Pirolidin ve pirolidin-2-on türevlerinin kuantum mekaniksel ve deneysel yöntemlerle incelenmesi
Quantum mechanical and experimental investigation of pyrrolidine and pyrrolidine-2-one derivatives
- Tez No: 1011491
- Danışmanlar: PROF. DR. NECMİ DEGE
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Fizik ve Fizik Mühendisliği, Biyofizik, Physics and Physics Engineering, Biophysics
- Anahtar Kelimeler: Near-infrared spektroskopi, Supramoleküler kimya, Tek kristaller, Near-infrared spektroskopi, Supramolecular chemistry, Single crystals
- Yıl: 2026
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Ondokuz Mayıs Üniversitesi
- Enstitü: Lisansüstü Eğitim Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Fizik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Katıhal Fiziği Bilim Dalı
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Bu tez çalışmasında, pirolidin türevi organik bileşiklerin yapısal, elektronik ve biyolojik özellikleri deneysel ve teorik yöntemler birlikte kullanılarak incelenmiştir. Çalışma kapsamında sentezlenen bileşiklerin kristal yapıları tek kristal X-ışını kırınımı (SCXRD) yöntemiyle aydınlatılmış; elde edilen kristal yapılar bağ uzunlukları, bağ açıları ve konformasyonel özellikler açısından ayrıntılı olarak değerlendirilmiştir. Kristal paketlenmede rol oynayan moleküller arası etkileşimler Hirshfeld yüzey analizi ve iki boyutlu parmak izi grafikleri yardımıyla analiz edilmiş, ayrıca enerji çerçevesi hesaplamaları ile bu etkileşimlerin göreli katkıları nicel olarak ortaya konmuştur. Optimize edilmiş geometriler üzerinden HOMO–LUMO enerji aralıkları, moleküler elektrostatik potansiyel (MEP) yüzeyleri ve global reaktivite parametreleri hesaplanmış, teorik sonuçlar deneysel kristal verileri ile karşılaştırılmıştır. Deneysel ve teorik geometrik parametreler arasındaki uyum, moleküler yapıların doğruluğunu desteklemiştir. Biyolojik aktivite potansiyelinin değerlendirilmesi amacıyla, incelenen pirolidin türevleri çeşitli kanser ve nörolojik hedef proteinler üzerinde moleküler yerleştirme (molecular docking) analizlerine tabi tutulmuştur. Elde edilen bağlanma enerjileri, inhibitör sabitleri ve ligand–protein etkileşim türleri ayrıntılı olarak incelenmiş, bileşiklerin olası biyolojik etkinlikleri tartışılmıştır. Ayrıca, ADMET tahminleri gerçekleştirilerek bileşiklerin farmakokinetik özellikleri ve ilaç adaylığı potansiyelleri değerlendirilmiştir.
Özet (Çeviri)
In this thesis, the structural, electronic, and biological properties of pyrrolidine-derived organic compounds were investigated using combined experimental and theoretical methods. The crystal structures of the synthesized compounds were determined by single-crystal X-ray diffraction (SCXRD) and analyzed in terms of geometric parameters and molecular conformation. Intermolecular interactions governing crystal packing were examined through Hirshfeld surface analysis and fingerprint plots. Density functional theory (DFT) calculations were performed to evaluate the electronic properties of the compounds. Optimized geometries, HOMO–LUMO energy gaps, and molecular electrostatic potential (MEP) surfaces were calculated and compared with experimental data. Molecular docking studies were carried out against selected cancer-related and neurological target proteins to assess the biological activity potential of the compounds. Binding energies and ligand–protein interactions were analyzed, and ADMET predictions were conducted to evaluate drug-likeness and pharmacokinetic properties. Overall, this study provides insight into the relationship between crystal structures, electronic properties, and biological interactions of pyrrolidine derivatives, contributing to drug design and discovery research.
Benzer Tezler
- Piridin ve türevlerinin sulu TiO2 süspansiyonlarındaki heterojen fotokatalitik degradasyon kinetiğinin incelenmesi
A theoretical investigation on the heterogeneous photocatalytic degradation of pyridine and its derivaties in aqueous TiO2 suspensions
YELDA YALÇIN
- Organik fotokromik bileşiklerin sentezi ve fotokromik özelliklerinin incelenmesi
Synthesis of organic photochromic compounds and investigation of their photochromic properties
ERSİN ORHAN
- Reaktif doymamiş gruplar i̇çeren ftalosiyaninlerin sentezi ve uygulamalari
Synthesis and applications of phtahalocyanines containing reactive unsaturated groups
MURAT YÜZEROĞLU
Doktora
Türkçe
2024
KimyaYıldız Teknik ÜniversitesiKimya Ana Bilim Dalı
PROF. DR. GÜLNUR KESER KARAOĞLAN
- Hekzadeka sübstitüe ftalosiyaninlerin X-ışını kristallografisi ve NMR spektroskopisi ile yapısal özelliklerinin incelenmesi
Investigation of the structural properties of hexadeca-substituted phthalocyanines by X-ray crystallography and NMR spectroscopy
ARMAĞAN ATSAY
- Development of carbazole based donor acceptor typed fluorescent materials for oled applications
Oled uygulamalarında kullanılmak üzere karbazol esaslı donör akseptör tip floresans malzemelerin geliştirilmesi
GÜLÇİN NALBANTOĞLU
