Structural and functional studies of trag from the F plasmid and the major pilin from coxiella burnetii
F plazmidinden trag ve coxiella burnetii'den elde edilen ana pilinin yapisal ve fonksiyonel çalişmalari
- Tez No: 937853
- Danışmanlar: DR. GERALD F. AUDETTE
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyokimya, Biochemistry
- Anahtar Kelimeler: Biyokimya eğitimi, Biochemistry education
- Yıl: 2016
- Dil: İngilizce
- Üniversite: York Unıversıty
- Enstitü: Yurtdışı Enstitü
- Ana Bilim Dalı: Kimya Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Biyokimya Bilim Dalı
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Escherichia coli F-plazmidi, başarılı DNA transferini aracı olan konjugatif mekanizmasının montajı için gerekli tüm genleri barındırır. TraG, konjugatif transferi aracı oldugu bilinen F-plazmidinin transfer (tra) bölgesinde kodlanan en büyük proteinlerden biridir (102 kDa). TraG'nin N-terminal bölgesinin pilus sentezinde ve montajında rol aldığı bilinirken, C-terminal periplazmik alanı plazmid-spesifik giriş dışlama ve çiftleşme çifti stabilizasyonu için gereklidir. TraG'nin işlevine ilişkin yapısal içgörüler sağlamak için, TraG'nin C-terminal bölgesinin (TraG*, 52,7 kDa olarak adlandırılır) saflaştırdık ve kristalizasyon çalışmalarını başlattık ve TraG*'nin ilk kristallerini elde ettik. Sıvı kromatografisi ile birleştirilmiş kütle spektrometrisi (LC-MS), boyut dışlama kromatografisi ile birleştirilmiş çok açılı ışık saçılması (SEC-MALS) ve protein jel elektroforezi kullanılarak TraG*'nin fonksiyonel ve dinamik karakterizasyonu üzerine yaptığımız deneyler, TraG* kristalleşme stratejilerinin yanı sıra konjugasyon sırasında olası TraG etki mekanizması hakkında önemli bilgiler edindik.
Özet (Çeviri)
The Escherichia coli F-plasmid houses all genes necessary for the assembly of its conjugative machinery to facilitate successful DNA transfer. TraG is one of the largest proteins (102 kDa) encoded in the transfer (tra) region of the F-plasmid that is known to facilitate conjugative transfer. The N-terminal region of TraG is known to be involved in pilus synthesis and assembly, while the C-terminal periplasmic domain is required for plasmid-specific entry exclusion and mating pair stabilization. In order to provide structural insights into TraG's function,we have expressed, purified and initiated crystallization studies of the C-terminal region of TraG (designated TraG*, 52.7 kDa) and have obtained initial crystals of TraG*. Our experiments on functional and dynamic characterization of TraG* using liquid chromatography coupled mass spectrometry (LC-MS), size exclusion chromatography coupled multi-angle light scattering (SEC- MALS) and protein gel electrophoresis has given significant insight into TraG* crystallization strategies as well as potential TraG mechanism of action during conjugation.
Benzer Tezler
- Doğuştan kalça çıkıklı hastalarda kalça patolojilerinin bilgisayarlı tomografi ile değerlendirilmesi
Başlık çevirisi yok
NECDET ŞÜKRÜ ALTUN
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
1987
Ortopedi ve TravmatolojiGazi ÜniversitesiOrtopedi ve Travmatoloji Ana Bilim Dalı
PROF.DR. ORHAN ASLANOĞLU
- Dokuma kumaşlarda örgü tipinin ham kumaşın boyutları ve geometrik özellikleri üzerindeki etkilerinin araştırılması
Başlık çevirisi yok
EMEL ÖNDER
Yüksek Lisans
Türkçe
1985
Tekstil ve Tekstil MühendisliğiEge ÜniversitesiTekstil Mühendisliği Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. GÜNGÖR BAŞER
- Vecihi Bey'in hikayelerinde fiktif yapı
Başlık çevirisi yok
MEHMET ÖNAL
Yüksek Lisans
Türkçe
1985
Türk Dili ve EdebiyatıGazi ÜniversitesiTürk Dili ve Edebiyatı Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. SADIK TURAL
- Plazma arkı eldesi ve yüzey bölgesi modifikasyonunda kullanılabilirliği
Başlık çevirisi yok
ÖZKAN ÖZİPEKLİLER
Yüksek Lisans
Türkçe
1986
Makine MühendisliğiUludağ ÜniversitesiMakine Mühendisliği Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. HALİM DEMİRCİ
- Enez kili ve asitle etkileşmesinin kristal yapı bakımından x-ışını kırınım yöntemi ile incelenmesi
Başlık çevirisi yok
NEZİHE ÇALIŞKAN
Doktora
Türkçe
1986
Fizik ve Fizik Mühendisliğiİnönü ÜniversitesiFizik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. NİZAMETTİN ARMAĞAN