Geri Dön

Küçük hücreli dışı akciğer kanseri hastalarında TET2 Geni, hsa-miR-22-3p VE lncRNA-TUG1 ekspresyon düzeylerinin araştırılması

Investigation of TET2 Gene, hsa-miR-22-3p AND lncRNA-TUG1 expression levels in non-small cell lung cancer patients

PDF İndir

  1. Tez No: 939789
  2. Yazar: İREM YELESER
  3. Danışmanlar: PROF. DR. MEHMET EMİN ERDAL
  4. Tez Türü: Doktora
  5. Konular: Tıbbi Biyoloji, Medical Biology
  6. Anahtar Kelimeler: Akciğer kanseri, Epigenetik, ceRNA, miRNA, lncRNA, Lung cancer, Epigenetics, ceRNA, miRNA, lncRNA
  7. Yıl: 2025
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Mersin Üniversitesi
  10. Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Tıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.

Özet

Tüm Dünya'da en sık görülen kanser çeşitlerinden biri olan akciğer kanseri, küçük hücreli akciğer kanseri ve küçük hücreli dışı akciğer kanseri olarak iki ana kategoride incelenir. Adenokarsinom ve skuamöz hücreli karsinom ise küçük hücreli dışı akciğer kanserinin en yaygın iki türüdür. 26'sı adenokarsinom ve 23'ü skuamöz hücreli karsinom tanılı olan toplamda 49 primer akciğerli hastaya ait tümör dokusu ve bu hastaların tümörlü akciğer dokularının yakınlarında yer alan sağlıklı akciğer dokuları ile oluşturulan kontrol grubunda (49 örnek) TET2, hsa-miR-22-3p ve lncRNA-TUG1 olmak üzere mRNA-miRNA-lncRNA şeklinde bir ceRNA ağının ekspresyon düzeylerinin analiz edildiği çalışmamızın örneklem grubunu 2010-2020 tarihleri arasında Mersin Üniversitesi Tıp Fakültesi Cerrahi Tıp Bilimleri Bölümü Patoloji Anabilim Dalı arşivine kaldırılmış doku örnekleri oluşturmaktadır. Çalışmamızın deney basamaklarında sırasıyla parafin dokudan total RNA izolasyonu, cDNA sentezi ve Real-Time PCR analizi gerçekleştirildi. Karşılaştırmalı CT (ΔΔCT) yöntemi aracılığıyla TET2, hsa-miR-22-3p ve lncRNA-TUG1 için ekspresyon analizi yapıldı ve elde edilen ekspresyon düzeyleri adenokarsinom hasta- adenokarsinom kontrol, skuamöz hücreli karsinom hasta- skuamöz hücreli karsinom kontrol ve adenokarsinom hasta-skuamöz hücreli karsinom hasta gruplarında istatistiksel olarak analiz edildi. İstatistiksel analiz için Paired t testi, Wilcoxon testi, Student t testi, Mann-Whitney U testi ile Fisher Exact testi uygulandı ve p<0.05 olduğu durumlar istatistiksel anlamlılık olarak kabul edildi. Çalışmamız sonucunda adenokarsinom hasta ve kontrol grubu arasında hsa-miR-22-3p ile lncRNA-TUG1 için; adenokarsinom ve skuamöz hücreli karsinom grupları arasında ise yalnızca hsa-miR-22-3p için istatistiksel olarak anlamlı bir farkın olduğu belirlendi (p<0.05). Ek olarak iki hasta grubu arasında yaş değerleri bakımından istatistiksel olarak anlamlı bir farklılık tespit edildi (p<0.05). Sonuç olarak çalışmamıza ait veriler ile adenokarsinom ve skuamöz hücreli karsinomun seçilen ceRNA ağını hangi seviyede eksprese ettiği ve birbirini ayırt etmede kullanılabilecek bir ceRNA ağının varlığı anlaşılmaya çalışıldı. Edindiğimiz her bir sonucun akciğer kanserinde RNA çalışmaları, akciğer kanseri genetik ve epigenetik alt yapısının aydınlatılması için bir kaynak olacağını düşünüyoruz.

Özet (Çeviri)

Lung cancer, one of the most common types of cancer in the world, is examined in two main categories as small cell lung cancer and non-small cell lung cancer. Adenocarcinoma and squamous cell carcinoma are the two most common types of non-small cell lung cancer. The sample group of our study, in which the expression levels of a ceRNA network in the form of mRNA-miRNA-lncRNA, including TET2, hsa-miR-22-3p and lncRNA-TUG1, were analyzed in a total of 49 primary lung patients, 26 of whom were diagnosed with adenocarcinoma and 23 with squamous cell carcinoma, and in a control group (49 samples) formed with healthy lung tissues located near the tumoral lung tissues of these patients, constituted the tissue samples that were archived in the Pathology Department of the Department of Surgical Medical Sciences of Mersin University Faculty of Medicine between 2010-2020. In the experimental steps of our study, total RNA isolation from paraffin tissue, cDNA synthesis and Real-Time PCR analysis were performed, respectively. Expression analysis was performed for TET2, hsa-miR-22-3p and lncRNA-TUG1 via comparative CT (ΔΔCT) method and the obtained expression levels were statistically analyzed in adenocarcinoma patient- adenocarcinoma control, squamous cell carcinoma patient- squamous cell carcinoma control and adenocarcinoma patient- squamous cell carcinoma patient groups. Paired t test, Wilcoxon test, Student t test, Mann-Whitney U test and Fisher Exact test were applied for statistical analysis and p<0.05 was accepted as statistical significance. As a result of our study, for hsa-miR-22-3p and lncRNA-TUG1 between adenocarcinoma patient and control groups; There was a statistically significant difference between the adenocarcinoma and squamous cell carcinoma groups only for hsa-miR-22-3p (p<0.05). In addition, a statistically significant difference was found between the two patient groups in terms of age values (p<0.05). As a result, with the data of our study, we tried to understand the level at which adenocarcinoma and squamous cell carcinoma express the selected ceRNA network and the existence of a ceRNA network that can be used to distinguish each other. We believe that each result we obtain will be a source for RNA studies in lung cancer and for the elucidation of the genetic and epigenetic substructure of lung cancer.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    310264

    Küçük hücreli dışı akciğer kanseri hastalarında kilo kaybında adipokinlerin rolü ve sistemik inflamasyonla ilişkisi

    The role of adipokines in weight loss and their relation with systemic inflammation in non-small cell lung cancer patients

    ŞULE TAŞ GÜLEN

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2011

    Göğüs HastalıklarıAdnan Menderes Üniversitesi

    Göğüs Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. FİSUN KARADAĞ

  2. Tez No

    319021

    Küçük hücreli dışı akciğer kanseri hastalarında HSP90a gen varyantlarının araştırılması

    Invesgation of HSP90a gene variants in non-small cell lung cancer patients

    NERGİZ AKKAYA

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2012

    Biyokimyaİstanbul Üniversitesi

    Moleküler Tıp Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. İLHAN YAYLIM

  3. Tez No

    347615

    Küçük hücreli dısı akciğer kanseri hastalarında RRM1, RRM2, ERCC2 gen polimorfizmleri ve serum 8-OHG ve LHD düzeylerinin hastalığın riski ve prognozu üzerine etkilerinin arastırılması

    Investigation of the effects of RRM1, RRM2, ERCC2 gene polymorphisms and serum 8-OHDG levels on disease risk and prognosis in nsclc patients

    ENDER MEHMET ÇOŞKUNPINAR

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2013

    Moleküler Tıpİstanbul Üniversitesi

    Moleküler Tıp Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. İLHAN YAYLIM

  4. Tez No

    360071

    Küçük hücreli dışı akciğer kanseri hastalarında serum bazlı miR221 ve miR222 nin biobelirteç olarak kullanımının araştırılması

    Investigation of miR221 and miR222 as a biomarker in non small cell lung cancer (NSCLC)

    YASEMİN MÜŞTERİ OLTULU

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2014

    Onkolojiİstanbul Üniversitesi

    Deneysel Tıp Araştırma Bölümü

    PROF. DR. İLHAN YAYLIM ERALTAN

  5. Tez No

    422707

    Küçük hücreli dışı akciğer kanseri hastalarında egfr mutasyon durumu ile klinikopatolojik özelliklerin korelasyonu

    Relationship of epidermal growth factor receptor gene mutations, clinicopathologic features in patients with non-small cell lung cancer

    OLÇUN ÜMİT ÜNAL

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2012

    OnkolojiDokuz Eylül Üniversitesi

    İç Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. İLHAN ÖZTOP

Geri Dön