Geri Dön

Pozitif kan kültürü şişesinden hızlı tanımlama yöntemlerinin karşılaştırılması ve antibiyotik dirençlerinin öngörülmesi

Comparison of rapid identification methods from positive blood culture bottles and prediction of antibiotic resistance

PDF İndir

  1. Tez No: 1022938
  2. Yazar: MEHMET BAŞAYİĞİT
  3. Danışmanlar: DOÇ. DR. FATMA ERDEM
  4. Tez Türü: Tıpta Uzmanlık
  5. Konular: Mikrobiyoloji, Microbiology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2026
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Eskişehir Osmangazi Üniversitesi
  10. Enstitü: Tıp Fakültesi
  11. Ana Bilim Dalı: Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.

Özet

Kan dolaşımı enfeksiyonlarında etkenlerin hızlı tanımlanması ve direnç öngörüsü, ampirik tedavinin erken yönlendirilmesinde kritiktir. Çalışmaya Gram boyamada zincir yapan Gram-pozitif kok veya Gram-negatif basil görülen 284 monobakteriyel pozitif şişe dahil edilmiş, hızlı tanımlama için doğrudan kan kültürü şişesinden Jelli serum ayrıştırma tüpü ve MBT Sepsityper IVD Kit, GVS Abluo ve Millex 5 µm por çaplı filtrelerle peletler elde edilmiş, MALDI-TOF MS ile tanımlanarak karşılaştırılmıştır. Tanımlanan Enterococcus spp. için vankomisin direncini öngörmede Resazurin Mikroplak Metodu (RMM), Klebsiella spp. için karbapenem direncini öngörmede Karba NP testi değerlendirilmiş, iki test de hızlı tanımlamada elde edilen peletlerden gerçekleştirilmiştir. Direnç testleri buyyon mikrodilüsyon ve gerçek zamanlı PZR ile karşılaştırılarak değerlendirilmiştir. En sık etkenler Enterobacterales (%47,9), enterokoklar (%27,8) ve Acinetobacter (%9,2) idi. ≥1,30 skorda kompleks/tür düzeyinde doğru tanımlama JSAT %93,7, Millex %86, Sepsityper %86,6, GVS %58,9 oranlarında bulunmuştur. Karba NP testi 71 Klebsiella izolatında (direnç prevalansı %80,3) duyarlılık %91,2, özgüllük %100,0, κ 0,804 olarak saptanmıştır. 53 izolatta en az bir karbapenemaz geni olmak üzere blaNDM (s=30) blaOXA-48 (s=25), blaKPC (s=22), blaCTX (s=31) genleri saptanmıştır. RMM, 63 Enterococcus izolatında (direnç prevalansı %20,6) duyarlılık %30,0, özgüllük %93,9, κ 0,284 ile zayıf bulunmuştur. Sonuç olarak JSAT, yüksek doğruluk ve düşük maliyetiyle rutine uygun bir hızlı tanımlama yöntemi, modifiye Karba NP yüksek direnç prevalanslı çalışmalarda güvenilir bir öngörü testi olarak öne çıkmıştır.

Özet (Çeviri)

Rapid identification of agents and prediction of resistance in bloodstream infections are critical for the early guidance of empirical therapy. The study included 284 monobacterial positive bottles in which chain-forming Gram-positive cocci or Gram-negative bacilli were observed on Gram staining. For rapid identification, pellets were obtained directly from the blood culture bottle using the Gel serum separation tube, the MBT Sepsityper IVD Kit, the GVS Abluo and the Millex filter with 5 µm pores, and were compared with identification by MALDI-TOF MS. Resazurin Microplate Method (RMM) was evaluated to predict vancomycin resistance in identified Enterococcus spp. and Carba NP test was evaluated to predict carbapenemase production in Klebsiella spp., both tests were performed on the obtained pellets. Resistance tests were evaluated by comparison with broth microdilution and real-time PCR. The most frequent agents were Enterobacterales (47.9%), enterococci (27.8%), and Acinetobacter spp. (9.2%). At a score ≥1.30, correct identification at the complex/species level was found to be 93.7% for GSST, 86% for Millex, 86.6% for Sepsityper, and 58.9% for GVS. In 71 Klebsiella isolates (resistance prevalence 80.3%), the Carba NP test showed a sensitivity of 91.2%, specificity of 100.0%, and κ of 0.804. At least one carbapenemase gene was detected in 53 isolates, comprising blaNDM (n=30), blaOXA-48 (n=25), blaKPC (n=22), and blaCTX (n=31). In 63 Enterococcus isolates (resistance prevalence 20.6%), the RMM has showed poor performence with a sensitivity of 30.0%, specificity of 93.9%, and κ of 0.284. In conclusion, the GSST stood out as a rapid identification method suitable for routine use owing to its high accuracy and low cost; the modified Carba NP emerged as a reliable predictive test in this study with high resistance rate.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    408411

    Sepsisin mikrobiyolojik tanısında farklı yöntemlerin karşılaştırılması

    Comparison of different methods in the microbiological diagnosis of sepsis

    AYSUN GÖRKEM

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2015

    MikrobiyolojiErciyes Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. MUSTAFA ALTAY ATALAY

  2. Tez No

    478010

    Erişkin yoğun bakım ünitelerindeki bakteriyemi etkeni olarak saptanan gram pozitif bakterilerin ve direnç genlerinin hızlı tanısında mikroarray ve lizis filtrasyon yöntemlerinin karşılaştırılması

    Comparison of microarray and lysis filtration combined maldi tof ms procedures for the rapid diagnosis of gram positive bacteries and their resistance genes in adult intensive care unit patients

    AYŞE ARSLAN

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2017

    MikrobiyolojiEge Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. MEHMET ALİ ÖZİNEL

  3. Tez No

    909458

    Candida izolatlarında kan kültürü şişesinden hızlı antifungal yöntemi güvenilir mi?

    Is the rapid antifungal testing from blood culture bottles reliable for candida isolates?

    DAMLA KÖKLÜ

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2024

    MikrobiyolojiSağlık Bilimleri Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    DR. DENİZ TURAN

  4. Tez No

    805316

    Doğrudan pozitif kan kültür şişelerinden matriks aracılı lazer dezorpsiyon iyonizasyon uçuş zamanı kütle spektrometresi (MALDI-TOF MS) ile hızlı mikrobiyal tanımlamada farklı yöntemlerin araştırılması

    Investigation of different methods in rapid microbial identification from directly positive blood culture bottles by matrix assisted laser desorption ionization time of flight mass spectrometry (MALDI-TOF MS)

    DİLAN KARADAĞ

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2023

    MikrobiyolojiDokuz Eylül Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. MAHMUT CEM ERGON

  5. Tez No

    985928

    Bakteriyemi tanısında hızlı identifikasyon ve duyarlılık test yöntemlerinin değerlendirilmesi

    Evaluation of rapid identification and susceptibility testing methods in the diagnosis of bacteremia

    FERİT AYAZ

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2025

    MikrobiyolojiVan Yüzüncü Yıl Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    DR. ÖĞR. ÜYESİ AYŞE ÖZKAÇMAZ

Geri Dön