Whole genome DNA copy number analysis of circulating cell-free DNA as a biomarker for early detection of lung cancer; statistical data analysis
Akciğer kanserinin erken teşhisi için biyomarker olarak dolaşımdaki hücresiz DNA'nın tüm genom DNA kopya sayısı analizi; istatistiksel veri analizi
- Tez No: 939957
- Danışmanlar: PROF. DR. ANGELA COX
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Onkoloji, Biyoistatistik, Oncology, Biostatistics
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2020
- Dil: İngilizce
- Üniversite: The Unıversıty Of Sheffıeld
- Enstitü: Yurtdışı Enstitü
- Ana Bilim Dalı: Translasyonel Tıp Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Translasyonel Onkoloji Bilim Dalı
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Akciğer kanseri dünya çapında çok yaygındır ve vakaların çoğu geç aşamada teşhis edilir, bu aşamada tedavinin başarılı olma olasılığı düşüktür. Düşük doz bilgisayarlı tomografi, akciğer tümörlerini tespit etmek için kullanılır. Bu tarama teknolojisi mortaliteyi azaltmasına rağmen, radyasyon ve yanlış pozitif sonuçlar nedeniyle bazı dezavantajları vardır. Bu nedenle, akciğer kanserini erken aşamada tespit etmek için alternatif, daha iyi ve invaziv olmayan bir yöntem bulmamız gerekmektedir. Bu amaçla, ana hipotezimiz cfDNA'daki CNA'ların akciğer kanseri için iyi bir biyomarker olduğu yönündedir. Erken teşhis için biyomarker olarak CNA'ların potansiyelini ve etkinliğini araştırmayı amaçladık ve yüksek riskli kontrol ve vaka gruplarını karşılaştırarak erken evre akciğer kanserinin tespiti için dolaşımdaki hücresiz DNA (cfDNA) konsantrasyonunu ve cfDNA'daki kopya sayısı değişikliklerini (CNA'lar) araştırdık. Bu istatistiksel veri analizi projesinde, STATA yazılımını kullanarak Mann Whitney U testi, lojistik regresyon, ROC ve sağkalım analizi gerçekleştirdik. Vaka grubu daha yüksek cfDNA ve CNA düzeylerine sahipti ve bu iki faktör, akciğer tümörleri gelişme riski ve akciğer kanseri mortalitesi ile ilişkiliydi. Ayrıca, CNA'lar, ROC analizinde cfDNA konsantrasyonuna kıyasla daha iyi duyarlılık ve özgüllük düzeylerine sahipti. Tüm analizleri dikkate alarak, bu çalışmada, CNA'ların cfDNA konsantrasyonundan daha iyi bir erken evre akciğer kanseri biyomarkeri olabileceğini bulduk.
Özet (Çeviri)
Lung cancer is very common around the world and the majority of cases are diagnosed at a late stage, by which time treatment is less likely to be successful. Low-dose computed tomography is used to detect lung tumours. Although this screening technology reduces mortality, there are still some disadvantages due to radiation and false positive results. Therefore, we need to find an alternative, better and non-invasive method to detect lung cancer at an early stage. For this purpose, our main hypothesis is that CNAs in cfDNA is a good biomarker of lung cancer. We aim to investigate potential and effectiveness of CNAs as a biomarker for early detection, and we investigated circulating cell-free DNA (cfDNA) concentration and copy number alterations (CNAs) in cfDNA for detection of early stage lung cancer by comparing high-risk control and case groups. In this statistical data analysis project, we carried out the Mann Whitney U test, logistic regression, ROC and survival analysis using STATA software. The case group had higher levels of cfDNA and CNAs, and these two factors were related to the risk of developing of lung tumours and mortality of lung cancer. Moreover, CNAs had better the levels of sensitivity and specificity compared to cfDNA concentration in ROC analysis. Taking account of all analyses, in this study, we found that CNAs might be a better biomarker to detect lung cancer at early stage than cfDNA concentration.
Benzer Tezler
- Testosteron dihidrotestosteron ve östrojenin benign prostat hiperplazisindeki etyolojik rolleri
The roles of testosterone, dihydrotestosterone and estradiole on the etiology of benign prostatic hyperplasia
HALUK TOKUÇOĞLU
- Eksternal etmoidektomiler
Başlık çevirisi yok
ERCÜMENT AKMAN
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
1987
Kulak Burun ve BoğazGazi ÜniversitesiKulak Burun Boğaz Ana Bilim Dalı
PROF.DR. NECMETTİN AKYILDIZ
- Sanayi politikaları ve planlı dönemde imalat sanayine etkileri
Başlık çevirisi yok
AHMET CAFOĞLU
Yüksek Lisans
Türkçe
1986
EkonomiGazi ÜniversitesiEndüstri Mühendisliği Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. YALÇIN EROL
- Pulmoner hipertansiyon etyopatogenezinde prostasiklin ve lökotrien C4'ün rolü
Possible role of leukotrien C4 and prostacyclin in the development of pulmonary hypertension
ÜLKÜ AYBERK
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
1987
Çocuk Sağlığı ve HastalıklarıGazi ÜniversitesiÇocuk Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı
- Gebelik ve doğum olgularında prolaktin düzeylerinin değerlendirilmesi
The Evaluation of prolactin values during pregnancy labour and in deliveries
TÜLİN AKAN
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
1987
Kadın Hastalıkları ve DoğumGazi ÜniversitesiKadın Hastalıkları ve Doğum Ana Bilim Dalı
DOÇ.DR. MÜLAZIM YILDIRIM