Trehalose and glycogen metabolism of gcrl mutants of Saccharomyces cerevisiae
Saccharomyces cerevisiae gcrl mutantlarında trehaloz ve glikojen metabolizması
- Tez No: 119434
- Danışmanlar: PROF. DR. HALUK HAMAMCI, DOÇ. DR. MUSTAFA TÜRKER
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Biyoteknoloji, Biotechnology
- Anahtar Kelimeler: Trehaloz, glikojen, Saccharomyces cerevisiae, GCRİ, karbonhidrat metabolizması VI, Trehalose, glycogen, Saccharomyces cerevisiae, glycolysis, GCR, carbohydrate metabolism IV
- Yıl: 2002
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Orta Doğu Teknik Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 255
Özet
öz SACCHAROMYCES CEREVISIAE gcrl MUTANTLARINDA TREHALOZ VE GLİKOJEN METABOLİZMASI Şeker, Tamay Doktora, Biyoteknoloji EABD Tez Yöneticisi : Prof. Dr. Haluk Hamamcı Yardımcı Tez Yöneticisi : Doç. Dr. Mustafa Türker Mart 2002, 235 sayfa S. cerevisiae, uzun tarihi ve model organizma olması nedeniyle en önemli organizmalardan biridir. Trehaloz ve glikojen, maya hücresinin temel karbonhidratlarıdır ve mayanın değişen çevre şartlarına uyum göstermesinde rol oynayan en önemli kalite işaretleridir. Bu uyum esnasında trehaloz, maya hücresinin zor şartlar altındayken korunması ve canlılığını devam ettirmesinde önemli rol oynarken, glikojenin fonksiyonu temel enerji kaynağı olmasıdır. Trehaloz metabolizmasının ayrıca glikoz alımında da kontrol edici rolü vardır.GCRİ DNA ya bağlanan bir proteindir ve glikolitik genlerin transkripsiyonunu kontrol eder. Bu genin çıkarılması durumunda, geri hücrelerinde glikolitik enzimlerin seviyesi orjinal tipin % 5- 10' una düşer ve bu mutantlar glikozu etkin kullanamazlar. Bu çalışmada, geri maya hücrelerinin glikoz eklemesine verdiği tepki, trehaloz ve glikojen seviyelerinde ki değişiklik dikkate alınarak incelenmeye çalışılmıştır. Logaritmik faz başlangıcında ki trehaloz miktarları geri hücrelerinde ve orjinal tipte birbirine yakın miktarlarda bulunurken, glikojen seviyesi orjinal tipte mutantın iki katı olarak tespit edilmiştir. Orjinal tip ve geri hüclerinde trehaloz ve glikojen seviyeleri, birinci ve ikinci saatler içinde hızlı bir birikim gösterdikten sonra, düzgün bir azalma sonunda düşük seviyelerde sabitlenerek, glikoz palsma aynı tepkiyi verdikleri görülmüştür. Hem trehaloz hem de glikojen birikimi geri hücrelerinde, orjinal tipe göre daha hızlı iken, devaminda ki azalma, tersine, orjinal tipte daha hızlıdır. Bu bulgular, geri mutantları için önerilen fenotipik özelliklerle uyumludur ve sonuç olarak trehaloz ve glikojen metabolizmasında yer alan öğelerin GCRİ mutasyonundan etkilenmemiş olabileceği ve glikoz baskılanma mekanizmasının hem orjinal tip maya hücrelerinde hem de geri hücrelerinde aynı olabileceği düşünülmüştür.
Özet (Çeviri)
ABSTRACT TREHALOSE AND GLYCOGEN METABOLISM OF gcrl MUTANTS OF SACCHAROMYCES CEREVISIAE Şeker, Tamay Ph.D., Department of Biotechnology Supervisior : Prof. Dr. Haluk Hamamcı Co-supervisior : Assoc. Prof. Dr. Mustafa Türker March 2002, 235 pages S. cerevisiae is one of the most important microorganisms with respect to its long history and being model organism. Trehalose and glycogen are the major carbohydrate stores in yeast cell and they are typically hall-marks of rapid adaptations of yeast cells to environmental changing conditions such that trehalose has a significant role in preservation and survival of the yeast cells under adverse conditions, while glycogen is the main energy source. Trehalose metabolism has also a regulatory role in glucose uptake. GCR1 encodes a DNA binding protein and regulates the transciption of the glycolytic genes and the levels of most of the glycolytic enzymes are reduced 111to 5- 10 % of the wild type in gcrl cells resulting in growth deficiency. In this study, the response of gcrl yeast cells to the glucose pulse was questioned with respect to the change in trehalose and glycogen levels. The initial trehalose levels were determined as similar both in wild type and gcrl cells at the beginning of the exponential phase, whereas, wild type has two times glycogen of the mutant yeast cell. A fast accumulation in the 1st and 2nd hours which is followed by a steady decrease reaching to stable low levels seems to be the same phenomenon for both glycogen and trehalose levels in gcrl and wild type yeast cells in response to a glucose pulse. Both trehalose and glycogen accumulation are higher in the gcrl cells compared to the wild type, but the following decreasing period is higher in the wild type inversely. This observation is adaptable to the proposed phenotype for gcrl cells and in summary we have an idea of that the components of trehalose and glycogen metabolisms may not be affected with GCR1 mutation and both of gcrl cells and wild type yeast cells may have similar glucose repression mechanisms.
Benzer Tezler
- Bazı maya türlerinde trehaloz ve glikojen metabolizmasına etki eden faktörlerin analizi
Analysis of factors affecting metabolism of trehalose and glycogen metabolisms in some yeast species
HÜLYA KARACA GENÇER
- Molecular and physiological characterization of a salt-resistant Saccharomyces cerevisiae mutant obtained by evolutionary engineering
Evrimsel mühendislik yöntemiyle elde edilmiş tuza dirençli bir Saccharomyces cerevisiae mutantının moleküler ve fizyolojik karakterizasyonu
ŞEYMA HANDE TEKARSLAN
Doktora
İngilizce
2015
Genetikİstanbul Teknik ÜniversitesiMoleküler Biyoloji-Genetik ve Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ZEYNEP PETEK ÇAKAR
PROF. DR. CAROLA HUNTE
- Molecular chracterization of oxidative stress resistant yeast
Oksidatif strese dirençli mutant mayanın karakterizasyonu
NAZLI KOCAEFE
Yüksek Lisans
İngilizce
2012
Biyoteknolojiİstanbul Teknik Üniversitesiİleri Teknolojiler Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ZEYNEP PETEK ÇAKAR
- Saccharomyces cerevisiae maya türünde Gcn5 transkripsiyon koaktivatörünün TPS1 ve NTH1 gen ekspresyonlarına etkisinin belirlenmesi
Determination of the effect of Gcn5 transcription coactivator on TPS1 and NTH1 gene expressions in yeast Saccharomyces cerevisiae
GÜLŞAH TOYRAN
Yüksek Lisans
Türkçe
2022
GenetikÇanakkale Onsekiz Mart ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ TÜLAY TURGUT GENÇ
- Kalsiyum sinyal iletim yolağının glukoz metabolizmasında yer alan bazı genlerin transkripsiyonuna ve hücre döngüsünün kontrolüne etkilerinin incelenmesi
Investigation of the effect of calcium signaling pathway on the cell cycle regulation and transcription of genes that involves in glucose metabolism
OSMAN ALP ÖZTOP
Yüksek Lisans
Türkçe
2020
GenetikBursa Uludağ ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. SEZAİ TÜRKEL