Geri Dön

Bağdat– Irak'ta vajinal candidasısde izole edilen candida albicans izolatlarının bazı virülanslı genlerinin tüm genom sekanslama yöntemine dayalı karşılaştırmalı genomik analizi üzerine araştırmalar

Investigations in to whole-genome sequence based comparative genomic analysis of some virulence-associated genes of candida albicans isolates from vaginal candidasis in Baghdad-Iraq

PDF İndir

  1. Tez No: 963887
  2. Yazar: RAFAL ABDULHADI KADHIM AL NASSER
  3. Danışmanlar: DR. ÖĞR. ÜYESİ İLKER ŞİMŞEK
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Mikrobiyoloji, Microbiology
  6. Anahtar Kelimeler: Candida albicans, Whole genome sequencing, Genomic analysis
  7. Yıl: 2022
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Çankırı Karatekin Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Mikrobiyoloji Bilim Dalı
  13. Sayfa Sayısı: 117

Özet

Bu çalışma, Irak'ta kadınlarda vulvovajinite neden olan en büyük etken olan patojen C. albicans'ın prevalansını araştırmayı amaçlamıştır. Bunun için moleküler epidemiyolojik bir çalışma yapılmıştır. Çalışma, Irak'taki dış kliniklerden ve İmam Hüseyin Eğitim Hastanesi'den, 7/12/2020-3/5/2021 tarihleri arasında, vulvovajinit hastası farklı yaşlardaki elli kadını kapsamaktadır. Elli vajinal örnekten ikisi, seçici diferansiyel Candida besiyeri yani HiChromAgar üzerinde farklı kolonyal morfolojilerine göre C. albicans'ın varlığını gösterdi. Ek olarak, bu iki suşun ışık mikroskobu altında incelenmesi, Candida spp.'nin tipik morfolojik özelliklerini ortaya çıkardı. Gram boyama kullanarak HiChromAgar üzerinde C. albicans olarak varsayılan tanımlamaya sahip iki açık yeşil koloninin, VITEK®2 sisteminin sonuçlarına göre C. albicans olduğu kanıtlanmıştır. Araştırma kapsamındaki quest C. albicans suşlarının moleküler tanımlaması, C. albicans'ı albicans olmayan Candida spp.'den ayıran 175 bp'lik farklı bir bant boyutuna sahip CAL5 ve NL4CAL adlı spesifik bir C. albicans primer seti kullanılarak doğrulandı. şüpheli iki suş, C. albicans suşu Vag-1 ve C. albicans suşu Vag-2 olarak belirlendi. Moleküler epidemiyoloji açısından, iki C. albicans suşu Vag-1 ve Vag-2, MLST (Multilokus sekans tiplendirme) yaklaşımı kullanılarak bir suş düzeyinde tiplendi. PubMLST veri tabanında yayınlanan şema, korunan housekeeping genlerini kodlayan yedi konsensüs lokusu kullanıldı: AAT1a, ACC1, SYA1, MP1b, ZWF1b, VPS13 ve ADP1. İki şüpheli C. albicans suşunun MLST tiplemesinin sonuçları, iki yeni C. albicans suşunun var olma olasılığını ortaya çıkarabilir. 2021, 104 sayfa ANAHTAR KELİMELER: Candida albicans, Tüm genom sekanslama, Genomik analiz

Özet (Çeviri)

This work aimed to study the prevalence of the pathogen C. albicans, the most causative agent of vulvovaginitis in women, among female patients suffering from vulvovaginitis in Iraq. To answer this question, a molecular epidemiological study was conducted. The study encompassed fifty women of different ages suffering from vulvovaginitis, collected from external clinics, Imam Hussein Theaching hospital, Iraq from 7/12/2020, to 3/5/2021. Two out of fifty vaginal samples showed the presence of C. albicans according to their distinct colonial morphology on the selective differential Candida medium namely HiChromAgar. Additionally, the examination of these two strains under light microscope did reveal the typical morphological features of Candida spp. using Gram-stain. The two light green colonies of with presumptive identification as C. albicans on HiChromAgar was proved to be C. albicans based on the results of VITEK®2 system. The molecular identification of the quest C. albicans strains under study was further confirmed using a specific C. albicans primer set namely CAL5 and NL4CAL with a distinct band size of 175 bp discriminating C. albicans from non-albicans Candida spp. The two questionable strains were designated as C. albicans strain Vag-1 and C. albicans strain Vag-2. From the molecular epidemiology point of view, the two C. albicans strains Vag-1 and Vag-2 were typed on a strain level using the approach namely MLST (Multilocus Sequence Typing). The scheme published in the PubMLST database was employed using a seven consensus loci encoding for conserved house-keeping genes namely: AAT1a, ACC1, SYA1, MP1b, ZWF1b, VPS13, and ADP1. The results of MLST typing of the two questionable C. albicans strains might reveal the likely of the presence of two novel C. albicans strains. 2021, 104 page

Benzer Tezler

  1. Tez No

    744233

    The study of fertility hormones like AMH and FSH with vitamin E in the adult female diet in Baghdad, Iraq

    Bağdat, Irak'ta yetişkin kadınlar diyetinde E vitaminli AMH ve FSH gibi doğurganlık hormonları çalışması

    MUSTAFA JABBAR FLAYYIH AL-OBAIDI

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2022

    BiyokimyaÇankırı Karatekin Üniversitesi

    Biyokimya Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. SEVKİ ADEM

  2. Tez No

    786359

    The relevance of using social media and technological advancement in learning English as a second language: Study of (English language learners in Iraq)

    Irak'ta EFL Türkmen öğretmenlerinde fonetik bilinçlerinin incelenmesi

    HANAN ABDUL GHANI ALI

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2023

    İngiliz Dili ve EdebiyatıKarabük Üniversitesi

    İngiliz Dili ve Edebiyatı Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. ÖZKAN KIRMIZI

  3. Tez No

    958696

    Üropatojen escherichia coli'de bazı adezyon ilişkili genlerı̇n ekspresyonunun moleküler olarak tespı̇t ve Bağdat-Irak hastalarından elde edı̇len klinik ı̇zolatlarda antı̇bı̇yotı̇k dı̇rencı̇ ile ilişkisi

    Molecular detection of the expression of some adhesion-related genes in uropathogenic escherichia coli and their relationship with antibiotic resistance in clinical isolates from patients from Baghdad and Iraq

    ALAA ALI JAWAD MHANNAWEE

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2025

    BiyolojiÇankırı Karatekin Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    DR. ÖĞR. ÜYESİ SERDAL TARHANE

  4. Tez No

    775283

    Customer capital and its role on promoting entrepreneurial marketing: The case of small and medium enterprises in Iraq

    Müşteri sermayesinin girişimci pazarlamayı teşvik etmedeki rolü: Irak'taki küçük ve orta ölçekli işletmeler örneği

    MOHAMMED YASIR

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2022

    İşletmeİstanbul Gelişim Üniversitesi

    İşletme Ana Bilim Dalı

    DR. ÖĞR. ÜYESİ PINAR BACAKSIZ

  5. Tez No

    812254

    In vitro (Rosmarinus officinalis L.) response to nanoparticles and their effects on secondary metabolite and genetic variation

    İn vitro (Rosmarinus officinalis L.) nanoparçacıklara tepki ve sekonder metabolit ve genetik değişiklik üzerindeki etkileri

    HUSSAM BASIM SALEH

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2023

    ZiraatErciyes Üniversitesi

    Tarım Bilimleri ve Teknolojileri Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. ÖZHAN ŞİMŞEK

Geri Dön