Kanser protein biyobelirteçlerinin tespiti için yüzeyde zenginleştirilmiş raman saçılmasına dayalı yeni yöntemlerin geliştirilmesi
Development of novel methods based on surface-enhanced raman scattering for the detection of cancer protein biomarkers
- Tez No: 990974
- Danışmanlar: PROF. DR. MEHMET KAHRAMAN
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Kimya, Biyokimya, Biyoteknoloji, Chemistry, Biochemistry, Biotechnology
- Anahtar Kelimeler: Raman spektroskopisi, İmmünosensör, Raman spectroscopy, Immunosensor
- Yıl: 2025
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Gaziantep Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Kimya Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Analitik Kimya Bilim Dalı
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Yüzeyde zenginleştirilmiş Raman saçılması (YZRS) deneylerinde kullanılan aktif platformların geliştirilmesi büyük önem taşımaktadır. YZRS aktif yüzeylerde yüksek zenginleştirme faktörü, iyi tekrarlanabilirlik, düşük maliyet, sağlamlık, kolay hazırlanabilirlik ve farklı örneklerle uyumluluk tercih edilen özelliklerdendir. Bu tezde, katman katman bir araya gelme yöntemiyle sağlam, esnek ve tekrarlanabilirliği yüksek diatom bazlı YZRS platformlar hazırlandı. Hem etiketsiz hem de etiketli yaklaşımlar kullanılarak kanser protein biyobelirteçlerinin tekli ve çoklu tespiti gerçekleştirildi. Tekrarlanabilirliği yüksek YZRS aktif platformlardan maksimum aktiviteye sahip olan 5 katmanlı gümüş nanoparçacıklar (AgNPs) içeren diatom yüzeyin YZRS zenginleştirme faktörü en az 105 olarak belirlendi. Temel bileşen analizi (PCA) analizi, elde edilen spektrumların etiketsiz biyobelirteç tespitinde kullanılabilir olduğunu göstermektedir. Ayrıca YZRS aktif şerit sabit faz olarak kullanılarak biyobelirteç karışımının kromatografik ayrımı gerçekleştirildi ve sonra YZRS'ye dayalı çoklu tespiti yapıldı. Etiketli yaklaşımda ise proteinlere spesifik antikorlar kullanılarak YZRS'ye dayalı immünosensörler hazırlandı ve Raman problar ile kanser biyobelirteçlerinin hem tekli hem de çoklu tespiti gerçekleştirildi. Tekli yaklaşım ile her bir biyobelirteç derişimi 0,1 ng/mL kadar tespit edildi. Çoklu tespit içinde iki farklı yaklaşım uygulandı ve her yaklaşım için Raman haritalama işlemi yapılarak başarı ile biyobelirteçlerin tespiti yapıldı.
Özet (Çeviri)
The development of active platforms used in surface-enhanced Raman scattering (SERS) experiments is of great importance. High enhancement factor on active surfaces, good reproducibility, low cost, robustness, ease of preparation, and compatibility with different samples are among the preferred features of SERS. In this thesis, robust, flexible, and highly reproducible diatom-based SERS platforms were prepared using the layer-by-layer assembly method. Single and multiplex detection of cancer protein biomarkers was performed using both label-free and labeled approaches. The SERS enhancement factor of the diatom surface containing 5-layer silver nanoparticles (AgNPs), which has the highest SERS activity among the SERS active platforms with high reproducibility, was determined to be at least 105. PCA analysis indicates that the obtained spectra can be used for label-free biomarker detection. Additionally, the chromatographic separation of the biomarker mixture was performed using SERS as the active stationary phase, followed by multi-detection based on SERS In the labeled approach, SERS-based immunosensors were prepared using antibodies specific to proteins, and both single and multiplex detection of cancer biomarkers were performed with Raman probes. With the single approach, the concentration of each biomarker was detected down to 0.1 ng/mL. Two different approaches were applied within the multi-detection, and Raman mapping was performed for each approach, successfully identifying the biomarkers.
Benzer Tezler
- Tükürükteki belirli biyomarkerların tek kullanımlık biyosensör sistemleri ile tayini ve kanser erken teşhisinde kullanımlarının araştırılması
Determination of specific biomarkers with disposable biosensor systems and investigation of useage in cancer early diagnosis
ELİF BURCU AYDIN
Doktora
Türkçe
2018
BiyokimyaTekirdağ Namık Kemal ÜniversitesiKimya Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MUSTAFA KEMAL SEZGİNTÜRK
- Design and simulation of micromixers for efficient antigen-antibody binding
Verimli antijen-antikor bağlanması için mikrokarıştırıcıların tasarımı ve simülasyonu
SİMGE NAZ ERTEMÜR
Yüksek Lisans
İngilizce
2023
Bilim ve Teknolojiİstanbul Teknik ÜniversitesiNanobilim ve Nanomühendislik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. HÜSEYİN KIZIL
- Targeting circulating breast cancer stem cells via mTOR and WNT inhibitors after bone metastasis
Sirküle meme kanseri kök hücrelerinin kemik metastazı sonrası mTOR ve WNT inhibitörleri ile hedeflenmesi̇
ÖZLEM ALTUNDAĞ ERDOĞAN
Doktora
İngilizce
2025
BiyokimyaHacettepe ÜniversitesiKök Hücre Ana Bilim Dalı
PROF. DR. BETÜL ÇELEBİ SALTIK
- Synthesis of folate receptor 1 targeted dye-conjugated peptides for use in positron emission tomography imaging systems
Pozitron emisyon tomografi görüntüleme sistemlerinde kullanılacak folate receptör 1 hedefli boya takılı peptitlerin sentezi
DERYA CİN
Yüksek Lisans
İngilizce
2022
Bilim ve Teknolojiİstanbul Teknik ÜniversitesiNanobilim ve Nanomühendislik Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ ONUR ALPTÜRK
DR. ÖZGÜR YILMAZ
- Verification of potential protein biomarkers for detection of endometrial cancer by targeted mass spectrometry-based approach
Endometriyum kanseri tespiti için hedefli kütle spektrometresi temelli yaklaşımla potansı̇yel proteı̇n bı̇yobelırteçlerı̇nı̇n doğrulanması
ÖYKÜ SU YILDIRIM
Yüksek Lisans
İngilizce
2025
BiyokimyaOrta Doğu Teknik ÜniversitesiBiyokimya Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. SÜREYYA ÖZCAN KABASAKAL
PROF. DR. ABDULLAH KARAER