Çiğ süt örneklerinde escherichia coli prevalansının ve üropatojenik escherichia coli (UPEC) virülans genlerinin araştırılması
Investigation of the prevalence of escherichia coli and uropathogenic escherichia coli (UPEC) virulence genes in raw milk samples
- Tez No: 953994
- Danışmanlar: DOÇ. DR. SEVAL CİNG YILDIRIM, DOÇ. DR. ZEYNEP YEĞİN
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoloji, Biyoteknoloji, Halk Sağlığı, Biology, Biotechnology, Public Health
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2025
- Dil: Türkçe
- Üniversite: İnönü Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Genel Biyoloji Bilim Dalı
- Sayfa Sayısı: 141
Özet
Bu çalışma, Malatya bölgesinden temin edilen 122 çiğ süt örneğinden izole edilen Escherichia coli suşlarının moleküler düzeyde tanımlanması, antibiyotik direnç profilleri ve üropatojenik E. coli (UPEC) potansiyelinin belirlenmesine yönelik çok yönlü bir analiz sunmaktadır. İlk aşamada 206 koloni izole edilmiş, bunlardan 115'i biyokimyasal testlerle E. coli olarak tanımlanmıştır. Tür düzeyinde doğrulama için yapılan 16S rRNA gen bölgesi PZR amplifikasyonu ve sekans analizleri, bu izolatların büyük çoğunluğunun E. coli ile yüksek oranda benzerlik taşıdığını ortaya koymuştur. Antibiyotik duyarlılık testlerinde tüm izolatlar sefalotine %100 direnç göstermiştir. Fosfomisine (% 25.2) ve sülfametoksazole (% 8.7) direnç oranları da dikkat çekicidir. MAR (Multiple Antibiotic Resistance) indeksi 0.178 olarak hesaplanmış, bu durum orta düzeyde antibiyotik baskısı altında gelişmiş bir direnç profilini göstermektedir. Ayrıca izolatların % 65.2'si birden fazla antibiyotik grubuna karşı dirençli (MDR) olarak tanımlanmıştır. UPEC karakterizasyonu amacıyla seçilen 69 E. coli izolatında 10 virülans geni PZR ile taranmış; en sık tespit edilen genler fimA (% 98.5) ve agn43 (% 95.6) olmuştur. Literatürde yaygın kabul gören kriterlere göre, en az üç virülans genine sahip olan 34 izolat (% 66.60) potansiyel UPEC suşu olarak sınıflandırılmıştır. Bu durum, 16S rRNA ile doğrulanan E. coli suşlarının önemli bir kısmının, özellikle idrar yolu enfeksiyonlarına neden olabilen zoonotik ve yüksek virülanslı patotipler taşıdığını göstermektedir. Sonuç olarak, çiğ süt ürünleri yalnızca gıda kaynaklı mikrobiyolojik kontaminasyon riski taşımamaktadır. Aynı zamanda antibiyotik dirençli ve UPEC özellikleri taşıyan E. coli suşları için bir rezervuar olabilmektedir. Bu bulgular, çiğ süt tüketiminin halk sağlığı üzerindeki potansiyel etkilerine dair güçlü bir uyarı niteliği taşımaktadır ve gıda güvenliği açısından daha sıkı denetim ve farkındalık ihtiyacını ortaya koymaktadır.
Özet (Çeviri)
This study provides a comprehensive analysis of Escherichia coli strains isolated from 122 raw milk samples collected in the Malatya region, focusing on molecular identification, antibiotic resistance profiles, and the potential of Uropathogenic E. coli (UPEC). Initially, 206 colonies were isolated, with 115 biochemically confirmed as E. coli. Species-level confirmation using PCR amplification and sequencing of the 16S rRNA gene showed high similarity to E. coli. Antibiotic susceptibility tests revealed 100% resistance to cephalothin. Notable resistance rates were observed for fosfomycin (25.2%) and sulfametoksazol (8.7%). The Multiple Antibiotic Resistance (MAR) index was calculated as 0.178, indicating moderate antibiotic pressure contributing to resistance development. Additionally, 65.2% of isolates were identified as multidrug-resistant (MDR), exhibiting resistance to multiple antibiotic classes. For UPEC characterization, 69 isolates were screened for 10 virulence genes via PCR; fimA (98.5%) and agn43 (95.6%) were the most prevalent. Based on widely accepted criteria, 34 isolates (66.60%) carrying at least three virulence genes were classified as potential UPEC strains. This suggests that a significant portion of the E. coli isolates possess zoonotic and highly virulent pathotypes capable of causing urinary tract infections. In conclusion, raw milk products not only present a risk of microbiological contamination but also serve as reservoirs for antibiotic-resistant and UPEC-associated E. coli strains. These findings highlight the potential public health risks of raw milk consumption and underscore the need for stricter regulations and increased food safety awareness.
Benzer Tezler
- Çeşitli gıdalarda shiga toksin üreten Escherichia coli (STEC) serotiplerinin ve bazı gıda patojenlerinin prevalansının araştırılması
Investigation of the prevalence of shiga toxin-producing Escherichia coli (STEC) serotypes and certain foodborne pathogens in various foods
ADEM SOYCAN
Doktora
Türkçe
2025
MikrobiyolojiKocaeli ÜniversitesiMikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. DEVRİM DÜNDAR
- Adana piyasasında satışa sunulan süt ve peynirlerde clostridium tyrobutyricum varlığının araştırılması
Investigation of clostridium tyrobutyricum presence in milk and cheese samples sold in Adana market
EDA BUDANUR
Yüksek Lisans
Türkçe
2020
Gıda MühendisliğiÇukurova ÜniversitesiGıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. IŞIL VAR ÖNGEL
- Kayseri yöresinde süt sığırlarında Escherichia coli O157:H7'nin konvansiyonel ve moleküler yöntemlerle araştırılması
Investigation with conventional and molecular method of Escherichia coli O157: H7 in dairy cattle in Kayseri region
AYŞEGÜL YONTAR
Doktora
Türkçe
2009
Veteriner HekimliğiErciyes ÜniversitesiMikrobiyoloji (Veterinerlik) Ana Bilim Dalı
PROF. DR. FUAT AYDIN
- Sığır ve ishalli insan dışkıları ile bazı gıdalarda Escherichia coli O157:H7 AND Stx1/Stx2 gen varlığının araştırılması
The search for the presence of Escherichia coli O157:H7 and Stx1/Stx2 gene in cattles and diarrheal human stools and some foods
SAVAŞ ASLAN
Doktora
Türkçe
2015
Besin Hijyeni ve TeknolojisiAfyon Kocatepe ÜniversitesiVeteriner Hekimliği Bölümü
PROF. DR. HİLMİ YAMAN
PROF. DR. MUSTAFA ALTINDİŞ
- Diyarbakır Bölgesi'nde satışa sunulan çiğ koyun sütlerinin mikrobiyolojik, fiziko-kimyasal ve organoleptik özelliklerinin araştırılması
The study of the microbiological, physico-chemical and organoleptic features of the raw ewe's milk that is sold in Diyarbakir Region
MEHMET NESİP ÇELİK
Yüksek Lisans
Türkçe
2018
Besin Hijyeni ve TeknolojisiDicle ÜniversitesiVeteriner Besin Hijyeni ve Teknolojisi Ana Bilim dalı
PROF. DR. AYDIN VURAL