Geri Dön

Yoğun bakım ünitelerinde karbapenem dirençli acinetobacter baumannii (KDAB) izolatlarının karakterizasyonu

Characterization of carbapenem-resistant A. baumannii (KDAB) isolates in intensive care units

PDF İndir

  1. Tez No: 923939
  2. Yazar: DHUHA FOUAD ALI AL SAMMARRAIE
  3. Danışmanlar: DOÇ. DR. ALİ ÖZTÜRK
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Mikrobiyoloji, Microbiology
  6. Anahtar Kelimeler: Acinetobacter baumannii, Hastane enfeksiyonları, Karbapenemaz, PFGE, Yoğun bakım üniteleri, Acinetobacter baumannii, Carbapenemase, Pulsed field gel electrophoresis, Intensive care units
  7. Yıl: 2025
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Niğde Ömer Halisdemir Üniversitesi
  10. Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Tıbbi Mikrobiyoloji Bilim Dalı
  13. Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.

Özet

Karbapenem dirençli A. baumannii (KDAB), özellikle hastane ortamlarında yaşamı tehdit eden ciddi enfeksiyonlara neden olabilen önemli bir patojendir. KDAB, A. baumannii türünün karbapenem grubu antibiyotiklere (imipenem, meropenem ve ertapenem gibi) direnç geliştirmiş formlarını ifade eder. Bu direnç, enfeksiyonların tedavisini zorlaştırarak hastalık yükünü ve yayılma riskini arttırmaktadır. Bu çalışmanın amacı, farklı yoğun bakım ünitelerinde (YBÜ) yatan hastalardan izole edilen A. baumannii kökenlerinde karbapenem direncine neden olan genlerin fenotipik ve moleküler yöntemlerle araştırılması ve izolatlar arasındaki klonal ilişkinin pulsed-field jel elektroforez (PFGE) yöntemi ile incelenmesidir. Çalışmaya toplam 60 A. baumannii izolatı dahil edildi. İzolatların tür düzeyinde tanımlanmasında konvansiyonel yöntemlerin yanı sıra MALDI-TOF MS sistemi de kullanıldı. İzolatların farklı antibiyotiklere karşı duyarlılıkları, Vitek compact 2 otomatize sistemi ve disk difüzyon yöntemiyle değerlendirildi. Karbapenemaz varlığı fenotipik olarak Rapidec Carba NP testi ile araştırıldı, moleküler düzeyde ise Polimeraz Zincir Reaksiyonu (PCR) ile karbapenemaz genleri tespit edildi. İzolatlar arasındaki klonal ilişkiler PFGE yöntemi ile incelendi. İzolatların elde edildiği 60 hastanın 34'ü (%56.7) erkek, 26'sı (%43.3) kadındı. Suşlar trakeal aspirat (%75), kan (%18), yara (%5) ve balgam (%2) örneklerinden izole edildi. İzolatların büyük çoğunluğu Genel (%73,3), Anesteziyoloji (%15), Cerrahi (%5), Dahiliye (%3,3), COVID-19 (%1,7) ve Kardiyovasküler Cerrahisi (%1,7) YBÜ'lerinden elde edildi. Vitek 2 sistemi ile yapılan duyarlılık testlerinde en etkili antibiyotikler kolistin (%100), trimetoprim/sülfametoksazol (%36.67) ve amikasin (%23.33) olarak bulundu. Disk difüzyon yöntemiyle ise izolatların imipenem, meropenem, gentamisin, amikasin, sefepim, seftazidim, piperasilin-tazobaktam, netilmisin ve tigesikline karşı %100 dirençli olduğu tespit edildi. Genetik analizlerde izolatların %86.6'sında (n=52) blaOXA-51 ve %91.6'sında (n=55) blaOXA-23 genleri saptandı. Bununla birlikte, hiçbir izolatda blaOXA-40 ve blaOXA-58 genleri tespit edilmedi. Klonal ilişki analizinde küme benzerlik oranı %71 olarak bulunmuş olup kümeler içindeki genotipler arasında %99,4'e varan yüksek klonal ilişki oranları tespit edildi. Bu bulgular, KDAB izolatlarının hem fenotipik hem de moleküler düzeyde yüksek direnç profiline sahip olduğunu ve karbapenemaz genlerinin yaygın olarak bulunduğunu göstermektedir.

Özet (Çeviri)

Carbapenem-resistant A. baumannii (CRAB) is an important pathogen that can cause serious life-threatening infections, especially in hospital settings. CRAB refers to strains of A. baumannii that have developed resistance to carbapenem group antibiotics (such as imipenem, meropenem, and ertapenem). This resistance makes infections more difficult to treat, increasing the disease burden and the spread risk. This study aimed to investigate the genes causing carbapenem resistance in A. baumannii strains isolated from patients hospitalized in different intensive care units (ICU) by phenotypic and molecular methods and to examine the clonal relationship between the isolates by pulsed-field gel electrophoresis (PFGE). A total of 60 A. baumannii isolates were included in the study. In addition to conventional methods, the MALDI-TOF MS system was also used to identify the isolates at the species level. The susceptibility profiles of the isolates against different antibiotics were evaluated by the Vitek compact 2 automated system and disk diffusion method. The presence of carbapenemase was investigated phenotypically with the Rapidec Carba NP test, and carbapenemase genes were detected at the molecular level with Polymerase Chain Reaction (PCR). Clonal relationships between isolates were examined by the PFGE method. Of the 60 patients, 34 (56.7%) were male and 26 (43.3%) were female. The strains were isolated from tracheal aspirate (75%), blood (18%), wound (5%) and sputum (2%) samples. The majority of isolates were obtained from General (73.3%), Anesthesiology (15%), Surgery (5%), Internal Medicine (3.3%), COVID-19 (1.7%) and Cardiovascular Surgery (1.7%) ICUs. In the sensitivity tests performed with the Vitek 2 system, the most effective antibiotics were found to be colistin (100%), trimethoprim/sulfamethoxazole (36.67%), and amikacin (23.33%). The disk diffusion method revealed that the isolates were 100% resistant to imipenem, meropenem, gentamicin, amikacin, cefepime, ceftazidime, piperacillin-tazobactam, netilmicin, and tigecycline. Genetic analysis revealed that 52 isolates (86.6%) carried the blaOXA-51 gene, and 55 isolates (91.6%) carried the blaOXA-23 gene. However, the blaOXA-40 and blaOXA-58 genes were not detected in any of the isolates. In the clonal relationship analysis, the cluster similarity rate was 71%, and high clonal relationship rates of up to 99.4% were detected between genotypes within clusters. These findings demonstrate that CRAB isolates exhibit a high resistance profile both phenotypically and molecularly, with carbapenemase genes being widely distributed.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    1004370

    Karbapeneme dirençli Acinetobacter baumannii bakteriyemisi saptanan hastalarda tedavi protokollerinin ve direnç profillerinin klinik sonlanıma etkisinin araştırılması

    Investigation of the impact of treatment protocols and resistance profiles on clinical outcomes in patients with carbapenem-resistant Acinetobacter baumannii bacteremia

    MUHAMMED CİHAN IŞIK

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2025

    Enfeksiyon Hastalıkları ve Klinik MikrobiyolojiHacettepe Üniversitesi

    Enfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. MELİHA ÇAĞLA SÖNMEZER

  2. Tez No

    259

    İzmir'de Mustafa Kemal Bulvarı'nın peyzaj mimarlığı açısından etüdü ve peyzaj projesi

    Başlık çevirisi yok

    ENGİN ALPARSLAN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    1985

    Peyzaj MimarlığıEge Üniversitesi

    Peyzaj Mimarlığı Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. ÜMİT ERDEM

  3. Tez No

    263

    Samsun ve çevresinde tarla sarmaşığı (conuolvulus arvensis L.)'na karşı biyolojik savaşa esas olacak fauna tespiti

    Investigations on the insect fauna of the field binweed (Conuolvulus arvensis L.) related to its biological control in Samsun Province

    YASEMİN UFUK GERMAN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    1985

    BotanikEge Üniversitesi

    Bitki Koruma Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. NİYAZİ LODOS

  4. Tez No

    17

    Baba yoksunluğunun benlik kavramına etkisi ve babasız öğrencilerin problemlerinin hangi alanlarda yoğunlaştığının saptanması

    Başlık çevirisi yok

    OYA GÜNGÖRMÜŞ

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    1986

    Çocuk Sağlığı ve Hastalıklarıİstanbul Üniversitesi

    Gelişim Psikolojisi Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. AYSEL EKŞİ

  5. Tez No

    266

    Ege bölgesi keçi liflerinin bazı önemli fiziksel, kimyasal özellikleri ve değerlendirme imkanları

    Başlık çevirisi yok

    NİLÜFER ERDEM

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    1985

    Tekstil ve Tekstil MühendisliğiEge Üniversitesi

    Tekstil Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. GÜLSEREN YAZICIOĞLU

Geri Dön