Tuzluluk stresine cevapta rol oynayan genlerin türler arası transkriptomik analizler ile araştırılması
Interspecific transcriptome analyses for the identification of genes involved in salt stress responses
- Tez No: 959505
- Danışmanlar: DOÇ. DR. ALİ TEVFİK UNCU
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoloji, Genetik, Biology, Genetics
- Anahtar Kelimeler: Abiyotik stres, biyoinformatik analizler, transkriptomik analiz, tuzluluk stresi, Abiotic stress, bioinformatic analyses, transcriptomics analyses, salt stress
- Yıl: 2025
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Necmettin Erbakan Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 86
Özet
Domates (Solanum lycopersicum), buğday (Triticum aestivum), kanola (Brassica napus), Soya (Glycine max) ve mısır (Zea mays) ekonomik açıdan önemli olan bitkilerdir. Bitki türlerinde çeşitli abiyotik stres türlerinde transkriptomik analizler yapılmıştır. Fakat tuzluluk stresi altında belirtilen türlerin karşılaştırılması ve ortak gen arayışı konularında rapor eksikliği devam etmektedir. Bu nedenle, tuzluluk stresi altında türler arası ortak genlerin aranması amacıyla mevcut çalışma yürütülmüştür. Transkriptomik analizler, bitkilerde birçok özelliğin ve işlevin moleküler açıdan detaylı olarak açıklanmasına olanak sağlamaktadır. Yürütülen tez çalışması kapsamında tuzluluk stresi uygulanmış bitki türlerinin verileri alınarak Galaxy platformu aracılığıyla bir dizi algoritma kullanarak veri analizi yapılmıştır. Elde edilen sonuçlar bitki türleri arasında karşılaştırılmıştır. Abiyotik stres türlerinde etki gösteren ortak 17 gen tespit edilmiş ve 8 transkripsiyon faktörü bulunmuştur.
Özet (Çeviri)
Tomato (Solanum lycopersicum), wheat (Triticum aestivum), canola (Brassica napus), soybean (Glycine max), and maize (Zea mays) are economically important plants. Transcriptomic analyses have been conducted on plant species under various abiotic stress types. However, there is still a lack of reports on comparisons of species under salinity stress and the search for shared genes. Therefore, the current study was conducted to search for shared genes among species under salinity stress. Transcriptomic analyses allow for the detailed molecular elucidation of many traits and functions in plants. Within the scope of this thesis, data from plant species subjected to salinity stress were collected and analyzed using a series of algorithms via the Galaxy platform. The obtained results were compared among plant species. 17 genes affecting abiotic stress types were identified, and 8 transcription factors were identified.
Benzer Tezler
- Isı şoku protein genlerinin (HSP) bazı populus taksonlarında fonksiyonel genom analizi ve abiyotik stres koşullarında HSP genlerinin ifade seviyelerinin belirlenmesi
Genome-wide survey of heat shock proteins (HSP) and expression analysis of HSP genes under abiotic stress conditions in some populus taxons
ESRA NURTEN YER
Doktora
Türkçe
2017
GenetikKastamonu ÜniversitesiOrman Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. SEZGİN AYAN
DOÇ. DR. MEHMET CENGİZ BALOĞLU
- Arabidopsis thaliana epigenetik mutantlarında tuz stresinin DAN metilasyonu üzerindeki etkilerinin incelenmesi
Investigation of the effects of salt stress on DNA methylation in Arabidopsis thaliana epigenetic mutants
YAĞMUR VECİDE YEŞİLDİREK
Yüksek Lisans
Türkçe
2021
Biyolojiİstanbul ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. NESLİHAN TURGUT KARA
- Tuzluluk stresine karşı farklı biyomolekül uygulamalarının marul bitkisinde (Lactuca sativa) verim parametreleri ve antioksidan sistem üzerine etkileri
Effects of different biomolecule applications against salinity stress on yield parameters and antioxidant system in lettuce plant (Lactuca sativa)
ŞAFAK ESRA ASLAN
Doktora
Türkçe
2024
BiyoteknolojiOndokuz Mayıs ÜniversitesiTarımsal Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. DENİZ EKİNCİ
- Patlıcanda tuzluluk stresine dayanımın artırılmasında anaçların ve yerel gen kaynaklarının etkinliği üzerinde araştırmalar
Investigations on the effectiveness of local genetic resources and rootstocks to increase salinity tolerance of eggplants
MANAR TALHOUNI
Doktora
Türkçe
2016
ZiraatAnkara ÜniversitesiBahçe Bitkileri Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ŞEKÜRE ŞEBNEM ELLİALTIOĞLU
- Mutant soya bitkilerinin tuzluluk stresine cevapları
Responses to salinity stress of mutant soybean plants
TÜRKAN HAZAL TURAN
Yüksek Lisans
Türkçe
2025
Biyolojiİstanbul Kültür ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ÇİMEN ATAK