Spesifik T hücre reseptör yolağı yetmezliklerinde immün repertuvar profillerinin belirlenmesi
Determination of immüne repertoire profile in specific T-cell receptor deficiencies
- Tez No: 1023708
- Danışmanlar: DOÇ. DR. BARAN ERMAN
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Allerji ve İmmünoloji, Çocuk Sağlığı ve Hastalıkları, Allergy and Immunology, Child Health and Diseases
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2026
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Hacettepe Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Pediatrik Temel Bilimler Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: İmmünoloji Bilim Dalı
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
T-hücre aktivasyonu, yalnızca T-hücre reseptörü aracılığı ile değil, aynı zamanda kostimülatuvar moleküller üzerinden de gerçekleşen tamamlayıcı sinyallerle tam etkinliğe ulaşır. CD28 yolağı bu süreçte en kritik mekanizmalardan biridir ve bu yolakta görev alan CARMIL2, NF-κB aktivasyonu ve T-hücre fonksiyonel farklılaşması için gereklidir. CD28 ailesinin başka bir üyesi olan ICOS ise özellikle foliküler yardımcı T-hücre (Tfh) gelişimi, germinal merkez oluşumu ve antikor üretimi için esastır. Bu moleküllerdeki kusurlar; tekrarlayan enfeksiyonlar, immün disregülasyon ve T-hücre fonksiyon kaybıyla seyreden primer immün yetmezlik tablolarına yol açmakta olduğu bilinmektedir. Bu nedenle, kostimülasyon yolağı bozukluklarının adaptif bağışıklık çeşitliliğini nasıl etkilediğinin anlaşılması önemlidir. Her iki genetik bozuklukla ilgili immün fenotipik ve klinik çalışmalar bulunsa da CARMIL2 ve ICOS eksikliğinin T-hücre reseptör repertuvarı üzerindeki etkilerini karşılaştırmalı olarak inceleyen herhangi bir çalışma literatürde bulunmamaktadır. T-hücre gelişimi, klonal dağılım, CDR3 motifleri ve çeşitlilik ölçütlerinin bu hastalıklarda nasıl değiştiği bilinmemektedir. Bu durum, kostimülatör sinyal iletim bozukluklarının immün çeşitlilik üzerindeki etkilerini anlamada önemli bir boşluk oluşturmaktadır. Bu çalışmada, CARMIL2 ve ICOS eksikliği tanısı almış hastalardan izole edilen periferal kan mononükleer hücrelerden elde edilen total RNA'lar kullanılarak yarı iç içe PCR ile T-hücre reseptör kütüphanesi hazırlanacak, Illumina tabanlı yeni nesil dizileme yapılacak ve veriler Immunarch, PROMIDISα, McPAS-TCR ve TCRdb kullanılarak analiz edilecektir. Bu tez çalışmasının amacı, CARMIL2 ve ICOS eksikliklerinde T-hücre reseptör repertuvarının yapısal ve fonksiyonel özelliklerini tanımlamak, iki farklı kostimülasyon kusurunun immün sistemde bıraktığı özgün izleri ortaya koymak ve literatürdeki boşluğu doldurmaktır.
Özet (Çeviri)
T-cell activation is achieved not only through signals delivered via the T-cell receptor but also through complementary signals transmitted by costimulatory molecules. The CD28 pathway is one of the most critical mechanisms in this process, and CARMIL2, which functions within this pathway, is essential for NF-κB activation and functional differentiation of T-cells. Another member of the CD28 family, ICOS, is crucial for follicular helper T-cell (Tfh) development., germinal center formation, and antibody production. Defects in these molecules are known to cause primary immunodeficiency conditions characterized by recurrent infections, immune dysregulation, and impaired T-cell function. Therefore, understanding how costimulatory pathway defects affect adaptive immune diversity is of significant importance. Although immunophenotypic and clinical studies of both genetic deficiencies exist, no study in the literature has comparatively examined the impact of CARMIL2 and ICOS deficiencies on the T-cell receptor repertoire. How T-cell development, clonal distribution, CDR3 motifs, and diversity indices are altered in these disorders remain unknown. This gap represents a major limitation in understanding the effects of costimulatory signaling defects in immune repertoire diversity. In this study, a T-cell receptor library will be prepared using total RNA obtained from peripheral blood mononuclear cells of patients diagnosed with CARMIL2 and ICOS deficiencies through a semi-nested PCR approach. Illumina-based next-generation sequencing will be performed, and the resulting data will be analyzed using Immunarch, PROMIDISα, McPAS-TCR, and TCRdb. The aim of this thesis is to characterize the structural and functional features of the T-cell receptor repertoire in CARMIL2 and ICOS deficiencies, to identify the distinct immunological signatures resulting from these two costimulation defects, and to fill the existing gap in the literature.
Benzer Tezler
- Targeting and activation of antigen specific CD8+ T cells with peptide-major histocompatibility complex I tetramers
Peptit-majör histokompatibilite kompleks I tetramerleri ile antijen spesifik CD8+ T hücrelerin hedeflenmesi ve aktivasyonu
ŞAFAK CEREN USLU ŞIVGIN
Doktora
İngilizce
2025
BiyoteknolojiHacettepe ÜniversitesiTemel Onkoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. HANDE CANPINAR
- The effect of interleukin 7 on CD8+T cell accumulation and differentiation in the presence of adenosine signaling
İnterlökin 7 ve adenozin yolaklarının CD8+T hücresi uyarılma ve baskılamasına etkileri
SUAT TÜÇER
Yüksek Lisans
İngilizce
2020
Biyolojiİhsan Doğramacı Bilkent ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. SERKAN İSMAİL GÖKTUNA
YRD. DOÇ. DR. ÇAĞLAR ÇEKİÇ
- Molecular mechanisms of adenosine regulation of helper T cell responses
Adenozinin yardımcı T hücresi yanıtlarının regülasyonundaki moleküler mekanizmaları
ALTAY KOYAŞ
Yüksek Lisans
İngilizce
2017
Allerji ve İmmünolojiİhsan Doğramacı Bilkent ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. ÇAĞLAR ÇEKİÇ
- BMPR1A'nın plazma hücrelerinin gelişimine etkisinin ve germinal merkez dinamiklerindeki öneminin araştırılması
Investigation of the effect of bmpr1a in plasma cell development and its importance in germinal center dynamics
SELDA KARAASLAN
Doktora
Türkçe
2021
Allerji ve İmmünolojiHacettepe ÜniversitesiTemel Onkoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. AYŞE LALE DOĞAN
- Targeting circulating breast cancer stem cells via mTOR and WNT inhibitors after bone metastasis
Sirküle meme kanseri kök hücrelerinin kemik metastazı sonrası mTOR ve WNT inhibitörleri ile hedeflenmesi̇
ÖZLEM ALTUNDAĞ ERDOĞAN
Doktora
İngilizce
2025
BiyokimyaHacettepe ÜniversitesiKök Hücre Ana Bilim Dalı
PROF. DR. BETÜL ÇELEBİ SALTIK