test, leaf DNA isolation was performed and it was observed whether there was a difference in the sequence of ALS region. Imızamox was used in herbicide resistance test. It was determined that there was no change in the target region of the ALS gene and at the same time, it was observed that all of the plants treated with imizamox died.
Benzer Tezler
- Identification of salt stress responsive proteins in wild sugar beet (Beta maritima) using 2D-PAGE with MALDI-TOF/TOF system
2D-PAGE ile MALDI-TOF/TOF sistemi kullanılarak yabani şeker pancarında (Beta maritima) tuz stresine duyarlı proteinlerin belirlenmesi
ÇİĞDEM ÇAKIROĞLU
Yüksek Lisans
İngilizce
2012
Genetikİzmir Yüksek Teknoloji EnstitüsüMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. HÜSEYİN ÇAĞLAR KARAKAYA
- Azot dozları ve rizobakteri uygulamalarının şeker pancarının (Beta vulgaris L.) agronomik özelliklerine etkisi
The effect of nitrogen doses and risobacter applications on agronomic characteristics of sugar beet (Beta vulgaris L.)
ALİ SUSAR
Yüksek Lisans
Türkçe
2021
ZiraatErciyes ÜniversitesiTarla Bitkileri Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ AZİZ ŞATANA
- Assessment of genetic diversity of global sugar beet germplasm through silico dart and SNP markers covering whole genome
Tüm genomu kapsayan slico dart ve SNP belirteçleriyle dünya şeker pancarı gen kaynaklarında genetik çeşitliliğin belirlenmesi
NOOR MAIWAN BAHJAT ALQALUS
Doktora
İngilizce
2025
BiyoteknolojiVan Yüzüncü Yıl ÜniversitesiTarımsal Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MEHTAP YILDIZ
PROF. DR. FAHEEM SHAHZAD BALOCH
- Samsun ve Ankara illeri kırmızı pancar üretim alanlarında vektör polymyxa betae ile taşınan toprak kökenli virüslerin araştırılması
An investigation on soilborne viruses transmitted by vector polymyxa betae in red beet production areas of Samsun and Ankara provinces
SEVİLAY KAYA
Yüksek Lisans
Türkçe
2025
ZiraatOndokuz Mayıs ÜniversitesiBitki Koruma Ana Bilim Dalı
PROF. DR. NAZLI DİDE KUTLUK YILMAZ
- Gynogenesis induction and doubled haploid plant production in sugar beet (Beta vulgaris)
Şeker pancarında (Beta vulgaris) ginogenezis indüksiyonu ve katlanmış haploid bitki üretimi
ARMAN PAZUKI
Doktora
İngilizce
2019
BiyolojiBolu Abant İzzet Baysal ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
Prof. Dr. EKREM GÜREL