Mikrobiyota kaynaklı biyoaktif postbiyotiklerin aşı adjuvanı olarak kullanım potansiyellerinin belirlenmesi
Determination of the potential use of microbiota-derived bioactive postbiotics as vaccine adjuvants
- Tez No: 931439
- Danışmanlar: PROF. DR. FADİME KIRAN
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Biyoloji, Biology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2025
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Ankara Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Bu tez çalışmasının amacı, mikrobiyota kaynaklı biyoaktif postbiyotiklerin (MKBP'lerin) aşı adjuvanı olarak kullanım potansiyelini belirlemektir. Bu kapsamda, Lactiplantibacillus plantarum EIR/IF-1, Limosilactobacillus reuteri EIR/Spx-2, Pediococcus pentosaceus EIR/HM-1 ve Weissella cibaria EIR/P-1 suşları MKBP üreticisi olarak kullanılmıştır. Bakterilerinden bakteriyel hücresiz süpernatantlar (BHS), hücre dışına salınan veya hücre duvarında bulunan ekzopolisakkaritler (EPS-r ve EPS-b) ve bakteriyel ekstraselüler veziküller (BEV) elde edilmiş ve RAW264.7 makrofaj hücrelerinde sitotoksik etki sergilemeyen dozları MTT analizi neticesinde belirlenmiştir. MKBP'lerin immunostimülant etkileri ELİZA, qRT-PZR, akış sitometrisi ve nitrik oksit analizi neticesinde Escherichia coli kaynaklı lipopolisakkarit (LPS) ile karşılaştırılarak değerlendirilmiştir. Elde edilen veriler neticesinde L. plantarum EIR/IF-1 kaynaklı EPS-r (100 µg/mL) ile L. reuteri EIR/Spx-2 kaynaklı BEV'lerin (25 µg/mL) LPS ile karşılaştırıldığında adjuvan adayı olarak kullanılabilecekleri belirlenmiştir. Karakterizasyon analizleri neticesinde farklı iki fraksiyon sergileyen (51 ve 841 kDa) EPS-r'nin heteropolisakkarit olduğu tespit edilmiştir. BEV'in boyut aralığı 55-228 nm, konsantrasyonu ise 5.24×10⁷ partikül/mL olarak belirlenmiştir. Tez çalışmasının ikinci bölümünde, MKBP üreticisi bakterilerin bağışıklık düzenleyici etkileri in vivo koşullarda belirlenmiştir. Bakterilerle 21 gün süresince her gün beslenen farelerin kolon ve ileum dokularında pro-inflamatuvar gen ifadelerinde azalma, TLR4, NOD1, musin gen ifadeleri ile bağırsak bariyer bütünlüğünün korunmasında kritik rol oynayan ZO1 gen ifadesinde artış belirlenmiştir. Fekal mikrobiyota analizleri neticesinde ise Akkermansia muciniphila'da artış gözlemlenmiştir. Sonuç olarak, L. plantarum EIR/IF-1 bakterisinden elde edilen EPS-r ve L. reuteri EIR/Spx-2 bakterisinden elde edilen BEV'in immünostimülant özellikleri nedeniyle terapötik aşı uygulamaları için uygun, güvenli ve etkili birer potansiyel adjuvan adayı olabilecekleri, bu MKBP'leri üreten bakterilerin ise bağışıklık sistemini düzenleyici etkileri ile önemli probiyotik adaylar olarak değerlendirilebileceği öngörülmüştür.
Özet (Çeviri)
The aim of this thesis is to evaluate the potential of microbiota-derived bioactive postbiotics (MDBPs) as vaccine adjuvants. In this context, Lactiplantibacillus plantarum EIR/IF-1, Limosilactobacillus reuteri EIR/Spx-2, Pediococcus pentosaceus EIR/HM-1, and Weissella cibaria EIR/P-1 strains were used as producers of MDBPs. Bacterial cell-free supernatants (BCFS), exopolysaccharides released from the cells (EPS-r) or found in the cell wall (EPS-b), and bacterial extracellular vesicles (BEVs) were harvested from the bacteria. The doses that did not exhibit cytotoxic effects on RAW264.7 macrophage cells were determined via MTT analysis. The immunostimulatory effects of MDBPs were assessed by comparison with lipopolysaccharide (LPS) from Escherichia coli, using ELISA, qRT-PCR, flow cytometry, and nitric oxide analysis. The results indicated that EPS-r (100 µg/mL) from L. plantarum EIR/IF-1 and BEV (25 µg/mL) from L. reuteri EIR/Spx-2 could serve as potential adjuvant candidates when compared to LPS. Characterization analysis revealed that EPS-r, which exhibited two different fractions (51 and 841 kDa), was a heteropolysaccharide. The size range of BEVs was found to be 55-228 nm, with a concentration of 5.24×10⁷ particles/mL. In the second part of the thesis, the immunoregulatory effects of the MDBPs-producing bacteria were evaluated under in vivo conditions. In the colon and ileum tissues of mice that were fed the bacteria daily for 21 days, a decrease in pro-inflammatory gene expression, as well as an increase in the expression of TLR4, NOD1, mucin genes, and ZO1, which plays a critical role in maintaining intestinal barrier integrity, were observed. Fecal microbiota analyses revealed an increase in Akkermansia muciniphila. In conclusion, EPS-r derived from L. plantarum EIR/IF-1 and BEVs derived from L. reuteri EIR/Spx-2 were predicted to be safe and effective potential adjuvant candidates for therapeutic vaccine applications, owing to their immunostimulatory properties. Moreover, these MDBPs-producing bacteria may also be considered as important probiotic candidates due to their immunoregulatory effects.
Benzer Tezler
- Çocuklarda ve erişkinlerde hastalık yapan aeromonas hydrophila ve enterobacterin AH besiyerinde izolasyonu
Isolation in AH media of aeromonas hydrophila and enterobacter which cause diseases in children and adults
LALE ÇANKAYA
Yüksek Lisans
Türkçe
1989
MikrobiyolojiGazi ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. GÜVEN URAZ
- Yerli sucuklarımızın pastörize olarak üretilmeleri üzerine araştırmalar
Başlık çevirisi yok
MUSTAFA TAYAR
Doktora
Türkçe
1989
Gıda MühendisliğiUludağ ÜniversitesiBesin Hijyeni ve Teknolojisi Ana Bilim Dalı
PROF. DR. YALÇIN YILDIRIM
- Su kesesi erken açılan gebelerde biofizik profil ile infeksiyon gelişmesi arasındaki ilişkinin araştırılması
Başlık çevirisi yok
H.FARUK BUYRU
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
1990
Kadın Hastalıkları ve Doğumİstanbul ÜniversitesiKadın Hastalıkları ve Doğum Ana Bilim Dalı
- Ankara'nın bazı bölgelerindeki yeraltı sularında enterik bakterilerin aranması
Başlık çevirisi yok
ABBAS YOUSEFİ RAD
- Seydişehir-Hadim-Sandıklı yöresi kambriyen kayaçlarının asit kalıntısı mikrofaunası
Başlık çevirisi yok
TÜLİN ERDEM