Investigation of enhancer-protein-promoter interactions within regulatory loops
Transkripsiyon düzenleyici döngülerde enhancer-protein-promotör etkileşimlerinin incelenmesi
- Tez No: 917644
- Danışmanlar: DR. ÖĞR. ÜYESİ PINAR PİR
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Biyoistatistik, Biyomühendislik, Genetik, Biostatistics, Bioengineering, Genetics
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2025
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Gebze Teknik Üniversitesi
- Enstitü: Lisansüstü Eğitim Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyomühendislik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Biyoinformatik ve Sistem Biyolojisi Bilim Dalı
- Sayfa Sayısı: 181
Özet
Transkripsiyonel aktiviteyi yönlendiren karmaşık düzenleyici mekanizmaların anlaşıl- ması, hücresel farklılaşma, bağışıklık yaşlanması ve patolojik fenotiplerin deşifre edil- mesi için kritik öneme sahiptir. Bu çalışma, transkripsiyonel döngüleri araştırmakta, enhancer ve promotör arasındaki karşılıklı etkileşime odaklanmakta, ağ analizi yön- temlerini kullanmakta ve öncelikle insan örneklerinden elde edilen multiomiks veri- lerini entegre etmektedir. Çalışmanın önemli bir metodolojik odak noktası da, Hi-C verilerinin düşük çözünürlük sınırlamalarını ele almıştır. Çeşitli çözünürlük artırma yöntemlerinin karşılaştırılması, bu yöntemlerin TAD tanımlama için faydalarını ortaya koymuş olmakla birlikte yüksek çözünürlüklü (
Özet (Çeviri)
Understanding the intricate regulatory mechanisms driving transcriptional activity is critical to deciphering cellular differentiation, immune aging, and pathological phe- notypes. This study investigates transcriptional loops, focusing on the bidirectional interplay between enhancers and promoters, utilizing cutting-edge network analysis methods and integrating multi-omics data, primarily derived from human samples. A significant methodological focus addressed the low-resolution limitations of Hi-C data. Benchmarking various resolution-enhancement methods revealed their utility for TAD- calling but also highlighted challenges in defining high-resolution (
Benzer Tezler
- Durgun su ortamında su alma borusuna ait hava girişine taban geçirimliliğinin etkisinin araştırılması ve modellenmesi
The investigation and modelling of effect of base permeability on air entraining vortex belongs to intake in still-water environment
OSMAN SUSEM
Yüksek Lisans
Türkçe
2015
İnşaat MühendisliğiBozok Üniversitesiİnşaat Mühendisliği Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. BURHAN ÜNAL
- Karanlıkdere Vadisi'nin (Yozgat) phenopelopoid akarları üzerine sistematik araştırmalar
Systematic investigations on the phenopelopoid mites of Karanlıkdere Valley (Yozgat)
SALİH KÖKEZ
- Bayan futbolcularda 8 haftalık hazırlık çalışmalarının bazı biyomotorik ve fizyolojik özellikler üzerine etkisinin araştırılması
The investigation of the effects of eight weeks prepara-tory work on some biomotorical and physiological properties of female soccer players
ARİF İMAMOĞLU
Yüksek Lisans
Türkçe
2014
SporOndokuz Mayıs ÜniversitesiBeden Eğitimi ve Spor Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. MURAT ELİÖZ
- Buji ile ateşlemeli bir motorda Miller çevrimi uygulaması, performans ve emisyon karakteristiklerinin incelenmesi
Application of Miller cycle in a spark ignition engine and the investigation of performance and emission characteristics
OĞUZ KÜRŞAT DEMİRCİ
Yüksek Lisans
Türkçe
2013
Teknik EğitimGazi ÜniversitesiMakine Eğitimi Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. CAN ÇINAR
- Prenatal dönemde farklı dozlarda uygulanan diklofenak sodyumun merkezi sinir sistemi gelişimi üzerine toksik etkisinin araştırılması
The toxic effects of different doses of diclofenac sodium on the development of the central nervous system exposed during prenatal period
EBRU ELİBOL
Doktora
Türkçe
2014
Histoloji ve EmbriyolojiOndokuz Mayıs ÜniversitesiAnatomi Ana Bilim Dalı
PROF. DR. SÜLEYMAN KAPLAN
- Terkos havzasında tuzlu su girişimlerinin geçici elektromanyetik ve doğru akım özdirenç yöntemleriyle araştırılması
Investigation of saltwater intrusion in terkos basin using transient electromagnetic and direct current resistivity methods
AYÇA SULTAN ARDALI
Doktora
Türkçe
2014
Jeofizik Mühendisliğiİstanbul ÜniversitesiJeofizik Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. AYSAN GÜRER