Yeşil kaplumbağa (Chelonia mydas) yuvalarında hastalığa yol açan bazı bakterilerin tam genom dizilemesi
Complete genome sequencing of some disease-causing bacteria in green tortoise (Chelonia mydas) nests
- Tez No: 958832
- Danışmanlar: DR. ÖĞR. ÜYESİ BAHADIR TÖRÜN, PROF. DR. CAN YILMAZ
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoloji, Biology
- Anahtar Kelimeler: Chelonia mydas, Deniz Kaplumbağası, Bakteriyel Enfeksiyon, Genom analizi, Zoonoz, Koruma Biyolojisi, Chelonia Mydas, Green Sea Turtle, Bacterial Infection, Genome Analysis, Zoonosis, Conservation Biology
- Yıl: 2025
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Hakkari Üniversitesi
- Enstitü: Lisansüstü Eğitim Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 114
Özet
Chelonia mydas tropikal ve subtropikal deniz ekosistemlerinin korunmasında hayati öneme sahip, nesli tehlike altında bulunan bir türdür. Son yıllarda üreme başarılarındaki düşüş, bu canlıların karşı karşıya olduğu tehditleri daha da görünür kılmış; özellikle mikrobiyal enfeksiyonlar olası etkenler arasında öne çıkmıştır. Araştırmada başarısız yuvalarla ilişkili bakteriyel etkenlerin tanımlanması ve karakterizasyonu ile bu enfeksiyonların ekolojik, koruma ve potansiyel halk sağlığı boyutları değerlendirilmiştir. 2023 yılında Adana'nın Akyatan Kumsalı'ndan toplanan başarısız yumurtalara ait kabuk örneklerinden bakteriyel izolasyonlar gerçekleştirilmiştir. İzolatlar MALDI-TOF kütle spektrometrisi ve 16S rRNA gen bölgesi dizilemesi kullanılarak tanımlanmıştır. Tanımlanan bakteriler arasında patojenik potansiyel taşıyan Citrobacter farmeri ve Enterobacter cloacae detaylı analiz için seçilmiştir. Bu iki türün tam genom dizilemesi yapılmış; genom yapısı, antibiyotik direnç genleri, mobil genetik elementler ve CRISPR/Cas sistemleri belirlenmiştir. Elde edilen bulgular, çevresel kirlilik ve insan kaynaklı baskıların deniz kaplumbağalarının mikrobiyal yükünü artırabileceğini ve bu durumun üreme başarılarını olumsuz etkileyebileceğini ortaya koymuştur. Ayrıca zoonotik potansiyele sahip bazı bakterilerin tespiti, insan-kaplumbağa etkileşimlerinin halk sağlığı açısından da değerlendirilmesi gerektiğine işaret etmektedir. Bu çalışma, denizel sürüngenlerde konak- patojen etkileşimlerine ışık tutmakta ve türün korunmasına yönelik stratejiler ile mikrobiyal izleme çalışmalarına katkı sağlamaktadır. Veriler verilmeli sonuçlar yorumlanmalı
Özet (Çeviri)
Chelonia mydas is an endangered species that plays a vital role in the conservation of tropical and subtropical marine ecosystems. In recent years, a decline in reproductive success has highlighted the threats faced by this species, with microbial infections emerging as a potential contributing factor. This study aimed to identify and characterize bacterial agents associated with unsuccessful nests and to evaluate the ecological, conservation, and potential public health dimensions of these infections. In 2023, bacterial isolations were performed from eggshell samples collected from unsuccessful nests on Akyatan Beach in Adana, Türkiye. The isolates were identified using MALDI-TOF mass spectrometry and 16S rRNA gene sequencing. Among the identified bacteria, Citrobacter farmeri and Enterobacter cloacae, which possess pathogenic potential, were selected for detailed analysis. Whole genome sequencing was conducted for these two species, and their genomic structure, antibiotic resistance genes, mobile genetic elements, and CRISPR/Cas systems were characterized. The findings suggest that environmental pollution and anthropogenic pressures may increase the microbial load in sea turtles, negatively impacting their reproductive success. Moreover, the detection of bacteria with zoonotic potential indicates that human- turtle interactions should also be assessed from a public health perspective. This study sheds light on host-pathogen interactions in marine reptiles and contributes to conservation strategies and microbial monitoring efforts for this species.
Benzer Tezler
- Sugözü Kumsalları'ndaki (Ceyhan-Adana) yeşil kaplumbağa (Chelonia mydas L., 1758) yuvalarında sıcaklığın yuva parametreleri, yavru ağırlıkları ve cinsiyetleri üzerine etkisinin değerlendirilmesi
Evaluating the effects of temperature on nest parameters, weight and sex of hatchlings in green turtle (Chelonia mydas L., 1758) nests at Sugözü Beaches (Ceyhan-Adana)
ÇAĞLA KILIÇ
- Determining the metabolic heating in nests of green turtle (Chelonia mydas L., 1758) nesting at Sugözü beaches
Sugözü Kumsalları'ndaki (Ceyhan-Adana) yeşil kaplumbağa (Chelonia mydas L., 1758) yuvalarında metabolik ısınmanın belirlenmesi
FATMA BETÜL ÖNDER
- Yeşil kaplumbağalarda (Chelonia mydas, L., 1758) ergin morfolojisinin yuva, yumurta ve yavru morfolojilerine etkisinin araştırılması
Evaluating the adult morphology on nest, egg and hatchling morphology of green turtles (Chelonia mydas, L., 1758)
ÖMÜR ÖZKAN
- Yeşil deniz kaplumbağalarının (Chelonia mydas Linnaeus, 1758) biyo-ekolojik özellikleri üzerine incelemeler
Research on the bio-ecology of green sea turtles (Chelonia mydas Linnaeus, 1758)
ONUR TÜRKECAN
- Yeşil Deniz Kaplumbağası yuvalarını etkileyen faktörlerin Samandağ Kumsalı örneğinde incelenmesi
An investigation of factors that affect on Green Sea Turtle nests at Samandağ Beach
YUSUF GENÇ
Yüksek Lisans
Türkçe
2014
CoğrafyaÇanakkale Onsekiz Mart ÜniversitesiCoğrafya Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. FAİZE SARIŞ
PROF. DR. ŞÜKRAN YALÇIN ÖZDİLEK