Geri Dön

Isolation and molecular characterization of lactic acid bacteria from raw milk

Çiğ sütten laktik asit bakterilerinin izolasyonu ve moleküler karakterizasyonu

PDF İndir

  1. Tez No: 121022
  2. Yazar: ALİ EMRAH ÇETİN
  3. Danışmanlar: DOÇ.DR. HATİCE GÜNEŞ, PROF.DR. ŞEBNEM HARSA, Y.DOÇ.DR. ALİ FAZIL YENİDÜNYA
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Biyoteknoloji, Biotechnology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2002
  8. Dil: İngilizce
  9. Üniversite: İzmir Yüksek Teknoloji Enstitüsü
  10. Enstitü: Mühendislik ve Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 91

Özet

öz Laktik asit bakterileri, çeşitli gıdaların üretiminde starter kültür olarak kullanılmaları, antimikrobiyal maddeleri üretmeleri ve probiyotik ürünlerin formülasyonlarında yer almaları bakımından endüstriyel açıdan büyük öneme sahiptir. Çiğ süt, geleneksel yöntemlerle, ticari starter kültür kullanılmadan üretilmiş peynirler ve kefir gibi ülkemizde üretilen birçok süt ürünü yeni laktik asit bakteri suşları için iyi bir kaynak teşkil etmektedir. Bu laktik asit bakteri suşları, tat ve aroma özelliği bakımından farklı fermente süt ürünlerinin elde edilmesinde büyük potansiyele sahip olabilirler. Bu nedenle laktik asit bakterilerinin doğal kaynaklardan izolasyonu ve tanımlanması büyük önem taşımaktadır. Uzun zamandan beri, laktik asit bakterilerinin tanımlanmasında çeşitli fenotipik yöntemler kullanılmaktadır. Ancak, bu metotlar, bir genus içindeki alt türleri ve suşları etkin bir şekilde ayırt etmede çoğu zaman yetersiz kalmaktadır. Bu yüzden genotipik özelliklere dayanan yeni metotlar geliştirilmiş ve bakterilerin etkin bir şekilde tanımlanmasında kullanılmaya başlanmıştır. Bu çalışmada, laktik asit bakterilerinin çiğ inek sütünden izolasyonu yapılarak, biyokimyasal testler, polimeraz zincir reaksiyonuna (PCR) dayanan metotlar ve“pulsed field”jel elektroforezi (PFGE) uygulanarak tanımlanması amaçlanmıştır. Laktik asit bakterileri çiğ inek sütünden izole edilmiş ve ilk önce biyokimyasal testlerle tanımlanmıştır. Daha sonra polimeraz zincir reaksiyonuna dayanan iki metot, ITS-PCR (“Internal Transcribed Spacer-PCR”) ve PCR-RFLP (“PCR- Restriction Fragment Length Polymorphism”), referans laktik asit bakteri suşlarının tanımlanması için kullanılmıştır. 16S rRNA geninin çoğaltılması ve restriksiyon enzimiyle kesilmesine dayanan PCR-RFLP metodunun tanımlama için uygun bir metot olduğu kanısına varılmıştır. PCR-RFLP metoduyla, çiğ sütten elde edilen 13 izolat Lactococcus lactis, 24 izolat Enterococcus spp. ve 2 izolat da Lactococcus lactis subsp. cremoris olarak belirlenmiştir. Ayrıca PFGE, referans kültürlerin tanımlanması için optimize edilmiştir. Genomik DNA' nın Sma I restriksiyon enzimi kesilmesi sonucu elde edilen fragman profilleri Lactococcus, Enterococcus ve Streptococcus thermophilus referans suşlarının tanımlanmasını mümkün kılmıştır.

Özet (Çeviri)

ABSTRACT Lactic acid bacteria are industrially important because they are used as starter cultures in food production, they produce antimicrobial compounds and they are used in the formulation of probiotic products. Several dairy products such as raw milk, traditionally fermented cheese (produced without the use of commercial starter cultures), and kefir which are produced in country are good sources of novel lactic acid bacterial strains. These lactic acid bacterial strains may have potential for the production of new fermented dairy products with characteristic aroma and flavour. Therefore, the isolation of lactic acid bacteria from natural products and their identification are important. For many years, several phenotypic methods have been used to identify lactic acid bacteria, but they are not often capable of effectively differentiating subspecies and strains within a genus. New methods based on the genotypic properties have been developed and used for the proper classification of bacteria. The aim of this research was the isolation of lactic acid bacteria from raw milk and the identification of the lactic acid bacterial isolates by biochemical tests, polymerase chain reaction (PCR)-based methods and pulsed field gel electrophoresis (PFGE). Lactic acid bacteria were isolated from cow's raw milk and identified by biochemical reactions. Two PCR based methods, ITS-PCR (Internal Transcribed Spacer-PCR) and PCR-RFLP (PCR- Restriction Fragment Length Polymorphism) were then used for the differentiation of reference strains of lactic acid bacteria. PCR-RFLP method, based on the amplification and restriction digestion of 16S rRNA gene, was found to be useful for the identification. Thirteen raw milk isolates were identified as Lactococcus lactis, 24 as Enterococcus spp., and 2 as Lactococcus lactis subsp. cremoris by PCR-RFLP method. Pulsed field gel electrophoresis was also optimized for the identification of reference strains. Restriction profiles obtained by digesting the genomic DNA with Sma I enabled differentiation of the reference strains of Lactococcus, Enterococcus, and Streptococus thermophilus.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    679936

    Erzurum yöresinden toplanan çiğ süt örneklerinden laktik asit bakterilerinin izolasyonu, identifikasyonu ve moleküler karakterizasyonu

    Isolation identification and molecular charecterization of lactic acid bacteria from raw milk samples collected from Erzurum region

    SELCAN DOĞAN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2021

    Besin Hijyeni ve TeknolojisiAtatürk Üniversitesi

    Besin Hijyeni ve Teknolojisi Ana Bilim Dalı

    PROF. GÜLŞAH ÇANAKÇI ADIGÜZEL

  2. Tez No

    134303

    Isolation and molecular characterization of lactic acid bacteria from cheese

    Peynirden laktik asit bakterisi izolasyonu ve moleküler karakterizasyonu

    ÇİSEM BULUT

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2003

    Biyomühendislikİzmir Yüksek Teknoloji Enstitüsü

    Biyoteknoloji ve Biyomühendislik Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. ALİ FAZIL YENİDÜNYA

  3. Tez No

    374610

    Isolation and molecular characterization of Lactobacillus and Lactococcus strains from home made cheese

    Ev yapımı peynirlerden Lactobacillus ve Lactococcus suşlarının izolasyonu ve moleküler karakterizasyonu

    AHMED SHUKRI SABRI ALSALIHI

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2014

    GenetikKahramanmaraş Sütçü İmam Üniversitesi

    Biyomühendislik ve Bilimleri Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. MEHMET SAİT EKİNCİ

  4. Tez No

    629061

    Buğdaygil silajlarından izole edilen laktik asit bakterilerinin moleküler tanımlanması ve karakterizasyonu

    Molecular identification and characterization of lactic acid bacteria isolated from small grain silages

    FATMA AKSU

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2020

    MikrobiyolojiKahramanmaraş Sütçü İmam Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. EMEL BANU BÜYÜKÜNAL

  5. Tez No

    459049

    Türkiye'nin farklı yörelerinden toplanan beyaz peynir örneklerinden laktik asit bakterilerinin izolasyonu, identifikasyonu ve moleküler karakterizasyonu

    Isolation, identification and molecular chracterization of lactic acid bacteria from different regions of Turkey white cheese samples

    SUMEYYA ARSLAN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2017

    MikrobiyolojiAtatürk Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. AHMET ADIGÜZEL

Geri Dön