Keçilerde pou1f1 ve dgat1 gen polimorfizmi ve süt verimi ile ilişkisi
Investigation of pou1f1 and dgat1 gene polymorphisms and their association with milk yield in goats
- Tez No: 1024025
- Danışmanlar: PROF. DR. HASAN MEYDAN
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoteknoloji, Biotechnology
- Anahtar Kelimeler: DNA dizileme, DNA izolasyonu, DNA mutasyon analizi, DNA sequencing, DNA extraction, DNA mutational analysis
- Yıl: 2026
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Akdeniz Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Tarımsal Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Bu çalışma,“Halk Elinde Küçükbaş Hayvan Islahı Ülkesel Projesi”kapsamında Antalya ilinde yetiştirilen Honamlı ve Kıl keçi ırklarında süt verimi ile ilişkili genetik faktörlerin belirlenmesi amacıyla yürütülmüştür. Araştırmada 50 baş keçiye (25 Honamlı ve 25 Kıl keçisi) ait kan örnekleri kullanılmıştır. Genomik DNA, modifiye edilmiş tuz çöktürme yöntemi kullanılarak izole edilmiştir. POU1F1 (450 bç) ve DGAT1 (328 bç) genlerinin hedef bölgeleri Polimeraz Zincir Reaksiyonu (PCR) ile çoğaltılmış ve dizilenmiştir. POU1F1 lokusunda toplam 15, DGAT1 lokusunda ise 8 SNP (Tek Nükleotit Polimorfizmi) tanımlanmıştır. Belirlenen SNP'ler ile süt verimi parametreleri arasındaki ilişkileri değerlendirmek amacıyla istatistiksel analizler SPSS programı kullanılarak, ANOVA ile gerçekleştirilmiştir. POU1F1 geninde, T164G mutasyonunun Honamlı keçilerinde süt verimi ile istatistiksel düzeyde ilişkili olduğu saptanmıştır (p=0.010). Bu lokusta, TT genotipine sahip bireylerin ortalama süt verimi 120.81 L iken, TG genotiplilerin verimi 177.15 L olarak ölçülmüştür. T416G mutasyonu ise yalnızca Kıl keçilerinde süt verimi ile bağlantılı bulunmuştur (p=0.023). DGAT1 geninde, C21095A mutasyonu anlamlı bir etkileşim sergilemiş (p=0.041) ve Kıl keçilerinde süt verimi ile istatistiksel bir ilişki ortaya koymuştur (p=0.024). Ayrıca, C21275G polimorfizminin Kıl popülasyonundaki süt verim özelliklerini etkileyebileceği değerlendirilmiştir (p=0.040). Popülasyon genetiği parametreleri, iki ırk arasında yüksek haplotip çeşitliliği ve yüksek gen akışı (Nm>4) olduğunu ortaya koymuş ve düşük bir genetik farklılaşmaya işaret etmiştir. Örnek genişliğinin kısıtlı olması göz önünde bulundurulduğunda, elde edilen bu ön bulgular yerli Türk keçi popülasyonlarında süt üretim özelliklerini iyileştirmeye yönelik Marker Destekli Seleksiyon programları için potansiyel aday belirteçler sunmakla birlikte, sonuçların daha geniş popülasyonlarda yapılacak çalışmalarla doğrulanmasına ihtiyaç duyulmaktadır.
Özet (Çeviri)
This study was carried out to determine the genetic factors associated with milk yield in Honamlı and Kıl goat breeds raised in Antalya province within the scope of the“National Project on Goat Breeding in the Hands of Breeders”(HEKIP). Blood samples belonging to 50 goats (25 Honamlı and 25 Kıl) were utilized in the research. Genomic DNA was extracted using the modified salting-out method. Target regions of the POU1F1 (450 bp) and DGAT1 (328 bp) genes were amplified by Polymerase Chain Reaction (PCR) and sequenced. A total of 15 SNPs (Single Nucleotide Polymorphisms) in the POU1F1 locus and 8 SNPs in the DGAT1 locus were identified. Statistical analyses were performed using SPSS software, ANOVA, to evaluate the associations between the identified SNPs and milk yield parameters. In the POU1F1 gene, the T164G mutation was found to be statistically associated with milk yield in Honamlı goats (p=0.010). At this locus, individuals with the TT genotype had an average milk yield of 120.81 L, while those with the TG genotype yielded 177.15 L. The T416G mutation showed a breed-specific trend, being associated with milk yield differences only in Kıl goats (p=0.023). In the DGAT1 gene, the C21095A mutation exhibited a significant interaction effect (p=0.041) and showed a statistical association with milk yield in Kıl goats (p=0.024). Furthermore, it was evaluated that the C21275G polymorphism could potentially affect milk production traits in the Kıl population (p=0.040). Population genetics parameters revealed high haplotype diversity and high gene flow (Nm > 4) between the two breeds, indicating a generally low genetic differentiation. Considering the limited sample size (n=25 per breed), these preliminary findings provide potential candidate markers for Marker-Assisted Selection programs aimed at improving milk production traits in native Turkish goat populations; however, the results need to be validated by future studies in larger animals.
Benzer Tezler
- Saanen ırkı keçilerde pou1f1 geni polimorfizmi ve verim özellikleri ile ilişkilerinin belirlenmesi
Determination of pou1f1 gene polymorphism and its association with production traits in saanen goats
RAZİYE IŞIK
- Saanen ırkı keçilerde, POU1F1 gen yolağında bulunan genlere ait polimorfizmlerin büyüme ve üreme özellikleri ile ilişkisinin belirlenmesi
Determination of relationship of the gene polymorphisms in the POU1F1 gene pathway with growth and reproductive traits in Saanen goats
NURSEN ŞENTÜRK
- Türkiye'deki yerli Honamlı ve Kıl keçilerinin et verimi yönünden moleküler düzeyde tanımlanması
Definition of local Honamlı and Hair goats in Türkiye in terms of meat production on the molecular level
ONUR VURAL
Doktora
Türkçe
2023
BiyoteknolojiAkdeniz ÜniversitesiTarımsal Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. HASAN MEYDAN
- Kilis keçilerinde pou1f1, prlr, β-lg, gh gen polimorfizmleri ve süt verim özellikleri ile ilişkisi
Pou1f1, prlr, β-lg, gh gene polymorphisms in Ki̇li̇s goats and its relationship with milk yield traits
ZÜHAL GÜNDÜZ
- POU1F1 genotiplerinin kıl keçilerinde büyüme özelliklerine etkisi
Effect of POU1F1 genotypes on growth traits in kil goats
BETÜL TİN
Yüksek Lisans
Türkçe
2022
ZiraatAydın Adnan Menderes ÜniversitesiZootekni Ana Bilim Dalı
PROF. DR. İBRAHİM CEMAL