Geri Dön

Role of nuclear matrix protein c1d in regulation of transcription

Nükleer matriks proteini c1d'nin transkripsiyonunun regüle edilmesindeki rolü

  1. Tez No: 112547
  2. Yazar: DİLHAN ÖNCEL
  3. Danışmanlar: YRD. DOÇ. DR. UĞUR YAVUZER
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Biyoloji, Biology
  6. Anahtar Kelimeler: C1D, DNA-PK, çift sarmal DNA kırıkları, TAFI 48, C1D, DNA-PK, DNA Double-strand break, TAFI 48
  7. Yıl: 2001
  8. Dil: İngilizce
  9. Üniversite: İhsan Doğramacı Bilkent Üniversitesi
  10. Enstitü: Mühendislik ve Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 101

Özet

ÖZET NÜKLEER MATRİKS PROTEİNİ CID'NİN TRANSKRİPSİYONUN REGÜLE EDİLMESİNDEKİ ROLÜ Dilhan öncel Moleküler Biyoloji ve Genetik Yüksek Lisans Tez Yöneticisi: Assist. Prof. Uğur Yavuzer Ağustos 2001, 88 sayfa Nükleer matriks proteini C1D, DNA uçlarının doğrudan bağlanmasında ve V(D)J rekombinasyonunda rol oynayan DNA bağımlı protein kinazın (DNA-PK) bir aktivatörüdür. Ayrıca nükleer matriks proteini CID'nin, DNA-PK tarafından in vitro şartlarda fosforlanabildiği ve y irradyasyonu sonrası mRNA ve protein seviyesinin arttığı gösterilmiştir. Elimizdeki bilgiler çift sarmal DNA kırıklarına tepki olarak CID'nin DNA- PK'yı nükleer matrikse veya matrikse ilintili DNA 'ya, birçok hücresel olayı kontrol etmek amacıyla yönlendirebileceğini önermektedir. CID'nin biyolojik fonksiyonunu bulmaya yönelik bir denemede maya ikili hibrid sistemi uygulanmış ve CID'nin insan ribosomal promotorlarından transkripsiyonun doğru başlaması için gerekli olan SL1 'nın bir alt ünitesi olan TAFI 48'in bir kısmım kodlayan bir klon ile etkileştiği bulunmuştur. DNA-PK Polimeraz I transkripsiyonunu in vitro şartlarda bloke edebildiği için, C1D ve TAFI 48'in etkileşme ihtimali potensiyel bir önem arz etmektedir. Bu çalışmada, C1D ve TAFI 48'in mayada, in vitro şartlarda ve memeli hücrelerinde spesifik olarak etkileşime girdiği gösterilmiştir. Bu etkileşimin çift sarmal DNA kırıklarının etkisiyle DNA-PK tarafından rDNA'dan transkripsiyonun bloke edilmesinin düzenlenmesinde potansiyel rolleri olduğu düşünülmektedir.

Özet (Çeviri)

ABSTRACT ROLE OF THE NUCLEAR MATRIX PROTEIN C1D IN REGULATION OF TRANSCRIPTION Dilhan Öncel M.S in Molecular Biology and Genetics Supervisor: Assist. Prof. Uğur Yavuzer August 2001, 88 pages The nuclear matrix protein C1D is an activator of DNA-dependent protein kinase (DNA-PK), which is involved in non-homologous end joining and V(D)J recombination. Moreover, the nuclear matrix proteins C1D was shown to be phosphorylated in vitro by DNA-PK and its mRNA and protein levels have been demonstrated to be induced upon y- irradiation. The available information suggests that C1D may play a role in DNA DSB- response pathways by targeting DNA-PKcs to nuclear matrix and matrix-associated DNA where DNA-PK may regulate several cellular processes. In an attempt to identify the biological function of C1D, the yeast two-hybrid system was employed and C1D was found to interact with a partial clone of TAFI 48, which is a subunit of the promoter selectivity factor SL1 required for the accurate initiation of transcription from the human ribosomal promoter. The possibility of an interaction between C1D and TAFI 48 was potentially important as DNA-PK was found to be capable of repressing Polymerase I transcription in vitro. In this study, it was shown that C1D and TAFI 48 interact specifically in yeast, in vitro and in mammalian cells. It is believed that this interaction could have potential roles in regulating the repression of transcription from rDNA by DNA-PK in response to DNA double-strand breaks.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    129212

    Identification of the role of the nuclear matrix protein C1D in DNA repair and recombination

    Nükleer matriks proteini C1D'nin tamir ve rekombinasyondaki rolünün belirlenmesi

    TUBA ERDEMİR

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2002

    Tıbbi Biyolojiİhsan Doğramacı Bilkent Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. UĞUR YAVUZER

  2. Tez No

    83710

    Analysis of the function of the nuclear matrix-associated protein C1D

    Nükleer matriks proteini C1D'nin fonksiyonunun incelenmesi

    BİLADA BİLİCAN

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    1999

    Biyolojiİhsan Doğramacı Bilkent Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. UĞUR YAVUZER

  3. Tez No

    90979

    Mesane değişici epitel karsinomu tanısında nüksleri ve klinik progresyonu belirlemede nükleer matriks protein 22 (NMP22) ve mesane tümör antijeni ((BTA)'nin değeri

    Role of NMP22 and BTA tests for detection, recurrence and progression marker of transitional cell carcinoma of the bladder

    İLKER SEÇKİNER

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2000

    ÜrolojiAnkara Üniversitesi

    Üroloji Ana Bilim Dalı

  4. Tez No

    390244

    KHDAK hücre invazyonunda IL-6/SATB2/CD44 yolağının etkilerinin araştırılması

    Investigation of the effects of IL-6/SATB2/CD44 pathway on NSCLC invasion

    HAKAN KÜÇÜKSAYAN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2014

    Tıbbi BiyolojiPamukkale Üniversitesi

    Tıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. HAKAN AKÇA

  5. Tez No

    655269

    Investigation of the role of LAP1B in transcriptional regulation of muscle cells

    LAP1B proteinin kas hücrelerinin transkripsiyon regülasyonundaki rolünün araştırılması

    GÜLSÜM KAYMAN KÜREKÇİ

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2021

    Tıbbi BiyolojiHacettepe Üniversitesi

    Tıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. PERVİN RUKİYE DİNÇER

Geri Dön