Geri Dön

Klinik örneklerden izole edilen Pseudomonas aeruginosa suşlarında virülans genlerinin araştırılması

Investigation of virulence genes in P. aeruginosa strains isolated from clinical samples

PDF İndir

  1. Tez No: 960176
  2. Yazar: ENVER TURNA
  3. Danışmanlar: PROF. DR. MEHMET PARLAK
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Sağlık Eğitimi, Health Education
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2025
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Van Yüzüncü Yıl Üniversitesi
  10. Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.

Özet

Pseudomonas aeruginosa‟nın sahip olduğu geniĢ yelpazeli virülans faktörleri, metabolik esnekliği ve çoklu antibiyotiklere karĢı direnci, özellikle hastane kaynaklı enfeksiyonların tedavisini zorlaĢtırmaktadır. ÇalıĢmada, Van YYÜ Dursun OdabaĢ Tıp Merkezi Mikrobiyoloji Laboratuvarı‟na çeĢitli kliniklerden gönderilen hasta örneklerinden izole edilen P. aeruginosa suĢlarında virulans genleri araĢtırılmıĢtır. Bu çalıĢmada klinik örneklerden izole edilen 100 P. aeruginosa suĢunda 11 virülans geni araĢtırılmıĢtır. Klinik örneklerin koyun kanlı agar ve eosin metilen blue agar besiyerlerine ekimi yapılarak 24-48 saat aralığın da 37 ℃‟de inkübasyona bırakıldı. Bu süre sonunda üreme saptanan ve uygun koloni morfolojisine sahip gram negatif, oksidaz ve katalaz testi pozitif ekĢimsi üzüm kokulu örnekler Pseudomonas olarak değerlendirilmiĢtir. Daha sonra bu izolatlar BD Phoenix™ (Becton Dickinson, ABD) otomatize sistemi ile tanımlama ve antibiyotik duyarlılık testleri yapılmıĢtır. ÇalıĢmaya alınan suĢlar virülans genlerinin tespiti için steril boncuklu tüplerde -80 ℃‟ de saklanmıĢtır. Bakteri Genomik DNA Ġzolasyonu için HY-BAGDNA-100 (Türkiye) Bakteri Genomik DNA Ġzolasyon Kiti kullanıldı. P. aeruginosa suĢlarında Las R, Las I, LasA, LasB, Rhl I, Rhl R, Alg D, Exo S, Exo U, Exo T ve Exo Y genleri uygun primerler kullanılarak Polimeraz Zincir Reaksiyonu (PCR) yöntemiyle araĢtırılmıĢtır. Numunelerin %22'si solunum sekresyonu %14'ü idrar, %20‟si balgam, %11‟i yara, %8‟i kan ve %25‟i diğer steril vücut sıvılarından oluĢmuĢtur. ÇalıĢmaya alınan suĢların 65‟i (%65) erkek, 35‟i (%35) kadın hastalardan izole edilmiĢtir. SuĢların 92‟si (%92) yetiĢkin ve 8‟i (%8) çocuk hastalardan elde edilmiĢtir. Örneklerin 41‟i (%41) yoğun bakımlardan, 59‟u (%59) ise servislerden gelen hastalara aitti. Antibiyotik duyarlılık testlerinde; ceftazidime/avibactama %87,8, ciprofloxacine %60,6,‟si levofloxacine %58,7 ve ceftazidime %54,4 oranında direnç saptanmıĢtır. Kolistin ve tobramisin, sırasıyla %17,3 ve %12,5 ile en düĢük direnç oranlarına sahip antibiyotikler olmuĢtur. Virülans genlerinin tespit oranları sıklık sırasına göre; LasB %100, Las I %98, Alg D %98, Las R %97, Exo T %97, Rhl R %92, Exo Y %90, LasA %54, Exo U %53, Rhl I %41 ve Exo S %37 oranında tespit edilmiĢtir. Genlerin bu kadar yaygın görülmesi, bu suĢların yüksek patojenite potansiyeli taĢıdığını göstermektedir. Elde edilen sonuçlar, bölgemizdeki P. aeruginosa suĢlarının hem yüksek düzeyde virülans faktörleri taĢıdığını hem de çoklu antibiyotik direnci geliĢtirdiğini göstermektedir. Bu bulgular, enfeksiyon kontrol önlemlerinin güçlendirilmesi ve tedavi protokollerinin lokal direnç paternlerine göre güncellenmesi gerektiğini ortaya koymaktadır.

Özet (Çeviri)

Pseudomonas aeruginosa has a wide range of virulence factors, metabolic flexibility and resistance to multiple antibiotics, making it difficult to treat hospital-acquired infections in particular. In this study, virulence genes were investigated in P. aeruginosa strains isolated from patient samples sent from various clinics to Van YYU Dursun Odabas Medical Center Microbiology Laboratory. In this study, 11 virulence genes were investigated in 100 P. aeruginosa strains isolated from clinical samples. Clinical samples were cultured on sheep blood agar and eosin methylene blue agar media and incubated at 37 for 24-48 hours. At the end of this period, gram negative, oxidase and catalase test positive sour grape odor samples with appropriate colony morphology were evaluated as Pseudomonas. These isolates were then identified and tested for antibiotic susceptibility using the BD Phoenix™ (Becton Dickinson, USA) automated system. The strains included in the study were stored in sterile beaded tubes at -80 for the detection of virulence genes. HY-BAGDNA-100 (Turkey) Bacterial Genomic DNA Isolation Kit was used for Bacterial Genomic DNA Isolation. Las R, Las I, LasA, LasB, Rhl I, Rhl R, Alg D, Exo S, Exo U, Exo T and Exo Y genes in P. aeruginosa strains were investigated using appropriate primers using the Polymerase Chain Reaction (PCR) method. 22% of the samples were respiratory secretions, 14% urine, 20% sputum, 11% wound, 8% blood and 25% other sterile body fluids. Of the strains included in the study, 65 (65%) were isolated from male and 35 (35%) were isolated from female patients. 92 (92%) of the strains were obtained from adult and 8 (8%) from pediatric patients. 41 (41%) of the samples belonged to patients from intensive care units and 59 (59%) belonged to patients from wards. In antibiotic susceptibility tests, resistance was detected at 87.8 % to ceftazidime/avibactam, 60.6 % to ciprofloxacin, 58.7% to levofloxacin and 54.4% to ceftazidime. Colistin and tobramycin were the antibiotics with the lowest resistance rates with 17.3 % and 12.5%, respectively. The detection rates of virulence genes, in order of frequency, are as follows; Las B 100%, Las I 98%, Alg D 98%, Las R 97%, Exo T 97%, Rhl R 92%, Exo Y 90%, Las A 54%, Exo U 53%, Rhl I 41% and Exo S 37% were detected. The fact that these genes are so common indicates that these strains have high pathogenicity potential. The results obtained show that P. aeruginosa strains in our region both carry high levels of virulence factors and have developed multiple antibiotic resistance. These findings reveal that infection control measures should be strengthened and treatment protocols should be updated according to local resistance patterns.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    339548

    Antimikrobiyallerin subinhibitör konsantrasyonlarının Pseudomonas aeruginosa virülansı üzerine etkilerinin moleküler düzeyde incelenmesi

    Molecular analysis of the effect of antimicrobial subinhibitory concentrations on Pseudomonas aeruginosa virulence

    BERNA ERDAL YILDIRIM

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2013

    MikrobiyolojiGazi Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. AYŞE MELTEM YALINAY ÇIRAK

  2. Tez No

    4

    Posterior fossa tümörleri

    Başlık çevirisi yok

    SERHAT AYDINER

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    1987

    NöroşirürjiGazi Üniversitesi

    Nöroşirürji Ana Bilim Dalı

  3. Tez No

    5

    Doğuştan kalça çıkıklı hastalarda kalça patolojilerinin bilgisayarlı tomografi ile değerlendirilmesi

    Başlık çevirisi yok

    NECDET ŞÜKRÜ ALTUN

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    1987

    Ortopedi ve TravmatolojiGazi Üniversitesi

    Ortopedi ve Travmatoloji Ana Bilim Dalı

    PROF.DR. ORHAN ASLANOĞLU

  4. Tez No

    14

    Türkiye'de serebral hareket bozukluklarının etiyolojisi epidemiyolojisi ve bazı klinik özellikleri

    Başlık çevirisi yok

    AŞER BENSUSAN

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    1986

    Çocuk Sağlığı ve Hastalıklarıİstanbul Üniversitesi

    Çocuk Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı

  5. Tez No

    15

    Pre-eklampsi ve eklampsi vakalarında immünoglobülin düzeylerinin değerlendirilmesi (Klinik ve immünobiolojik araştırma)

    Examination des valeurs d'immunoglobulines en cas de la toxemie gravidique

    M. MURAT SEMİZ

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    1987

    Kadın Hastalıkları ve DoğumGazi Üniversitesi

    Kadın Hastalıkları ve Doğum Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. MÜLAZIM YILDIRIM

Geri Dön