Assessment of anticarcinogenic potentials of punica granatum peel extracts by network pharmacological and biological methods
Punica granatum kabuk özütlerinin antikarsinojenik potansiyellerinin ağ farmakolojisi ve biyolojik yöntemlerle belirlenmesi
- Tez No: 1014630
- Danışmanlar: DR. ÖĞR. ÜYESİ ÖZGÜR CEM ERKİN
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyomühendislik, Bioengineering
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2026
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Adana Alparslan Türkeş Bilim ve Teknoloji Üniversitesi
- Enstitü: Lisansüstü Eğitim Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyomühendislik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
P. granatum kabuğundan elde edilen bileşiklerin antitümör etkinliği, bütünleşik bir in silico ve in vitro yaklaşım aracılığıyla değerlendirilmiştir. Hesaplamalı yöntemler, özellikle KHDAK'nin onkojenık sürücülerinden olan EGFR ve klinik açıdan anlamlı varyantları üzerinde durularak, olası moleküler hedeflerin belirlenmesi ve ligand–protein etkileşimlerinin karakterizasyonu amacıyla kullanılmıştır. Buna paralel olarak, tümör mikroçevresi koşullarını daha iyi yansıtabilmek amacıyla 2B ve 3B KHDAK modellerini kapsayan in vitro doğrulama çalışmaları yürütülmüştür. Hücre canlılığı, migrasyon, klonojenisite, hücre döngüsü ilerlemesi, apoptoz indüksiyonu ve DNA hasarının değerlendirilmesi için kapsamlı çalışmalar ve bunları destekleyen transkripsiyonel analizler uygulanmıştır. Nümerik sonuçlar, gallagyldilaktonu, 1. ve 2. nesil TKİ'lerle karşılaştırılabilir bağlanma özellikleri sergileyen ve birçok klinik açıdan önemli varyanta yüksek afinite gösteren potansiyel bir EGFR inhibitörü olarak ortaya koymuştur. Birden fazla ligandın MMP9'a elverişli biçimde bağlandığını sergileyen bulgular, söz konusu olan ligandların yeni metalloproteinaz inhibitörlerinin geliştirilmesi için potansiyel taşıdığını göstermektedir. Deneysel sonuçlar, P. granatum kabuk ekstraktının A549 hücre modellerinde zamana ve doza bağlı bir şekilde antiproliferatif ve antimigratuvar etkilere sebep olduğunu göstermektedir. Kemotaksi ile indüklenen migrasyona karşı oluşan antimigratuvar etkinin daha belirgin olması, nümerik bulguların kabuk bileşiklerinin olası hedeflerinden olan EGFR'nin ve MMP9'un öne sürülmesi ile desteklenmektedir. Ayrıca ekstraktın koloni oluşumunu inhibe ettiği, apoptozu ve hücre döngüsü duraklamasını indüklediği ve DNA hasarının birikimine sebep olduğu gösterilmiştir.
Özet (Çeviri)
The antitumor efficacy of P. granatum peel-derived compounds was evaluated via an integrated in silico and in vitro approach. Computational methods were employed to identify potential molecular targets and characterize ligand-protein interactions, with particular emphasis on the NSCLC oncogenic driver EGFR and its clinically relevant variants. Concomitant in vitro validation was conducted using 2D and 3D NSCLC models to better recapitulate tumor microenvironment conditions. A comprehensive set of assays was applied to assess cell viability, migration, clonogenicity, cell cycle progression, apoptosis induction, and DNA damage, with supporting transcriptional analyses conducted as well. Computational results determined gallagyldilacton as a potential EGFR inhibitor that displayed binding comparable to 1st and 2nd generation TKIs, with high affinity towards many clinically relevant variants. Multiple ligands were shown to bind favorably to MMP9, indicating potential for the development of novel metalloproteinase inhibitors. Experimental results demonstrate that P. granatum peel extract mediates antiproliferative and antimigratory effects in A549 cell models in a time- and dose-dependent manner. Antimigratory effects were higher chemotaxisinduced migration, which is corroborated through computational findings identifying EGFR and MMP9 as potential targets of peel compounds. Furthermore, the extract was shown to inhibit colony formation, induce apoptosis, cell cycle arrest, and mediate the accumulation of DNA damage.
Benzer Tezler
- Oral çörek otu yağı tüketiminin, azoksimetan/ dekstan sodium sülfat ile kolon kanseri indüklenmiş C57BL/6 farelerindeki hastalığa etkisi
The effect of oral black seed oil consumption on disease in C57BL/6 mice with azoxymethane/dextran sodium sulfate (aom/dss)-induced colon cancer
SELMAN CİHANGİR
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2026
Genel Cerrahiİstanbul Medeniyet ÜniversitesiGenel Cerrahi Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. ÖZGÜR EKİNCİ
- Yeraltı sularında yüksek florürün dağılımı ve dental florozis için sağlık bilgi sistemlerinde CBS tabanlı karar destek sistemi geliştirilmesi
Distribution of high fluoride in groundwater and development of GIS-based decision support system in health information systems for dental fluorosis
PERİHAN DERİN
Doktora
Türkçe
2024
Çevre MühendisliğiHarran ÜniversitesiÇevre Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MEHMET İRFAN YEŞİLNACAR
- Wintergreen yağının antitümorojenik ve sitotoksik etkilerinin araştırılması
The investigation of antitumorigenic and cytotoxic properties by wintergreen oil
KÜBRA ÇELİK
- Monosiklik ve bisiklik monoterpen uygulamasının deneysel beyin tümör modeli üzerine potansiyel etkilerinin in vitro yöntemlerle araştırılması
Investigation of potential effects of monocyclic and bicyclic monoterpenes on experimental brain tumour model using by in vitro methods
ELANUR AYDIN
- Posidonia oceanica (L.) Delile`nin farklı parametrelere bağlı fenolik bileşik değişikliği ve farmasötik değerlendirmesi
Posidonia oceanica (L.) Delile`s phenolic compound variation in different conditions of and pharmaceutical assessment
MEHMET ZEKİ HAZNEDAROĞLU
Doktora
Türkçe
2004
Eczacılık ve FarmakolojiEge ÜniversitesiFarmasötik Botanik Ana Bilim Dalı
PROF.DR. AHMET ULVİ ZEYBEK