Geri Dön

Flavonoidlerin ortodontik relapsla olan ilişkisinin bilgisayar destekli ilaç tasarımı yöntemiyle incelenmesi

Investigation of the relationship between flavonoids and orthodontii relapse using computer-aided drug design methods

PDF İndir

  1. Tez No: 1012981
  2. Yazar: MÜGE AKYILDIZ
  3. Danışmanlar: DOÇ. DR. BARIŞ BAŞER
  4. Tez Türü: Diş Hekimliği Uzmanlık
  5. Konular: Diş Hekimliği, Dentistry
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2026
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Karadeniz Teknik Üniversitesi
  10. Enstitü: Diş Hekimliği Fakültesi
  11. Ana Bilim Dalı: Ortodonti Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Ortodonti Bilim Dalı
  13. Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.

Özet

Ortodontik tedavi sonrası diş pozisyonlarının korunması, doku remodeling mekanizmaları ve matriks metalloproteinaz (MMP) enzimlerinin yol açtığı ortodontik relaps nedeniyle güçleşmektedir. Bu çalışmada, relaps sürecinde anahtar rol oynayan MMP-2, -7, -8 ve -9 enzimlerine karşı doğal kaynaklı flavonoid türevlerinin inhibitör etkilerini ve yapısal özelliklerini belirlemek amacıyla in siliko yöntemler kullanılmıştır. Çalışma kapsamında, hedef enzimlerin 3 boyutlu yapıları ve aktif bölgeleri belirlenerek 100 adet flavonoid türevli ligand hazırlanmıştır. Kontrol grubu (NNGH) ve referans ligandlar eşliğinde moleküler kenetlenme (docking) yapılarak serbest bağlanma enerjileri hesaplanmıştır. Öne çıkan bileşiklerin ilaç olabilme potansiyelleri ADMET özellikleri üzerinden değerlendirilmiş ve en yüksek afiniteye sahip komplekslerin kritik amino asit etkileşimleri analiz edilmiştir. Moleküler kenetlenme sonuçlarına göre; MMP-2 enzimi için 91 numaralı ligand (- 11.98 kcal/mol) His121 ve Leu138 kalıntılarıyla; MMP-7 için 87 numaralı ligand (-10.14 kcal/mol) Tyr167 ve Ala177 amino asitleriyle; MMP-8 için 69 numaralı ligand (-10.59 kcal/mol) Leu160 ve Tyr219 üzerinden; MMP-9 için ise 77 numaralı ligand (-11.41 kcal/mol) Gln108 ve Tyr179 amino asitleriyle en güçlü bağlanma afinitesini ve stabil kompleksleri oluşturmuştur. Bu çalışma, ortodontik relapsın önlenmesine yönelik doğal kaynaklı potansiyel MMP inhibitörlerinin in siliko yöntemlerle hızla belirlenmesine katkı sağlamış, gelecekte yapılacak in vitro ve in vivo çalışmalara kapsamlı bir bilimsel rehber sunmuştur.

Özet (Çeviri)

The preservation of ideal tooth positions following orthodontic treatment is hindered by orthodontic relapse, which is driven by tissue remodeling mechanisms and matrix metalloproteinase (MMP) enzymes. In this study, in silico methods were employed to determine the inhibitory effects and structural properties of naturally derived flavonoid derivatives against MMP-2, -7, -8, and -9 enzymes, which play a key role in the relapse process. Within the scope of the study, the three-dimensional structures and active sites of the target enzymes were identified, and 100 flavonoid-derived ligands were prepared. Molecular docking was performed in the presence of a control group compound (NNGH) and reference ligands to calculate free binding energies. The drug-likeness potentials of the prominent compounds were evaluated through ADMET properties, and the critical amino acid interactions of the complexes with the highest affinity were analyzed at the molecular level. According to the molecular docking results; for the MMP-2 enzyme, ligand 91 (- 11.98 kcal/mol) formed critical interactions with His121 and Leu138 residues; for MMP- 7, ligand 87 (-10.14 kcal/mol) displayed the best affinity by forming hydrogen bonds with amino acids such as Tyr167 and Ala177; for MMP-8, ligand 69 (-11.41 kcal/mol) exhibited the strongest binding via Leu160 and Tyr219; and for MMP-9, ligand 77 (-11.41 kcal/mol) was determined to have the highest affinity, forming stable complexes with Gln108 and Tyr179 amino acids. In conclusion, this study has contributed to the rapid identification of naturally derived potential MMP inhibitors for preventing orthodontic relapse using in silico methods, and provides a comprehensive scientific guidance for future in vitro and in vivo studies.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    267537

    Flavonoidlerin ve metal komplekslerinin yüksek basınçlı sıvı kromatografisi yöntemiyle yan yana belirlenmesi

    Determination of flavonoids and metal complexes of flavonoids simultaneously by high pressure liquid chromatography

    DENİZ ÇIKLA YILMAZ

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2010

    Eczacılık ve FarmakolojiMarmara Üniversitesi

    Analitik Kimya Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. MÜRŞİD PEKİN

  2. Tez No

    315541

    Flavonoidlerin yapıları ve onların fizikokimyasal özellikleri

    Flavonoids structures and their physicochemical properties

    HÜSEYİN ŞAFAK ERÇEBİ

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2012

    KimyaKaradeniz Teknik Üniversitesi

    Fizikokimya Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. RZA ABBASOĞLU

  3. Tez No

    329293

    Flavonoidlerin kanser hücrelerine etkisi

    Effect of flavonoids on the cancer cells

    GÜLSÜM TEKİN YALÇIN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2013

    BiyokimyaSelçuk Üniversitesi

    Tıbbi Biyokimya Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. BAHADIR ÖZTÜRK

  4. Tez No

    455684

    Flavonoidlerin kontrollü salımı için nanopolimerik sistemler

    Nanopolymeric systems for the controlled release of flavonoids

    FULDEN ZEYNEP KALKAN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2016

    BiyoteknolojiEge Üniversitesi

    Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. SİNAN AKGÖL

  5. Tez No

    522786

    Flavonoidlerin seçimli ayrımı için manyetik moleküler baskılı polimer sentezi

    Magnetic molecularly impri̇nted polymer synthesi̇s for selecti̇ve separati̇on of flavonoi̇ds

    MERVE AKYÜZ

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2018

    Polimer Bilim ve Teknolojisiİstanbul Üniversitesi

    Kimya Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. KEVSER SÖZGEN BAŞKAN

Geri Dön