Meme ve over kanserli hastalarda yeni nesil dizileme analizlerinin retrospektif değerlendirilmesi
Retrospective evaluation of next generation sequencing analyses in patients with breast and ovarian cancer
- Tez No: 965184
- Danışmanlar: DR. ÖĞR. ÜYESİ TANER DURAK
- Tez Türü: Tıpta Uzmanlık
- Konular: Genetik, Genetics
- Anahtar Kelimeler: meme kanseri, over kanseri, yani nesil dizileme, herediter kanser paneli, breast cancer, ovarian cancer, next-generation sequencing, hereditary cancer panel
- Yıl: 2025
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Pamukkale Üniversitesi
- Enstitü: Tıp Fakültesi
- Ana Bilim Dalı: Tıbbi Genetik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Bu çalışmanın amacı, 317 meme ve over kanseri tanısı almış hastada, genetik değişiklikleri ve bunların tümörlerin patolojik özellikleriyle olan ilişkilerini incelemektir. NGS yöntemiyle analiz edilen hastalarının verileri retrospektif olarak değerlendirilmiştir. 76 gen içeren herediter kanser paneli kullanılarak yapılan analizde, yalnızca patojenik ve muhtemel patojenik varyantlar dikkate alınmıştır. Çalışmamızda, meme kanserli hastaların %5,7'sinde (16/281) BRCA1/BRCA2 genlerinde patojenik veya muhtemel patojenik mutasyonlar saptanmış; benzer oranda (%5,7; 16/281) diğer meme kanseri yatkınlık genlerinde de mutasyonlara rastlanmıştır. Elde edilen bu oranlar, mevcut literatürle benzerlik göstermektedir. Literatürle uyumlu olarak, meme kanserli hastalarında mutasyon saptanan diğer genler; ATM, PALB2 ve CHEK2'dir. Over kanserli hastalarda ise %25 (9/36) oranında BRCA1/BRCA2 patojenik/muhtemel patojenik mutasyon bulunmuş olup, mutasyon sıklığı %5,5 (2/36) oranında diğer genlerde mutasyon gözlemlenmiştir. Sonuç olarak, çalışmamız meme ve over kanserli hastalarda yalnızca BRCA1/BRCA2 germline mutasyonlarına odaklanmanın yetersiz olduğunu ve ilişkili diğer genlerin herediter kanser paneli olarak analiz edilmesinin daha faydalı olabileceğini göstermektedir.
Özet (Çeviri)
The aim of this study is to investigate genetic alterations and their associations with the pathological characteristics of tumors in 317 patients diagnosed with breast and ovarian cancer. Data from patients analyzed by next-generation sequencing (NGS) were evaluated retrospectively. In the analysis performed using a hereditary cancer panel including 76 genes, only pathogenic and likely pathogenic variants were considered. In our study, pathogenic or likely pathogenic mutations in the BRCA1/BRCA2 genes were detected in 5.7% (16/281) of breast cancer patients; a similar frequency (5.7%; 16/281) of mutations was also observed in other breast cancer susceptibility genes. These frequencies are consistent with the current literature. In line with previous studies, the other genes found to be mutated in breast cancer patients were ATM, PALB2 and CHEK2. In ovarian cancer patients, pathogenic/likely pathogenic BRCA1/BRCA2 mutations were identified in 25% (9/36) of cases, and mutations in other genes were observed at a frequency of 5.5% (2/36). In conclusion, our study indicates that focusing solely on BRCA1/BRCA2 germline mutations in patients with breast and ovarian cancer is insufficient, and that analyzing additional associated genes using a hereditary cancer panel may provide more comprehensive insights.
Benzer Tezler
- Mutational spectrum of the Turkish hereditary breast and colon cancer patients
Türkiye'deki kalıtsal meme ve kolon kanseri hastalarında mutasyon spektrumu
ELİFNAZ ÇELİK
Yüksek Lisans
İngilizce
2018
Genetikİstanbul Teknik ÜniversitesiMoleküler Biyoloji-Genetik ve Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı (disiplinlerarası)
DOÇ. DR. GİZEM DİNLER DOĞANAY
- Targeting and activation of antigen specific CD8+ T cells with peptide-major histocompatibility complex I tetramers
Peptit-majör histokompatibilite kompleks I tetramerleri ile antijen spesifik CD8+ T hücrelerin hedeflenmesi ve aktivasyonu
ŞAFAK CEREN USLU ŞIVGIN
Doktora
İngilizce
2025
BiyoteknolojiHacettepe ÜniversitesiTemel Onkoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. HANDE CANPINAR
- Molecular investigation of CHEK2 variants of unknown significance (VUS) found by genetic screening of breast and colorectal cancer patients and healthy individuals in Turkish population
Türk popülasyonunda meme ve kolorektal kanser hastaları ile sağlıklı bireylerde genetik tarama ile saptanan klinik önemi bilinmeyen CHEK2 varyantlarının moleküler incelemesi
NİSAN DENİZCE CAN
Doktora
İngilizce
2026
Biyoteknolojiİstanbul Teknik ÜniversitesiMoleküler Biyoloji-Genetik ve Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı (disiplinlerarası)
PROF. DR. GİZEM DİNLER DOĞANAY
- Meme ve/veya over kanseri öyküsü olan hastalarda ilişkili genlerin yeni nesil dizileme yöntemi ile incelenmesi
Investigation of associated genes in patients with a history of breast and/or ovarian cancer by next generation sequencing
CANBERK AKKAŞ
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2024
Genetikİstanbul Medeniyet ÜniversitesiTıbbi Genetik Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. FİLİZ ÖZEN
- Premenopozal ve postmenopozal dönem meme kanser olgularında genomik varyasyon analizi
Genomic variation analysis in premenopausal and postmenopausal breast cancer cases
İBRAHİM HALİL ERDOĞDU
Doktora
Türkçe
2024
Sağlık EğitimiDokuz Eylül ÜniversitesiMoleküler Patoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. DUYGU GÜREL