Cevizde (Juglans regia L.) çinko ve bakır konsantrasyonlarıyla ilişkili genlerin GWAS analizi ile belirlenmesi
Identification of genes associated with zinc and copper concentrations in walnut (Juglans regia L.) by GWAS analysis
- Tez No: 951071
- Danışmanlar: DOÇ. DR. DUYGU ATEŞ
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyomühendislik, Bioengineering
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2025
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Ege Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyomühendislik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Biyomühendislik Bilim Dalı
- Sayfa Sayısı: 64
Özet
Bu çalışmada, 154 farklı ceviz (Juglans regia L.) genotipinde genetik ve fenotipik analizler gerçekleştirilmiştir. Çinko (Zn) besin elementi konsantrasyonlarının 1,61 ve 8,98 mg/100 g arasında, bakır (Cu) besin elementi konsantrasyonlarının ise 0,12 ve 0,38 mg/100 g arasında değiştiği belirlenmiştir. Genom Çapında İlişki Analizi (GWAS) için Çeşitlilik Dizisi Teknolojisi (DArT) kullanılarak toplam 16.473 Tek Nükleotid Polimorfizmi (SNP) üretilmiştir. Zn elementi ile ilişkili markörlerin tespitinde, Q + K modelini içeren Karma Doğrusal Model (MLM) kullanılmış ve 2021 yılında yedi, 2022 yılında ise dört ilişkili SNP belirlenmiştir. Aynı model kullanılarak yapılan analizlerde, Cu elementi ile ilişkili olarak 2021 yılında iki, 2022 yılında ise üç SNP tespit edilmiştir. Bu çalışmada saptanan markörlerin, farklı ceviz genotiplerindeki Zn ve Cu seviyeleri ile anlamlı düzeyde ilişkili olduğu ortaya konmuştur. Bağlantılı SNP dizileri ile homoloji gösteren sekanslar incelenerek Zn elementi için bir potansiyel aday gen belirlenmiştir. Zn ve Cu ile ilişkili SNP'lerin, ceviz ıslah programlarında bu elementlerin seçilmesine yönelik olarak etkin bir şekilde kullanılabileceği öngörülmektedir.
Özet (Çeviri)
A total of 154 walnut genotypes were analyzed in the study. Micronutrient concentrations of zinc (Zn) ranged from 1.61 to 8.98 mg/100 g, and copper (Cu) concentrations varied between 0.12 and 0.38 mg/100 g. Precisely 16,473 Single Nucleotide Polymorphisms (SNPs) were generated using Diversity Array Technology (DArT) for Genome-Wide Association Studies. The Mixed Linear Model (MLM), utilizing the Q matrix and Kinship matrix (Q + K) model, revealed seven associated markers for Zn in 2021 and four in 2022. The MLM (Q + K) model indicated two associated markers for Cu in 2021 and three in 2022. The markers found in this study were significantly associated with the levels of Zn and Cu in different walnut genotypes. One potential candidate gene for Zn was identified based on sequences showing homology to linked SNPs. The markers associated with Zn and Cu can be effectively used in walnut plant breeding programs to assist in selecting Zn and Cu traits.
Benzer Tezler
- Cevizde (Juglans regia L. ) bazı fenolik asitlerin ve bazı eser elementlerin tayini
Determination of some phenolic acids and trace elements in walnut (Juglans regia L.)
AYŞE ŞAP
- Cevizde (Juglans regia L.) DNA markörleri ile genetik haritalama
Genetic linkage mapping in walnut (Juglans regia L.) by DNA markers
YILDIZ DOĞAN
Doktora
Türkçe
2016
BiyoteknolojiÇukurova ÜniversitesiBahçe Bitkileri Ana Bilim Dalı
PROF. DR. SALİH KAFKAS
- Cevizde (Juglans regia L.) selenyum ve magnezyum elementlerinin alınımını kontrol eden gen bölgelerinin genom boyu ilişkilendirilmesi
Genome wide association of gene regions controlling selenium and magnesium uptake in walnut (Juglans regia L.)
İREM BÜYÜKALGAN
Yüksek Lisans
Türkçe
2025
BiyomühendislikEge ÜniversitesiBiyomühendislik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MUHAMMED BAHATTİN TANYOLAÇ
- Cevizde (Juglans regia L.) farklı konum ve olgunluktaki çiçeklerin çiçek tozu canlılık ve çimlenme yeteneklerinin belirlenmesi.
Determination of pollen wiability and germination ability of different location and maturity in walnut (Junglans regia L.).
YAKUP EZBER
Yüksek Lisans
Türkçe
2019
ZiraatAydın Adnan Menderes ÜniversitesiBahçe Bitkileri Ana Bilim Dalı
PROF. DR. FAİK EKMEL TEKİNTAŞ
- Cevizde (Juglans regia L.) bazı fenolojik özelliklerle bağlantılı DNA markörlerinin ilişki haritalama yöntemi ile belirlenmesi
Determination of dna markers linked to some phenological traits with association mapping method in walnut (Juglans regia l.)
ŞAKİR BURAK BÜKÜCÜ
Doktora
Türkçe
2019
ZiraatKahramanmaraş Sütçü İmam ÜniversitesiBahçe Bitkileri Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MEHMET SÜTYEMEZ