Meme kanseri hastalarında kombine neoadjuvan tedavi yanıtının (Transtuzumab, pertuzumab, doclitaxel) biyoinformatik temelli metabolom analiziyle değerlendirilmesi
Evaluation of combined neoadjuvant therapy response (Transtuzumab, pertuzumab, doclitaxel) in breast cancer patients via bioinformatics-based metabolomics analysis
- Tez No: 1025007
- Danışmanlar: PROF. DR. ONUR ŞENOL
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoistatistik, Eczacılık ve Farmakoloji, Genel Cerrahi, Biostatistics, Pharmacy and Pharmacology, General Surgery
- Anahtar Kelimeler: Biyoinformatik, biyobelirteçler, meme kanseri, trastuzumab, pertuzumab, doclitaxel, metabolom analizi, Breast cancer, bioinformatics, biomarkers, trastuzumab, pertuzumab, doclitaxel, metabolomic analysis
- Yıl: 2025
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Atatürk Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Analitik Kimya Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Analitik Kimya (eczacılık) Bilim Dalı
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Amaç: Meme kanseri hastalarında neodjuvan tedavi için kombine olarak kullanılan trastuzumab, pertuzumab, doclitaxel ilaç etkin maddelerinin biyoinformatik temelli metabolom analiziyle değerlendirilip biyobelirteç bulunması amaçlanmıştır. Materyal ve Metot: Proje kapsamında HER2 pozitif meme kanseri tanısı almış toplam 20 gönüllü hasta ve 16 gönülllü sağlıklı kontrol grubu çalışmaya dahil edilecektir. HER2 pozitif meme kanseri hastalarına neadjuvan kombine tedavi olan trastuzumab, pertuzumab, doclitaxel verilecek. Çalışma kapsamında alınacak kan örnekleri uygun biyogüvenlik koşullarında toplanıp ön işleme adımlarına kadar uygun sıcaklıkta saklanacaktır. Bu analizlerle meme kanseri ve sağlıklı bireylerin hücrelerin metabolom analizle ddeğerlendirilmesi hedeflenmiştir. Ayrıca tüm gönüllü katılımcıların yazılı bilgilendirilmiş onam alınacak ve çalışma etik kurul onayı çerçevesinde yürütülecektir. Bulgular: Metabolomik analiz sonucunda toplam 205 metabolit tanımlanmış olup, bunların 199'unda hasta ve kontrol grupları arasında değişim gözlenmiştir. Gözetimsiz çok değişkenli analizlerde hasta ve kontrol gruplarının belirgin bir şekilde ayrıldığı belirlenmiştir. Çok değişkenli analizlerde hasta ve kontrol gruplarının belirgin şekilde ayrıldığı belirlenmiştir. ROC analizinde hem kalibrasyon hem de çapraz doğrulama için eğri altında kalan alan (AUC) değeri 1.000 olarak bulunmuştur. Permütasyon testi sonuçları da bu oluştrulan modelin güvenilir olduğunu desteklemiştir. Sonuç: Sonuç olarak bu çalışmada HER2 pozitif meme kanseri hastalarında belirgin bir metabolik yeniden programlanma meydana geldiğini göstermiştir. Elde edilen bulgular metabolomik yaklaşımın meme kanseri biyolojisinin anlaşılmasında önemli katkılar sağlayabileceğini ve belirlenen metabolitlerin gelecekte tanısal, prognostik ve tedavi yanıtını öngören biyobelirteç adayları olarak değerlendirilebileceğini ortaya koymaktadır.
Özet (Çeviri)
Aim: The aim of this study was to evaluate the therapeutic effects of trastuzumab, pertuzumab, and doclitaxel, which are used in combination as neoadjuvant treatment in breast cancer patients, through bioinformatics-based metabolomic analysis and to identify potential metabolic biomarkers associated with treatment response. Material and Method: The study included 20 HER2-positive breast cancer patients and 16 healthy controls. Patients received neoadjuvant trastuzumab, pertuzumab, and doclitaxel therapy. Serum samples were analyzed using metabolomic approaches, and the study was conducted with informed consent and ethics committee approval. Results: Metabolomic analysis identified a total of 205 metabolites, 199 of which showed variation between patient and control groups. Unsupervised multivariate analyses revealed a significant separation between patient and control groups. The area under the curve (AUC) value was found to be 1.000 in the ROC analysis for both calibration and cross-validation. Permutation test results also supported the reliability of the model developed. Conclusion: In conclusion, this study demonstrated that a significant metabolic reprogramming occurs in HER2-positive breast cancer patients. The findings suggest that the metabolomic approach can make important contributions to understanding breast cancer biology, and that the identified metabolites could be evaluated as potential diagnostic, prognostic, and treatment response predictive biomarkers in the future.
Benzer Tezler
- Neoadjuvan kemoterapi alan meme kanserli hastalarda patolojik yanıtın manyetik rezonans görüntüleme (MRG) bulgularıyla değerlendirilmesi
Magnetic resonance imaging (MRI) evaluation of pathologi̇cal response i̇n breast cancer after neoadjuvant chemotherapy
GÜLÇİN AKKAVAK PALAZ ALI
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2017
Radyoloji ve Nükleer Tıpİstanbul ÜniversitesiRadyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MENDUH DURSUN
DR. ÖĞR. ÜYESİ RAVZA SÜMEYYE YILMAZ
- Lokal ileri invaziv meme kanseri olan hastalarda neoadjuvan kemoterapiye yanıtın dinamik meme MR ile değerlendirilmesi
Evaluation of neoadjuvant chemotherapy response with dynamic contrast enhanced breast MRI in locally advanced invasive breast cancer
ÖZGE ORBAY
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2011
Radyoloji ve Nükleer TıpDokuz Eylül ÜniversitesiRadyodiagnostik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. PINAR BALCI
- Neoadjuvan kemoterapi alan yeni tanı meme kanseri hastalarında GA68-FAPI PET/BT'NİN katkısı
The contribution OF GA68-FAPI PET/CT IN newly diagnosed breast cancer patients receiving neoadjuvant chemotherapy
MELİS OFLAS
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2024
Radyoloji ve Nükleer Tıpİstanbul ÜniversitesiNükleer Tıp Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. DUYGU HAS ŞİMŞEK
- Meme kanserli hastalarda Flor-18 florodeoksiglukoz pozitron emisyon tomografisi/bilgisayarlı tomografisinin radyomiks analizinin neoadjuvan kemoterapi yanıtını öngörü değeri
Predictive value of radiomics analysis of Flor-18 flurodeoxyglucose positron emission tomography/computed tomography in response to neoadjuvant chemotherapy in breast cancer patients
DİLEK ALGUR
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2024
Radyoloji ve Nükleer TıpErciyes ÜniversitesiNükleer Tıp Ana Bilim Dalı
PROF. DR. AHMET TUTUŞ
- PREDICTING THE RESPONSE OF BREAST CANCER TO NEOADJUVANT CHEMOTHERAPY WITH MODERN IMAGING: A COMPARATIVE ANALYSIS OF ULTRASOUND VERSUS PET/MRI
MODERN GÖRÜNTÜLEME İLE MEME KANSERİNİN NEOADJUVAN KEMOTERAPİYE VERDİĞİ YANITIN ÖNGÖRÜLMESI: ULTRASON İLE PET/MR'IN KARŞILAŞTIRMALI ANALİZİ
SELİN SARAÇOĞLU
Yüksek Lisans
İngilizce
2024
Genel CerrahiUnıversıta Vıta-Salute San RaffaeleTıp Bilimleri Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ORESTE DAVIDE GENTILINI
DR. ROSA Dİ MİCCO