Amsacta mooreı entomopoxvırus (AMEV) giriş füzyon kompleksi genlerinin susturulması
Silencing of the entry fusion complex genes of amsacta moorei entomopoxvirus (AMEV)
- Tez No: 982250
- Danışmanlar: PROF. DR. HACER MURATOĞLU
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Mikrobiyoloji, Microbiology
- Anahtar Kelimeler: RNA interferaz, RNA interference
- Yıl: 2025
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Karadeniz Teknik Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Amsacta moorei entomopoxvirus (AMEV), omurgasızları enfekte ettiği için omurgalıları enfekte eden poksvirüslerin moleküler mekanizmalarını aydınlatmak için temel bir araştırma materyali haline gelmiştir. AMEV, ayrıca ifade vektörü, gen terapi vektörü ve tarımsal açıdan önemli zararlılar için mikrobiyolojik kontrol ajanı olarak kullanım potansiyeline sahip önemli böcek virüslerindendir. Vaksinya virüslerin hücreye giriş-füzyon kompleksi (EFC) 11 viral proteinden oluşurken AMEV'de sadece 9 gen ürününün EFC'yi oluşturduğu önerilmiştir. Bu çalışmada amaç AMEV EFC genlerini susturarak bu genlerin yeni virüs üretimi üzerindeki etkilerini araştırmaktır. RNA susturması (RNAi) yöntemi kullanılarak, AMEV EFC genlerine özgü uzun çift zincirli RNA (dsRNA) üretimi yapıldı. Transfeksiyon-enfeksiyon sonuçlarına göre, RNAi uygulamasında üretilen yeni virüs miktarı GFP ışımasıyla tespit edildi ve birçok gen için virüs miktarında azalma belirlendi. Virüs miktarındaki azalma, tek başına uygulanan dsAMV186-Am∆sph/gfp için 64,98 kat ve dsAMV232-Am∆sph/gfp için 32,93 kat olurken, birlikte uygulanan dsAMV217/dsAMV243-Am∆sph/gfp için 12,68 kat ve dsAMV232/dsAMV 243-Am∆sph/gfp için 12,35 kat olarak tespit edildi.
Özet (Çeviri)
Amsacta moorei entomopoxvirus (AMEV) has become an important research model for elucidating the molecular mechanisms of vertebrate-infecting poxviruses, as it naturally infects invertebrates. In addition, AMEV is a significant insect virus with potential applications as an expression vector, a gene therapy vector, and a microbiological control agent against agriculturally important pests. Whereas the cell entry-fusion complex (EFC) of vaccinia virus is composed of 11 viral proteins, it has been proposed that only 9 genes products constitute the EFC in AMEV. The aim of this study was to investigate the effects of silencing AMEV EFC genes on the production of new viruses. Using RNA interference (RNAi), long double-stranded RNAs (dsRNAs) specific to AMEV EFC genes were synthesized. According to the transfection-infection results, the titer of newly produced virus in the RNAi application was detected by GFP fluorescence, and a reduction of virüs titer was determined for many genes. The decrease in virus titer was detected as 64.98-fold for dsAMV186-Am∆sph/gfp and 32.93-fold for dsAMV232-Am∆sph/gfp applied alone, while it was detected as 12.68-fold for dsAMV217/dsAMV243-Am∆sph/gfp and 12.35-fold for dsAMV232/dsAMV243-Am∆sph/gfp applied together.
Benzer Tezler
- Amsacta moorei entomopoxvirus (AMEV) muhtemel kaspaz orf'si̇ni̇n (AMV063) fonksi̇yonel anali̇zi̇
Functional analysis of putative amsacta moorei entomopoxvirus (AMEV) caspase orf (AMV063)
FUNDA BİLGİLİ
Yüksek Lisans
Türkçe
2020
BiyoteknolojiKaradeniz Teknik ÜniversitesiMoleküler Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. HACER MURATOĞLU
- Amsacta Moorei entomopoxvirus protein kinazlarının viral proteinlerle etkileşimlerinin belirlenmesi
Determination of protein protein interactions among protein kinases of amsacta moorei entomopoxvirus (AMEV) and protein kinases with the other proteins of AMEV
MEHTAP DANIŞMAZOĞLU
Doktora
Türkçe
2017
BiyolojiKaradeniz Teknik ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. REMZİYE NALÇACIOĞLU
- Amsacta moorei entomopoksvirüse ait AMV133 kodlu açık okuma zincirinin homolog rekombinasyonla silinmesi ve rekombinant virüs oluşturulması
Detection of AMV133 orf of Amsacta moorei entomopoxvirus by homolog recombination and consruction of recombinant virus
İNCİ CEVHER
Yüksek Lisans
Türkçe
2011
MikrobiyolojiKaradeniz Teknik ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. REMZİYE NALÇACIOĞLU
- Amsacta moorei entomopoxvirus muhtemel glikozil transferaz geninin (AMV248) yapısal ve fonksiyonel analizi
Functional and structural analysis of amsacta moorei entomopoxvirus putative glycosyl transferase gene (AMV248)
CİHAN İNAN
Doktora
Türkçe
2016
BiyolojiKaradeniz Teknik ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ZİHNİ DEMİRBAĞ
- Amsacta moorei entomopoksvirüs protein kinaz geninin karakterizasyonu ve fonksiyonel analizi
Functional analysis and characterization of protein kinase gene (AMV197) of Amsacta moorei entomopoxvirus
HACER MURATOĞLU
Doktora
Türkçe
2010
MikrobiyolojiKaradeniz Teknik ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ZİHNİ DEMİRBAĞ