Geri Dön

Glioblastomda kanser sinyal yolaklarının araştırılması ve IITZ-01 inhibitör etkinliğinin incelenmesi

Investigation of cancer signaling pathways in glioblastoma and investigation of IITZ-01 inhibitory efficacy

PDF İndir

  1. Tez No: 928194
  2. Yazar: FATMAGÜL KUŞKU ÇABUK
  3. Danışmanlar: PROF. DR. YUSUF TUTAR
  4. Tez Türü: Doktora
  5. Konular: Moleküler Tıp, Molecular Medicine
  6. Anahtar Kelimeler: Apoptoz, Anjiyogenez, Çoklu Gen Analizi, DNA Hasarı Ve Onarımı, Glioblastom, Kanser Sinyal Yolakları, Temozolamid, IITZ-01, Apoptosis, Angiogenesis, Cancer signaling pathways, DNA damage and repair, Glioblastoma, Multiple gene analysis, Temozolomide, IITZ-01
  7. Yıl: 2025
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Sağlık Bilimleri Üniversitesi
  10. Enstitü: Hamidiye Sağlık Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Moleküler Tıp Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Moleküler Tıp Bilim Dalı
  13. Sayfa Sayısı: 133

Özet

Amaç: Glioblastom (GBM) yetişkinlerdeki en sık görülen malign beyin tümörüdür. Derece 4 bir tümör olup diffüz gelişim paterni nedeniyle cerrahi olarak tam rezeksiyonu mümkün olmamaktadır. En etkin tedavisi cerrahi sonrası Temozolamid (TMZ) ve Radyoterapi (RT) kombine şekilde uygulanmaktadır. Bu tedaviye rağmen yaşam süresi ortalama 12-15 ay gibi oldukça kısadır.. Bu çalışmada amacımız GBM hücre hattında (LN229) klinik ilaç TMZ ve otofajik inhibitör bir ajan olan IITZ-01'in etkilerini moleküler düzeyde araştırmaktır. Gereç ve Yöntem: Çalışmamızda LN229 hücre hattına TMZ ve IITZ-01 ayrı ayrı uygulanarak 48. saatte MTT yöntemi ile canlılık oranları ve IC50 değerleri tespit edildi. İnsan fibroblast (CCD-1072) hücre hücre hattında IITZ-01 molekülün canlılık oranları ve IC50 değerleri aynı yöntemle belirlenerek seçicilik indeksi (SI) hesaplandı. RNA izolasyonu sonrası cDNA (komplementer deoksiribonükleik asit) sentezlenerek, RT-qPCR (gerçek zamanlı kantitatif polimeraz zincir reaksiyonu) ile kanser yolak analizleri yapıldı. İlaçların apoptoz üzerine etkilerinin ve hücrelerde hücre döngü analizlerinin yapılabilmesi için de Anneksin V analizlerinin yapıldığı flow sitometrisi kullanıldı. Hücrelerin DNA, sitozol ve mitokondri boyaları ile görüntülemeleri alındı. Bulgular: LN229 hücreler önerildiği şekilde çoğaltılarak pasajalandı ve MMT canlılık analizleri sonrası 48. Saat inkübasyonda IC50 oranları belirlendi. TMZ için 424±115,3 µM, IITZ-01 için 2,897±0,44 µM olarak saptanmıştır. IITZ-01 molekülü için CCD-1072 hücre hattında MMT deneyleri uygulandığında IC50 değerleri 7,34±0,5 µM saptandı. IITZ-01 molekülünün SI 2,53 saptandı ve güvenlik düzeyi 2'nin üzerinde olması nedeniyle bu molekülün tedavi edici etkinliği için kabul edilebilir düzeyde olduğu belirlendi. RT-qPCR yöntemiyle kanser yolak genleri analizinde 92 genin ekspresyonları incelendi ve ayrıntılı kanser yolak analizleri yapıldı. Sonuç: Yolak analizine göre özellikle TMZ'in uygulandığı hücrelerde apoptoz ile ilişkili genlerden apoptozu tetiklediği, IITZ-01'in anjiogenezi baskıladığı ortaya çıkmıştır. IITZ-01 molekülünün TMZ ilacına kombine kullanımının TMZ ilacının gücünü arttırabileceği düşünülmüştür.

Özet (Çeviri)

Aim: Glioblastoma (GBM) is the most common malignant brain tumor in adults. As a grade 4 tumor, complete surgical resection is not possible due to its diffuse growth pattern. The most effective treatment involves a combination of surgery, temozolomide (TMZ), and radiotherapy (RT). Despite this treatment, the average survival time is only 12-15 months. The aim of this study is to investigate the molecular effects of the clinical drug TMZ and the autophagic inhibitor IITZ-01 on the GBM cell line (LN229). Materials and Methods: In this study, TMZ and IITZ-01 were separately applied to the LN229 cell line, and cell viability and IC50 values were determined at the 48th hour using the MTT assay. The viability rates and IC50 values of the IITZ-01 molecule were also determined in the human fibroblast cell line (CCD-1072) using the same method, and the selectivity index (SI) was calculated. After RNA isolation, cDNA (complementary deoxyribonucleic acid) was synthesized, and cancer pathway analyses were performed using RT-qPCR (real-time quantitative polymerase chain reaction). Annexin V analysis with flow cytometry was used to assess the effects of the drugs on apoptosis and cell cycle analysis in cells. Imaging of the cells with DNA, cytosol, and mitochondrial stains was also performed. Results: N229 cells were propagated and passaged as recommended, and IC50 values were determined after 48 hours of incubation with MTT viability assays. The IC50 values were 424±115.3 µM for TMZ and 2.897±0.44 µM for IITZ-01. When MTT experiments were applied to the CCD-1072 cell line with the IITZ-01 molecule, IC50 values were found to be 7.34±0.5 µM. The SI of the IITZ-01 molecule was determined to be 2.53, indicating that its therapeutic efficacy is acceptable as the safety level is above 2. Cancer pathway analysis of 92 genes was performed with RT-qPCR, providing detailed insights into the cancer pathways. Conclusion: Pathway analysis revealed that TMZ-induced apoptosis-related genes were activated, while IITZ-01 inhibited angiogenesis. The combination of IITZ-01 with TMZ is thought to enhance the efficacy of TMZ.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    753249

    Psikoaktif maddelerden mefedronun antikolinerjik etkinliğinin in vitro araştırılması

    In vitro investigation of anticholinergic efficacy of mephedrone, a psychoactive substance

    BEGÜM YURDAKÖK DİKMEN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2022

    Adli TıpAnkara Üniversitesi

    Disiplinlerarası Adli Bilimler Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. HALİT SİNAN SÜZEN

  2. Tez No

    949703

    UCPH 101'in seryum oksit ile hidrotermal sentezin glioblastoma multiforme üstündeki anti kanser moleküler yolaklarının araştırılması

    Investigation of the anticancer molecular pathways of UCPH 101 combined with cerium oxide via hydrothermal synthesis on glioblastoma multiforme

    ZEHRA DİCLE EREN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2025

    Eczacılık ve FarmakolojiVan Yüzüncü Yıl Üniversitesi

    Eczacılık Meslek Bilimleri Ana Bilim Dalı

    DR. ÖĞR. ÜYESİ KEMAL ALP NALCI

  3. Tez No

    941178

    Exploring molecular mechanisms that underlie regulation of transcription factor NFIB by the peptidyl prolyl isomerase pin1

    NFIB transkripsiyon faktörünün peptidil prolil isomeraz PIN1 tarafından regülasyonunun moleküler mekanizmalarının araştırılması

    SİNEM SARITAŞ ERDOĞAN

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2025

    Biyokimyaİstanbul Teknik Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji-Genetik ve Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. ASLI KUMBASAR

  4. Tez No

    604558

    Primer glioblastoma tümörlerinde long non coding RNA MALAT1'in prognostik öneminin araştirilmasi

    Investigation of the prognostic importance of long non coding RNA MALAT1 in primary glioblastoma tumors

    ÖMER GÖKAY ARGADAL

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2019

    GenetikBursa Uludağ Üniversitesi

    Beyin ve Sinir Cerrahisi Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. HASAN KOCAELİ

  5. Tez No

    935369

    Glioblastoma hücrelerinde sinir büyüme faktörünün PAK4 regülasyonu üzerindeki etkisinin araştırılması

    Investigation of the effect of nerve growth factor on PAK4 regulation in glioblastoma cells

    SULTAN ÇELİK

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2025

    Bilim ve TeknolojiNecmettin Erbakan Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. SURAY PEHLİVANOĞLU

Geri Dön