Generation of liver assembloids and mechanoregulation of liver regeneration
Karaciğer assembloid oluşturulması ve karaciğer rejenerasyonunun mekanik regülasyonu
- Tez No: 982373
- Danışmanlar: DR. ÖĞR. ÜYESİ BAHAR DEĞİRMENCİ UZUN
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Genetik, Biyoloji, Genetics, Biology
- Anahtar Kelimeler: Hücre kültürü, Moleküler genetik, Cell culture, Molecular genetic
- Yıl: 2025
- Dil: İngilizce
- Üniversite: İhsan Doğramacı Bilkent Üniversitesi
- Enstitü: Mühendislik ve Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Karaciğer, hasar aldığı durumlarda hücre popülasyonunu yenileme yetisine sahip bir organdır. Fibroz gibi devamlı karaciğer hasarına sebep olan koşullarda, hepatosit popülasyonunun kendini yenilenmesinin de engellenmesiyle safra kanal epitel hücrelerinin hepatosit hücrelerine benzer gen ekspresyon profilleri kazanmaya eğilimli oldukları görülmüştür. Ancak bu eğilim, çoğunlukla hayvan modellerinde çalışılmış olup organoid modellerinde yapılan çalışmalar azınlıktadır. Karaciğer hücrelerinin dokudaki mekanik değişiklikleri algıladıkları gösterilmiştir fakat safra epitel hücrelerinin fibroz gibi durumlarda farklılaşan doku dinamiklerine verdiği mekanik cevaplar daha fazla araştırılması gereken bir konudur. Bu çalışmada dışarıdan müdahale olmadan safra kanal epitel hücrelerinin bipotent doğası kullanılarak hem kontrol hem TAA örneklerinden izole edilen bu organoidlerin hepatosit organoidlerine benzemesi amaçlanmıştır. In vitro fibroz organoidleri ve in vivo fibroz modelleri kullanılarak homeostaz ve fibroz arasında gen ekspresyon farklılıkları çalışılmıştır. İki farklı organoidin kinetik bir şekilde kültürlenmesiyle özgün bir karaciğer assembloidi oluşturulmuştur. Bu çalışmada oluşturulan karaciğer assembloidlerinin organoidlere kıyasla daha kompleks bir yapıya sahip olduğu gözlemlenmiştir. Bu çalışmada safra kanal epitel hücrelerinin birincil karaciğer doku organizasyonunu birincil silya üzerinde konumlanan PIEZO1 ve aşağısında uyarılan YAP1 yolağıyla regüle ettiği gösterilmiştir. Hücresel karakterizasyon ve fonksiyonel çalışmaların da dahil edilmesiyle assembloid modelinin karaciğere benzerliği vurgulanmıştır.
Özet (Çeviri)
Liver has been known to be capable of regenerating its cell population upon damage. Upon persistent liver damage such as fibrosis, coupled with the impairment of hepatocyte proliferation, cholangiocyte population shows a leniency to acquire an expression profile resembling hepatocytes. However, this leniency is mainly shown in animal models and has not yet been demonstrated in an organoid system without the external regulation of the pathways to push cells to hepatic fate. Liver cells also have been shown to respond to mechanical stimuli upon changes in the micro-environment including fibrosis but the response of cholangiocytes to mechanical cues is a topic that requires further investigation. In this study, we take advantage of the bi-phenotypic nature of cholangiocytes to generate hepatocyte-like organoids from ductal organoids isolated from both TAA and control livers. By assembling these organoids in a kinetic culture system, a novel attempt to generate a liver assembloid model that recapitulates native liver architecture is performed. Here,we propose a novel mechanotransduction pathway in cholangiocytes, mediated by PIEZO1, that orchestrates liver tissue organization. We demonstrate that PIEZO1 which is localized in the primary cilium regulates YAP1 signaling, influencing cellular responses to fibrosis and guiding cholangiocyte-driven tissue remodeling. Employing both in vitro fibrosis organoid cultures and in vivo fibrosis models, we reveal distinct expression profiles in fibrotic versus control conditions. This study advances our understanding of hepatic cell plasticity and offers a powerful platform for therapeutic exploration in liver disease.
Benzer Tezler
- Generation of nanocarrier systems with s layer proteins
S katman proteinleri ile nanotaşıyıcı sistem üretimi
MEHMET HİKMET ÜÇIŞIK
Doktora
İngilizce
2014
Unıversıtat Fur Bodenkultur Wıen (unıversıty Of Natural Resources And Lıfe Scıences, Vıenna)Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
Yükleniyor...
- I. Meşrutiyet dönemi Osmanlı mebuslarıyla ilgili prosopografik bir inceleme
A prosopographic analysis of the Ottoman deputies of the First Constitutional period
SİNAN ÇAKIR
- Krişsiz döşemelerde düşey yükler altında iç kuvvet dağılımı yapı sistemlerinin hesap yöntemlerinin karşılaştırılması
Başlık çevirisi yok
MEHMET YEŞİLOĞLU
- Büyük ölçekli aile işletmelerinde nesiller arası liderlik çatışmasında duygusal sahiplik ve lider -üye arasındaki etkileşim algısı
The mediating role of leader-member exchange on the effect between emotional ownership and intergenerational leadership conflict in large-scale family businesses
YÜCEL ENGİN
