Geri Dön

Erzurum yöresinden toplanan çiğ süt örneklerinden laktik asit bakterilerinin izolasyonu, identifikasyonu ve moleküler karakterizasyonu

Isolation identification and molecular charecterization of lactic acid bacteria from raw milk samples collected from Erzurum region

PDF İndir

  1. Tez No: 679936
  2. Yazar: SELCAN DOĞAN
  3. Danışmanlar: PROF. GÜLŞAH ÇANAKÇI ADIGÜZEL
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Besin Hijyeni ve Teknolojisi, Food Hygiene and Technology
  6. Anahtar Kelimeler: Dizi analizi-RNA, Erzurum, Laktik asit, Laktik asit bakterileri, Mikro RNA, Polimeraz zincirleme reaksiyonu, Çiğ süt, Sequence analysis-RNA, Erzurum, Lactic acid, Lactic acid bacteria, Micro RNA, Polymerase chain reaction, Raw milk
  7. Yıl: 2021
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Atatürk Üniversitesi
  10. Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Besin Hijyeni ve Teknolojisi Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.

Özet

Amaç: Süt, sahip olduğu yüksek su aktivitesi nedeniyle başta laktik asit bakterileri olmak üzere, farklı mikrobiyal içerikler açısından önemli bir kaynaktır. Çiğ sütte bulunan patojen mikroorganizmaların varlığı, insan sağlığı açısında önem arz etmektedir. Bu tez çalışmasında Erzurum ve çevresinden toplanan çiğ süt örneklerinden, laktik asit bakterilerinin belirlenmesi, identifikasyonu ve olası yeni tür veya cinslerin taksonomiye kazandırılması amaçlanmıştır. Materyal metot: Bu tez çalışmasında Erzurum ve ilçelerindeki üreticilerden toplanan 50 adet çiğ süt örneği, steril koşullar altında laboratuvar ortamına getirilmiş ve hemen bakteri izolasyon aşamasına geçilmiştir. Stoklanan bakterilerin DNA'ları izole edilmiş, daha sonra rep-PCR [BOX ve (GTG)5-PCR] ile birbirinden farklı olan izolatlar seçilerek, 16S rRNA sekans analizine tabii tutulmuş ve 11 farklı türün varlığı ortaya konulmuştur. Bulgular: Tanılanan suşlar: TS-1, TS-3, TS-9 ve TS-11'in %99.43 oranında Enterococcus italicus, TS-2 kodlu izolatın %99.50 oranında Leuconostoc lactis, TS-4 kodlu izolatın %99.50 oranında Streptococcus parauberis, TS-5 kodlu izolatın %99.43 oranında Enterococcus durans, TS-6 kodlu izolatın %99.20 oranında Corynebacterium casei, TS-7 ve TS-8 kodlu izolatların %99 oranında Lactococcus lactis, TS-10 kodlu izolatın %98 oranında Streptococcus uberis, TS-13 kodlu izolatın %99.9 oranında Staphylococcus succinis, TS-17 kodlu suşun %99 oranında Lactococcos lactis subsp. latei, TS-18 kodlu izolatın Lactococcos lactis subsp. hordniae ve TS-19 kodlu izolatın ise %99.60 oranında Lactobacillus paracasei'e benzerlik gösterdiği gözlemlenmiştir. Sonuç: İncelenen çiğ süt örneklerinden izole edilen laktik asit bakterinin tür ve tür altı düzeyde identifikasyonunda (GTG)5-PCR yönteminin daha başarılı olduğu, %98 oranında Streptococcus uberis'e benzerlik gösteren TS-10 kodlu izolatın yeni tür olabileceği ve ileri tanı teknikleri ile yeniden incelenmesi gerektiği sonucuna varılmıştır.

Özet (Çeviri)

Purpose: Milk is an important source of different microbial contents, especially lactic acid bacteria, due to its high water activity. The presence of pathogenic microorganisms in raw milk is crucial for human health. In this thesis study, isolation and identification of lactic acid bacteria from raw milk samples collected from Erzurum and its surroundings and introducing possible new species or genus into taxonomy were aimed. Material method: In this thesis study, 50 raw milk samples collected from producers in Erzurum and its districts were brought to the laboratory under sterile conditions and the bacteria isolation phase was immediately started. The DNAs of the stocked bacteria were isolated, then the isolates different from each other were selected by rep-PCR [BOX and (GTG) 5-PCR], subjected to 16S rRNA sequence analysis and the existence of 11 different species was revealed. Results: It was observed that TS-1, TS-3, TS-9 and TS-11 coded isolates showed similarity to Enterococcus italicus with the rate of 99.43%, TS-2 coded isolate to Leuconostoc lactis with the rate of 99.50% and TS-4 coded isolate to Streptococcus parauberis with the rate of 99.5%, TS-5 coded isolate to Enterococcus durans with the rate of 99.43%, TS-6 coded isolate to Corynebacterium casei with the rate of 99.20%, TS-7 and TS-8 coded isolates to Lactococcus lactis with the rate of 99%, TS-10 coded isolate to Streptococcus uberis with the rate of 98%, TS-13 coded isolate to Staphylococcus succinis with the rate of 99.9%, TS-17 coded isolate to Lactococcos lactis subsp. latei with the rate of 99%, TS-18 coded isolate to Lactococcos lactis subsp. hordniae with the rate of 99.60% and TS-19 coded isolate to Lactobacillus paracasei with the rate of 99.60%. Conclusion: It was concluded that (GTG) 5-PCR method was more successful in the identification of lactic acid bacteria isolated from the examined raw milk samples at the species and subspecies level, the isolate coded TS-10, which was 98% similar to Streptococcus uberis, could be a new species and should be re-examined with advanced diagnostic techniques.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    96449

    Erzurum yöresinden toplanan küflü tulum peynirlerinden izole edilen Penicillum roqueforti suşlarının tulum peynirlerindeki aktivitesiyle oluşan toksikolojik ve kimyasal değişmeler

    Chemical and toxicological alterations with the activity of penicillum roquerfortissp. İsolated from the tulum cheese collected from Erzurum region

    AHMET ERDOĞAN

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2000

    Gıda MühendisliğiAtatürk Üniversitesi

    Gıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. SELAHATTİN SERT

  2. Tez No

    196266

    Erzurum ve Bingöl yöresinden toplanan kurut örneklerinin mikrobiyolojik ve kimyasal nitelikleri

    Microbiological and chemical properties of kurut samples collected from Erzurum and Bingöl regions

    MERYEM AYDEMİR ATASEVER

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2007

    Besin Hijyeni ve TeknolojisiAtatürk Üniversitesi

    Besin Hijyeni ve Teknolojisi Ana Bilim Dalı

    DOÇ. MUSTAFA ATASEVER

  3. Tez No

    993638

    Erzurum'dan toplanan fasulye genotiplerinin tuz tolerans seviyelerinin bazı morfolojik ve fizyolojik parametrelerle belirlenmesi

    Determination of salt tolerance levels of bean genotypes collected from Erzurum by some morphological and physiological parameters

    KÜBRA KARADOĞAN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2026

    ZiraatAtatürk Üniversitesi

    Bahçe Bitkileri Ana Bilim Dalı

    DR. ÖĞR. ÜYESİ RAZİYE KUL

  4. Tez No

    181477

    Oltu (Erzurum) yöresinde yetişen kapari (Capparis ovata var. herbacea) tomurcuklarının bileşimi ve salamuraya işlenmesi

    Composition and processinf to brine of capers buds (Capparis ovata var. herbacea) growing in Oltu (Erzurum) region

    YEŞİM MUALLA ÇİL

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2006

    Gıda MühendisliğiAtatürk Üniversitesi

    Gıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    Y.DOÇ.DR. İHSAN GÜNGÖR ŞAT

  5. Tez No

    536411

    Erzurum yöresinde tilkilerde görülen ektoparazitler

    Ectoparasites on red foxes in Erzurum region

    SALI YAYA

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2019

    Veteriner HekimliğiAtatürk Üniversitesi

    Veterinerlik Parazitolojisi Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. İBRAHİM BALKAYA

Geri Dön