Karaciğer kistik ekinokokkoz hastalarında uzun kodlamayan RNA (lncRNA) profilinin araştırılması
Investigation of long non-coding RNA (lncRNA) profiles in patients with hepatic cystic echinococcosis
- Tez No: 1024386
- Danışmanlar: PROF. DR. YUNUS EMRE BEYHAN
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Parazitoloji, Parasitology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2026
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Van Yüzüncü Yıl Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Parazitoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Bu çalışmanın amacı, karaciğer kistik ekinokokkoz tanılı olgularda serum kaynaklı uzun kodlamayan RNA (lncRNA) ekspresyon profilinin qRT-PCR yöntemi ile değerlendirilmesi ve hastalık patogenezi, immün yanıt ile kronik inflamasyon süreçleriyle ilişkili biyobelirteç adayı olabilecek lncRNA'ların belirlenmesidir. Çalışmanın materyalini Van Yüzüncü Yıl Üniversitesi Dursun Odabaş Tıp Merkezi'nde karaciğer kistik ekinokokkoz tanısı doğrulanmış hastalar ile sağlıklı kontrol grubundan elde edilen serum örnekleri oluşturdu. Elde edilen RNA örneklerinin miktar tayini florometrik yöntem ile belirlendi ve ardından tamamlayıcı Deoksiribonükleik Asit (cDNA) sentezi gerçekleştirildi. Hastaların ve kontrol grubunu oluşturan gönüllülerin örneklerinde GAS5, H19, HOTAIR, LINC00305, LINC-ROR, MALAT1, MEG3, MIAT ve NEAT1 ekspresyonları PPIA referans geni kullanılarak normalize edildi ve teknik tekrarlar biyolojik örnek düzeyinde ortalanarak Ct, ΔCt, ΔΔCt ve 2^-ΔΔCt değerleri hesaplandı. Çalışmada seçilen uzun kodlamayan RNA'ların ekspresyon düzeyleri gerçek zamanlı polimeraz zincir reaksiyonu (Real-Time PCR) yöntemi ile araştırıldı ve elde edilen veriler istatistiksel olarak değerlendirildi. Echinococcus granulosus ile ilişkili lncRNA verilerinin sınırlı olması nedeniyle sonuçların yorumlanmasında, konak-parazit etkileşimi modelleri açısından benzer özellikler gösteren Toxoplasma gondii çalışmalarından elde edilen lncRNA bulguları da dikkate alınmıştır. Bulgular değerlendirildiğinde, hasta grubunda GAS5 ve LINC-ROR genlerinde artış eğilimi, MALAT1 ve LINC00305 genlerinde ise azalma eğilimi gözlendi. H19, MIAT, MEG3, NEAT1 ve HOTAIR genlerinde ise istatistiksel olarak belirgin olmayan değişken ekspresyon profilleri saptandı. İncelenen genlerin hiçbirinde hasta-kontrol karşılaştırması p<0.05 düzeyinde anlamlılığa ulaşmamış olmakla birlikte; GAS5 için p=0.062, LINC-ROR için p=0.092 ve MALAT1 için p=0.072 düzeyinde elde edilen sınırda eğilimlerin, daha geniş örneklem grupları ve kist evresi gibi klinik değişkenlerle desteklenen ileri çalışmalarda yeniden değerlendirilmesi gereken potansiyel aday eksenleri işaret ettiği düşünülmektedir.
Özet (Çeviri)
In this study, it was aimed to evaluate the serum-derived long non-coding RNA (lncRNA) expression profile in patients diagnosed with hepatic cystic echinococcosis by qRT-PCR and to identify potential lncRNA biomarker candidates associated with disease pathogenesis, immune response, and chronic inflammation processes. The study material consisted of serum samples obtained from patients with confirmed hepatic cystic echinococcosis diagnosis and healthy control individuals at Van Yüzüncü Yİl University Dursun Odabaş Medical Center. The quantity of the obtained RNA samples was determined using a fluorometric method, followed by complementary Deoxyribonucleic Acid (cDNA) synthesis. In samples from patients and volunteers in the control group, the expression levels of GAS5, H19, HOTAIR, LINC00305, LINC-ROR, MALAT1, MEG3, MIAT, and NEAT1 were normalized using the PPIA reference gene, and Ct, ΔCt, ΔΔCt, and 2^-ΔΔCt values were calculated by averaging technical replicates at the biological sample level. The expression levels of the selected long non-coding RNAs were investigated using the Real-Time Polymerase Chain Reaction (Real-Time PCR) method, and the obtained data were statistically analyzed. Due to the limited availability of lncRNA data related to Echinococcus granulosus, lncRNA findings obtained from Toxoplasma gondii studies, which exhibit similar host-parasite interaction models, were also taken into consideration during the interpretation of the results. According to the findings, an increasing trend was observed in GAS5 and LINC-ROR expression levels in the patient group, whereas a decreasing trend was detected in MALAT1 and LINC00305 expression levels. H19, MIAT, MEG3, NEAT1, and HOTAIR exhibited variable expression profiles without statistically significant differences. None of the investigated genes reached statistical significance at the p<0.05 level in patient-control comparisons. However, borderline trends observed for GAS5 (p=0.062), LINC-ROR (p=0.092), and MALAT1 (p=0.072) suggest that these genes may represent potential candidate axes requiring further evaluation in future studies supported by larger sample sizes and clinical variables such as cyst stage
Benzer Tezler
- Effect of chymotrypsin on M1 type pyruvate kinase from rabbit muscle and L-type from sheep liver
Başlık çevirisi yok
NİLAY BAŞARAN
Yüksek Lisans
İngilizce
1987
BiyokimyaOrta Doğu Teknik ÜniversitesiBiyokimya Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. MERAL YÜCEL
- Bazı baharat ve ekstraktlarının gıda zehirlenmesi yapan bakteriler üzerine antimikrobiyal etkileri
Başlık çevirisi yok
ŞAHİKA AKTUĞ
Yüksek Lisans
Türkçe
1986
Gıda MühendisliğiEge ÜniversitesiGıda Bilimi ve Teknolojisi Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. MEHMET KARAPINAR
- Tavuk karaciğer gama-glutamil transferazının saflaştırılması ve bazı kinetik özelliklerinin araştırılması
The Purification of the chicken liver a gamma-glutamyl transferase and the research of some kinetic properties
FİLİZ TARCAN
- Effect of membrane fluidity on binding of 125I-Insulin to sheep liver membrane receptors
Başlık çevirisi yok
HÜSEYİN AVNİ ÖKTEM
- Karaciğer fokal lezyonlarının tanısında bilgisayarlı tomografi ve karaciğer sintigrafisi bulgularının değerlendirilmesi
Başlık çevirisi yok
HALUK AKMAN
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
1987
Radyoloji ve Nükleer Tıpİstanbul ÜniversitesiRadyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. OKTAY ÇOKYÜKSEL