Klebsiella pneumoniae tanımlanmasında ve antibiyotik direncinin belirlenmesinde elektrokimyasal biyosensör geliştirilmesi
Devoplepment of electrochemical biosensor for the identification and detection of antimicrobial resistance of Klebsiella pneumoniae
- Tez No: 1024752
- Danışmanlar: DR. ÖĞR. ÜYESİ NURULLAH ÇİFTÇİ
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Mikrobiyoloji, Microbiology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2026
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Kafkas Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Çoklu ilaç dirençli enfeksiyonlarda, Klebsiella pneumoniae'nin hızlı tespiti ve antibiyotik yanıtının zamanında belirlenmesi, etkili tedavi yönetimi için kritik bir öneme sahiptir. Bu çalışmada, hem K. pneumoniae tespiti hem de yakalanan hücre aracılı antibiyotik direnci profillemesi için çift fonksiyonlu bir impedimetrik aptasensör geliştirilmiştir. Grafen oksit ekran baskılı elektrotlar (GPHOXE), PVA-MPTS arayüzey tabakası ile modifiye edilmiş, ardından altın nanopartikül immobilizasyonu ve K. pneumoniae'ye özgü bir aptamerin immobilizasyonu gerçekleştirilmiştir. GPHOXE-PVA-MPTS-AuNPs-Apt platformunun tabaka tabaka üretimi, döngüsel voltametri (CV), elektrokimyasal empedans spektroskopisi (EIS), Fourier Transformed Infrared Spektroskopisi (FTIR), Taramalı elektron mikroskobu (SEM) ve Elemental Enerji Dispersif X ışınları spektroskopisi (EDX) analizleri ile doğrulanmıştır. Kronoimpedimetrik optimizasyon, bakteriyel tespit süresini 300 saniye olarak göstermiştir. Biyosensör, 10-10⁶ CFU/mL aralığında K. pneumoniae tespit aralığı, 2,56 CFU/mL en düşük tayin sınırı ve 7,26 CFU/mL en düşük tayin konsantrasyonu sınırını göstermiştir. Biyosensör ayrıca %2,77'lik ortalama göreceli standart sapma ile iyi bir tekrarlanabilirlik göstermiştir. Potansiyel olarak girişimde bulunabilecek farklı bakteri türlerine karşı iyi bir seçicilik sergilemiştir. Patojen tespitinin ötesinde, bakteri yakalanmış biyosensör yüzeyi, hızlı antibiyotik yanıtı izleme için kendi kendine sinyal üretebilme arayüzü olarak kullanılmıştır. Kronoimpedimetrik ölçümler, farklı antibiyotiklere karşı direnç ve duyarlılık gösteren K. pneumoniae yanıtları arasında seçici bir ayrım yapılmasını sağlarken, antibiyotik tedavisi kaynaklı bakteriyel hasarla ilişkili konsantrasyona bağlı bir impedans sinyali azalmasına neden olmuştur. Depolama stabilitesi olarak değerlendirildiğinde biyosensör soğukta saklama koşullarında kayda değer bir performans göstermiştir. Genel olarak, geliştirilen GPHOXE-PVA-MPTS-AuNPs-Apt biyosensörü, K. pneumoniae tespitini hızlı fenotipik yöntemlerle ve meropenem ve kolistine direncini aynı elektrokimyasal arayüzde entegre eden hassas, seçici ve tekrarlanabilir bir platform sağlamıştır.
Özet (Çeviri)
In multidrug-resistant infections, the rapid detection of Klebsiella pneumoniae and timely determination of its antibiotic response are critical for effective therapeutic management. In this study, a dual-functional impedimetric aptasensor was developed for both the detection of K. pneumoniae and antibiotic resistance profiling through captured-cell-mediated signal generation. Graphene oxide screen-printed electrodes (GPHOXE) were modified with a PVA-MPTS interfacial layer, followed by the immobilization of gold nanoparticles (AuNPs) and a K. pneumoniae-specific aptamer. The layer-by-layer fabrication of the GPHOXE-PVA-MPTS-AuNPs-Apt platform was confirmed by cyclic voltammetry (CV), electrochemical impedance spectroscopy (EIS), Fourier-transform infrared spectroscopy (FTIR), scanning electron microscopy (SEM), and energy-dispersive X-ray spectroscopy (EDX) analyses. Chronoimpedimetric optimization revealed an optimal bacterial detection time of 300 seconds. The developed biosensor exhibited a detection range of 10-10⁶ CFU/mL for K. pneumoniae, with a limit of detection (LOD) of 2.56 CFU/mL and a limit of quantification (LOQ) of 7.26 CFU/mL. Furthermore, the biosensor demonstrated excellent repeatability, with an average relative standard deviation (RSD) of 2.77%. High selectivity was observed against potentially interfering bacterial species. Beyond pathogen detection, the bacteria-captured biosensor surface was employed as a self-signal-generating interface for rapid antibiotic response monitoring. Chronoimpedimetric measurements enabled selective discrimination between antibiotic-resistant and antibiotic-susceptible K. pneumoniae responses, while antibiotic-induced bacterial damage resulted in a concentration-dependent decrease in impedance signals. Evaluation of storage stability demonstrated that the biosensor maintained remarkable performance under refrigerated storage conditions. Overall, the developed GPHOXE-PVA-MPTS-AuNPs-Apt biosensor provides a sensitive, selective, and reproducible platform that integrates rapid K. pneumoniae detection with phenotypic antibiotic resistance profiling on the same electrochemical interface, offering significant potential for clinical diagnostics and antimicrobial susceptibility assessment.
Benzer Tezler
- Investigation of the bacterial antibiotic resistance genes that isolated from wastewater effluents and the possibility of treatment by nanotechnology
Atıksu atıklarından izole edilen bakteriyel antibiyotik direnç genlerinin ve nanoteknoloji ile arıtılabilme imkanlarının incelenmesi
ALI AHMED TAHA TAHA
Yüksek Lisans
İngilizce
2023
BiyolojiÇankırı Karatekin ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ EMİN BOZKURT
DR. ÖĞR. ÜYESİ AYMAN ALBANNA
- Klebsiella pneumoniae kökenlerinde kolistin direncinin çeşitli yöntemlerle incelenmesi ve direncin MALDI-TOF yöntemiyle hızlı saptanması
Investigation of colistin resistance in klebsiella pneumoniae strains by various methods and rapid determination of resistance by MALDI-TOF method
SEÇİL İSKENDER
Yüksek Lisans
Türkçe
2019
Mikrobiyolojiİstanbul Üniversitesi-CerrahpaşaTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ÖMER KÜÇÜKBASMACI
- Klebsiella pneumoniae izolatlarının virülans özelliklerinin araştırılması
Investigation of the virulence characteristics of Klebsiella pneumoniae isolates
ENDER ÇETİNKAYA
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2025
MikrobiyolojiTrakya ÜniversitesiTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. CANAN ERYILDIZ
- Karbapanemaz dirençli enterobactericeae 'lerin antibiyotik duyarlılıklarının iki farklı panelle (phoenix BD) karşılaştırılması
Comparison of antibiotic susceptibility of carbapanemase resistant enterobactericeae with TWO different panels (phoenix BD)
HACER UĞURLU
Yüksek Lisans
Türkçe
2021
MikrobiyolojiKahramanmaraş Sütçü İmam ÜniversitesiMikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MURAT ARAL
- 2011-2015 yılları arasında komplike ve komplike olmayan üriner sistem infeksiyonlarında gram negatif bakteriyel etkenlerin direnç paternleri
Resistance patterns of gram-negative bacterial agents in complicated and uncomplicated urinary tract infections between 2011-2015
AYŞE NURİYE VARIŞLI
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2016
MikrobiyolojiSağlık BakanlığıTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. GÜLŞEN HAZIROLAN