Geri Dön

Purification and biochemical characterization of beta-1,4-endoxylanases from Rhizopus oryzae

Rhizopus oryzae küfünden beta-1,4-endoksilanaz enzimlerinin saflaştırılması ve biyokimyasal karakterizasyonu

  1. Tez No: 119112
  2. Yazar: UMUT AKINCI
  3. Danışmanlar: DOÇ. DR. UFUK BAKIR
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Kimya, Chemistry
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2002
  8. Dil: İngilizce
  9. Üniversite: Orta Doğu Teknik Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Biyokimya Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 78

Özet

ÖZ Rhizopus oryzae KÜFÜNDEH pB-1,4-ENDOKSİLANAZ ENZİMLERİNİN SAFLÂŞTIRILMASI VE BİYOKİMYASAL KABATEKİZASYONÜ Akıncı, Umut Yüksek Lisans, Biyokimya Bölümü Tez Yöneticisi: Doç.Dr. U&k Bata Ocak 2002, 66Sayfe Ksilan, bitki hücre duvarımda bofonan hemiselülosik bir poEsattarittir. Selülozdan sonra en sik rastlanan biyopoîimer olup, bitki kum ağırlığımın. % 30 ur u temsil etmektedir. Birçok yararlı ttrftaön hazırlanmasında Wtaailabifen yenilenebilir biyokütlerin önemli bir kaynağım oluştan, Ksilan parçalayıcı enzim sisteminin en önemli enzimi olan P-,154-Eodoksilanaz ( EC 3,2.1.8 ) " ksilan yapısındaki glikozidik bağlan hidrolize eder. Ksilanaz enzimi, Clostridium, Aspergillus, Bacillus, Trichoderma ve Streptomyces gibi birçok değişik microorganizmadan saflaştırılmıştır. p-l54-Erdoksilamaz enziminin saflaştırilmasında jel filtrasyon, iyon değiştirici ve affinite kromatografileri sıklıkla]Bu çalışmada, iki P-l,4-Endoksilanaz enzimi ( Ksilanaz I ve Ksilanaz II ) Khizopus oryzae (ATCC 9363) 'den jel filtrasyon ( Sepbadex G-50 ) ve anyon değiştirici ( DEAE-Selüloz ) kromatografîleri kullanılarak saflaştırılmış ve karakterize edilmiştir. 777 U/mg özgül aktivîteyle 165 kat saflaştırılmış olan Ksilanaz I enziminin moleküler ağırlığı, SDS polyakrilamit jel elektroforezinde 29,000 Da luk tek bir protein bantı görülerek saptanmıştır. Ksilanaz I enziminin en aktif okluğu pH değeri 4.8 olarak hesaplanmıştır. Lineweaver- Burk grafiği kullanılarak, Ksilanaz I enzimininin. Km ve V^k değerleri sırasıyla 64.7mg ksilan/ mi ve 3703U/mg olarak bulunmuştur. Kısmen saflaştılrılmış olan Ksilanaz H enziminin saflaştırma katsayısı 1 19.4, özgül aktivitesi 562.5 U/ mg proteindir. Moleküler ağırlığı, % 12 SDS polyakrilamit jel elektroforezi kullanılarak 24,000 Da olarak tahmin edilmektedir. Ksilanaz II aktivitesi için optimum pH değeri 6 'ya eşittir. Bu enzim için Km ve Vmax değerleri sırasıyla 17.1mg ksilan/ mi ve 1122 U/ mg olarak hesaplanmıştır. Anahtar Sözcükler : Ksilan, Ksilanaz, Khizopus oryzae, saflaştırma, biyokimyasal karakterizasyon vı

Özet (Çeviri)

ABSTRACT PURIFICATION AN» BIOCHEMICAL CHAMACTEREATION OF P-M-ENDOXYLANASESFROM MMwpmmyme Akıncı, Umut M.S., Department of Biochemistry Supervisor: Assoc. Prof Dr. Ufck Bakr January 2002,66 pages Xylan is a hemieelMosic polysaccharide found in the plant cell walls. It Is the most abundant bibpolymer after cellulose, representiog 30 % of the dry weight of plants. It is a significant resource of renewable biomass which can fee converted into many usefiil products. fM,4- îbteylaaase {EC 3.2.1.8 ) which is responsible &r the cleavage of glycoside hoods within the xylan backbone, is the most crucial enzyme of the xylan degrading enzyme system. It has been produced and purified from many microorganisms including Clostridium, Aspergillus, Bacillus, Trichoderma and Simptomyces. Gel filtration, ion inexchange and affinity chromatographies have widely been used to purify (5- 1,4-Endoxylanases. In this study, two pM,4-Endoxylanases (Xylanase I and Xylanase E ) were purified by using gel filtration (Sephadex G-50) and anion exchange (DEAE-CelMose) chromatographies and characterized from. Rhizopus oryzae. Xylanase I was purified to give a single band of 29,000 Da by SDS-PAGE analysis, with a purification fold of 165 and specific activity of 777 U/mg. Xylanase I was most active at pH 4.8. The Km and Vmax values of Xylanase I were calculated as 64.7 mg xylan/ml and 3703 U/mg respectively, by plotting Lineweaver-Burk plot Xylanase II was partially purified with a purification fold of 1 19.4 and a specific activity of 562.5 U/ mg protein. Its molecular weight was estimated as 24,000 Da by using 12% SDS polyacrylamide gel electrophoresis. The optimum pH of Xylanase II is 6. The Km and Vmw values of Xylanase II were calculated as 17.1 mg xylan/ ml and 1 122 U/mg, respectively. Keywords Xylan, Xylanase, Rhizopus oryzae, purification, biochemical characterization rv

Benzer Tezler

  1. Tez No

    318063

    Beta-1,4-endoksilanaz ve beta-(1,3-1,4)-glukanaz enzimlerini üreten Bacillus sp. izolasyonu, enzimlerin kısmi saflaştırılması ve karakterizasyonu

    Beta-1,4-endoxylanase and beta-(1,3-1,4)-glucanase producing Bacillus sp. isolation, partial purification and characterization of the enzymes

    SEVTAP SARITÜRK

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2012

    BiyolojiKahramanmaraş Sütçü İmam Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. ASHABİL AYGAN

  2. Tez No

    456160

    Farklı Aspergillus türü funguslarda selüloz ve hemiselüloz parçalayıcı enzim aktivitelerinin incelenmesi

    Screening of cellulose and hemicellulose enzyme activities in different A456160spergillus species

    ASLI TANGÜNÜ

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2016

    BiyokimyaBalıkesir Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. AYŞE DİLEK AZAZ

  3. Tez No

    506081

    Katı substrat fermentasyonu (KSF) ile Trichoderma harzianum ve Trichoderma viride türü funguslarda ksilanaz üretimi, saflaştırılması ve biyokimyasal özelliklerin belirlenmesi

    Xylanase production, purification and identification of biochemical characteristics of Trichoderma harzianum and Trichoderma viride species fungi through solid state fermentation

    HÜSEYİN ALPER İRTEM

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2018

    MikrobiyolojiBalıkesir Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. AYŞE DİLEK AZAZ

  4. Tez No

    875437

    Trichoderma atroviride'den β-glukosidaz eldesi, saflaştırılması ve biyokimyasal karakterizasyonunun belirlenmesi

    Purification, determination of biochemical characterization of β-glucosidase from trichoderma atroviride

    HATİCE AYDIN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2023

    BiyolojiBalıkesir Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı

    DR. ÖĞR. ÜYESİ SELMA ÇELEN YÜCETÜRK

    PROF. DR. AYŞE DİLEK AZAZ

  5. Tez No

    287201

    Armillaria mellea mantarından beta-glukozidaz enziminin kısmi olarak saflaştırılması ve karakterizasyonu

    Partial purification and characterization of beta-glucosidase from Armillaria mellea

    AYŞE TURAN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2011

    KimyaKaradeniz Teknik Üniversitesi

    Kimya Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. NAGİHAN SAĞLAM ERTUNGA

Geri Dön