Geri Dön

Mukopolisakkaridoz tip IVA mutasyonlarının moleküler genetik analizi

Molecular genetic analysis of mucopolysaccaridosis type IVA mutations

  1. Tez No: 118830
  2. Yazar: MÜGEN TERZİOĞLU
  3. Danışmanlar: DOÇ.DR. SERAP EMRE
  4. Tez Türü: Doktora
  5. Konular: Tıbbi Biyoloji, Medical Biology
  6. Anahtar Kelimeler: MPS IVA, mutasyon, polimorfizm, SSCP, DNA dizi analizi, MPS IVA, mutation, polymorphism, SSCP, sequence analysis
  7. Yıl: 2002
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Hacettepe Üniversitesi
  10. Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Tıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 1395

Özet

IV ÖZET Terzioğlu, M., Mukopolisakkaridoz tip IV A mutasyonlarının moleküler genetik analizi, Hacettepe Üniversitesi Sağlık Bilimleri Enstitüsü Tıbbi Biyoloji Programı Doktora Tezi, Ankara, 2002. Mukopolisakkaridozlar (MPS), sülfatlanmış glikozaminoglikanların lizozomlarda parçalanmasından sorumlu bir grup enzim eksikliği sonucu ortaya çıkan kalıtsal metabolik hastalıklardır. On farklı lizozomal enzimin yeraldığı bu yıkım yolunda, enzim eksikliği sonucu 10 farklı MPS tipi ortaya çıkmaktadır. Bu tiplerden MPS IVA, N-asetilgalaktozamin-6-sülfat sülfataz (GALNS) enzimi eksikliğiyle tanımlanmaktadır. Lizozomlarda keratan ve kondroitin-6-sülfat (KS ve K-6-S) yıkımından sorumlu GALNS eksikliği, bu substratların lizozomlarda birikmesine neden olmaktadır. Biriken KS ve K-6-S, özellikle kemik yapısının bozulmasına, korneal bulanıklığa, büyüme geriliğine, ve hepatomegaliye yolaçmaktadır. Bu çalışmada, 10 MPS IVA vakasının GALNS geninde, molekûler genetik analiz yöntemleriyle mutasyonlar belirlenmiştir. Toplam 14 ekzondan oluşan GALNS geni, PCR tepkimesi ile amplifiye edilmiştir. Ampüfiye edilen ekzonlar SSCP yöntemi ile incelenmiş ve yürüme kalıbında farklılık belirlenen ekzonlardaki nükleotid değişimleri sekans analizi ile belirlenmiştir. DNA dizi analizi reaksiyonu hem“reverse”hem de“forward”primerle gerçekleştirilmiştir. DNA dizi analizleri sonucu, 4 vakada (2, 3, 7 ve 8) homozigot durumda 389delG, 1 vakada (10) heterozigot durumda P179S, 2 vakada (6 ve 9) homozigot durumda 763delT, 1 vakada (4) homozigot durumda 929delG, 1 vakada (1) homozigot durumda 1232-1233insT ve 1 vakada (5) homozigot durumda Q473X mutasyonları belirlenmiştir. Bu mutasyonlardan 389delG, P179S, 763delT, 929delG ve 1232- 1233insT literatürde ilk kez bildirilmektedir. Mutasyonların allel frekansı ise; 389delG %40, 763delT %20, 929delG %10, 1232-1233insT %10, Q473X %10 ve P179S %5 olarak belirlenmiştir. Bu çalışmada, ilk kez belirlenen mutasyonların, GALNS geni ile ilgili protein yapı-fonksiyon çalışmalarına katkıda bulunacağı düşünülmektedir.

Özet (Çeviri)

ABSTRACT Terzioglu, M., Molecular genetic analysis of mucopolysaccharidosis type IV A mutations, Hacettepe University Institute of Health Sciences PhD Thesis in Medical Biology, Ankara, 2002. Mucopolysaccharidoses (MPSs) are a group of inherited metabolic disorders result from the deficiencies of a group of enzymes responsible for the degradation of sulphated glycosaminoglycans in lysosomes. In this degradation pathway, 10 different enzymes are involved and 10 different MPS types appeared. Among these types, the MPS IVA is defined by the deficiency of N- acetylgalactosamine-6-sulfate sulfatase (GALNS) enzyme. The deficiency of GALNS involved in the degradation of keratan sulfate (KS) and chondroitin-6- sulfate (C-6-S) in the lysosomes results in the accumulation of these substrates in the lysosomes. The accumulated KS and C-6-S causes the deformities especially in bone structure, corneal clouding, growth retardation, and hepatomegaly. In this study, 10 MPS IVA cases' GALNS genes were analyzed with molecular genetic techniques and mutations were detected. GALNS gene is composed of totally 14 exons and all exons were amplified by PCR reactions. The amplified exons were subjected to SSCP analysis and in the exons, which showed aberrant migration patterns, nucleotide changes were found by sequence analysis. Manual sequence reactions were performed by using both forward and reverse primers. As a result of sequencing analyses, 389delG mutation were found in 4 cases (2, 3, 7 and 8) in homozygous state, P179S mutation in 1 case (10) in heterozygous state, 763delT mutation in 2 cases (6 and 9) as homozygous state, 929delG mutation in 1 case (4) as homozygous state, 1232-1233insT mutation in 1 case (1) as homozygous state, and Q473X mutation in 1 case (5) as homozygous state. Among these mutations, 389delG, 763delT, 929delG, 1232-1233insT, and P179S were reported for the first time in the literature. The allelic frequencies of the mutations were found to be as follows; 389delG 40%, 763delT 20%, 929delG 10%, 1232-1233insT 10%, Q473X 10%, and P179S 5%. The mutations that are defined for the first time in this study will help for protein structure-function studies of GALNS gene.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    789134

    EÜTF çocuk metabolizma-beslenme bilim dalında mukopolisakkarridoz tanısı ile izlenen olguların epidemiyolojik açıdan değerlendirilmesi

    Epidemiologic evaluation of the cases with the diagnosis of mucopolysaccharidoses that were followed up at the pediatric metabolism and nutrition department of Ege University Faculty of medicine

    CEREN HANDE SEYYAR

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2023

    Çocuk Sağlığı ve HastalıklarıEge Üniversitesi

    Çocuk Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. MAHMUT ÇOKER

  2. Tez No

    417345

    Mukopolisakkaridoz tarama - tanı testlerinin kurulması ve referans aralıklarının belirlenmesi

    Establishment of screening and diagnostic laboratory tests for mucopolysaccharidoses and determination of reference intervals

    KHALED EL MOUSTAFA

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2015

    BiyokimyaHacettepe Üniversitesi

    Tıbbi Biyokimya Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. İNCİLAY LAY

  3. Tez No

    165780

    Mukopolisakkaridozlu olguların klinik ve laboratuvar bulgularının değerlendirilmesi

    Başlık çevirisi yok

    GAZİ UYANIK

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2005

    Çocuk Sağlığı ve Hastalıklarıİstanbul Üniversitesi

    Çocuk Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    PROF.DR. MEMNUNE YÜKSEL APAK

  4. Tez No

    467439

    Keçi populasyonlarının mukopolisakkaridoz tip III D genetik kusuru bakımından tanımlanması

    Identification of mucopolysaccharidosis type I D genetic disorder in goat populations

    YASEMİN GEDİK AYDOĞDU

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2017

    BiyoteknolojiAnkara Üniversitesi

    Zootekni Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ORHAN KAVUNCU

  5. Tez No

    343556

    Mukopolisakkaridoz Tip I (MPS I) hastalarında IDUA gen mutasyonlarının analizi

    Analysis of IDUA gene mutations in patients with mucopolysaccharidosis type i (MPS I)

    NAZENTE ATÇEKEN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2013

    BiyolojiAksaray Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. MEHMET KARACA

    PROF. DR. RIZA KÖKSAL ÖZGÜL

Geri Dön