Geri Dön

İki boyutlu ve üç boyutlu KHDAK modellerinde hücre membran protein imzalarının normoksik ve hipoksik koşullarda araştırılması

Investigation of cell membrane protein signatures in two-dimensional and three-dimensional NSCLC models under normoxic and hypoxic conditions

PDF İndir

  1. Tez No: 978072
  2. Yazar: AYCAN SEZAN
  3. Danışmanlar: DOÇ. DR. YASEMİN SAYGIDEĞER
  4. Tez Türü: Doktora
  5. Konular: Biyoteknoloji, Onkoloji, Biotechnology, Oncology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2025
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Çukurova Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.

Özet

Akciğer kanseri, kansere bağlı ölümlerin başlıca nedenlerinden biri olup, bu hastalığın tanı ve tedavisinde kullanılabilecek potansiyel biyobelirteçlerin tanımlanması veya yeni moleküler mekanizmaların aydınlatılması büyük önem taşımaktadır. Kanser kök hücreleri (KKH), kök hücre benzeri özellikler gösteren, tümörün oluşumu, prolifersyonu, invazyonu ve metastazında rol oynayan kritik hücre populasyonlarıdır. Dolayısıyla KKH'leri hedeflenmesi, başta akciğer kanseri olmak üzere pek çok kanser türünün tanı ve tedavisinde hayati bir rol üstlenmektedir. Bu çalışmada 3D (üç boyutlu) küçük hücreli dışı akciğer (KHDAK) tümöroidleri oluşturulmuş, bu tümöroidlerin KKH gelişmini indüklemek amacıyla hipoksik mikroçevreye maruz bırakılmışlardır. Hipoksik ve normoksik ortamlarda büyütülmüş tümöroidlerden zenginleştirilmiş hücre membran proteinlerin izole edilmiştir. Elde edilen zenginleştirilmiş hücre membran protein lizatı proteomik yöntemler ile analiz edilmiştir. Toplamda tüm koşullarda 2225 adet protein tanımlanmıştır. Bu tanımlanan proteinlerin önemli bir kısmı (yaklaşık %40) hücre membranına lokalizedir. Proteomik analiz sonucunda hem normoksik hem de hipoksik koşullarda KKH ilişkili (DLL1, NOTCH1 TSPAN5, THBS1, CALR, PLXNB2, ABCA5, NOTCH2NLB vb.) proteinler tanımlanmıştır. Sonuç olarak normoksik ve hipoksik mikroçevre koşullarında elde edilen bu proteinler KHDAK'de tanı ve tedaviye yönelik potansiyel biyobelirteç adayları sunmaktadır.

Özet (Çeviri)

Lung cancer, one of the leading causes of cancer-related deaths in man and woman. Cancer stem cells (CSCs) play an important role in tumor recurrence, progression, and therapy resistance. Therefore, targeting CSCs plays a vital role in the diagnosis and treatment of lung cancers. In this study, 3D (three-dimensional) non-small cell lung cancer (NSCLC) tumoroids were generated and exposed to a hypoxic microenvironment to induce CSC development. Enriched cell membrane proteins were isolated from tumoroids grown under hypoxic and normoxic conditions. The enriched cell membrane protein lysate obtained was analyzed by proteomic methods. In total, 2225 proteins were identified under all conditions. A significant portion of these identified proteins (approximately 40%) were localized in the cell membrane. Proteomic analysis were identified CSC-related proteins (such as DLL1, NOTCH1 TSPAN5, THBS1, CALR, PLXNB2, ABCA5, NOTCH2NLB, etc.) in normoxic and hypoxic conditions. As a result, these proteins obtained under normoxic and hypoxic microenvironmental conditions in this study present potential biomarker candidates for the diagnosis and treatment of NSCLC.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    554237

    Akciğer kanseri radyoterapisinde uygulanan iki farklı planlama tekniğinin dozimetrik olarak karşılaştırılması

    Dosimetric comparison of two different planning technique applied in lung cancer radiotherapy

    ÖZGE SÖYÜNMEZ

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2019

    OnkolojiAkdeniz Üniversitesi

    Radyasyon Onkolojisi Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. MİNE GENÇ ÖZAY

  2. Tez No

    670806

    Non-small cell lung cancer tumor characterisation using deep learning

    Derin öğrenme yaklaşımlarıyla küçük hücreli dışı akciğer kanserinde tümör karakterizasyonu

    MUSTAFA BIÇAKCI

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2021

    Bilgisayar Mühendisliği Bilimleri-Bilgisayar ve KontrolAbdullah Gül Üniversitesi

    Elektrik ve Bilgisayar Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. BÜLENT YILMAZ

  3. Tez No

    242199

    Tedavi planlama sisteminden elde edilen dozimetrik parametrelerin rando fantom kullanılarak iki farklı dozimetrik yöntem ile değerlendirilmesi

    Evaluation with two different dosimetric methods by using rando phantom of dosimetric paramethers obtained from treatment planning system

    ÇAĞLAR KELEŞ

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2009

    Fizik ve Fizik MühendisliğiDokuz Eylül Üniversitesi

    Medikal Fizik Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. MÜNİR KINAY

    ÖĞR. GÖR. ZAFER KARAGÜLER

  4. Tez No

    398949

    Mini-vida destekli hızlı üst çene genişletmesi ile konvansiyonel hızlı üst çene genişletmesinin etkilerinin konik ışınlı bilgisayarlı tomografi (CBCT) kullanılarak karşılaştırılması

    Comparison of the effects of conventional rapid palatal expansion and mini-screw supported rapid palatal expansion using cone beam computed tomography (CBCT)

    GÖZDE TUĞÇE ÇELENK KOCA

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2013

    Diş HekimliğiEge Üniversitesi

    Ortodonti Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ASLIHAN MEDİHA ERDİNÇ

  5. Tez No

    585191

    Liderlik stillerinin çalışan hemşirelerin motivasyonuna etkisi: Ege Üniversitesi Tıp Fakültesi Hastanesi uygulaması

    The effect of leadership styles on the motivation of working nurses:Ege University Medical Faculty Hospital case

    UMUT ARDİL

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2019

    Sağlık Kurumları Yönetimiİzmir Katip Çelebi Üniversitesi

    Sağlık Yönetimi Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. LEVENT BEKİR KIDAK

Geri Dön