Türk populasyonunda NAT1 (N-asetiltransferaz tip1) lokusu polimorfizmi
Başlık çevirisi mevcut değil.
- Tez No: 121587
- Danışmanlar: DOÇ. DR. FEVZİ BARDAKÇI
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoloji, Biology
- Anahtar Kelimeler: NAT1, SSCP, RFLP, HUMAN, POLYMORPHISM
- Yıl: 2002
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Cumhuriyet Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 81
Özet
Ill ÖZET Yüksek Lisans Tezi Türk populasyonunda NAT1 (N-asetiltransferaz tip 1) Iokusu polimorfizmi ScrdalARSLAN Cumhuriyet Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü Biyoloji Anabilim Dalı Danışman: Doç. Dr. Fevzi BARDAKÇI NAT (N-asetiltransferaz) enzimi için, NAT1 (N-asetiltransferaz tipi) ve NAT2 (N- asetiltransferaz tip2) olmak üzere asetiltransferaz aktivitesi gösteren sitozolik iki izoenzim bilinmektedir. NAT1 kromozomun 8p21.3 bölgesinde lokalize olmuş, 870 baz çifti uzunluğunda 290 aminoasitlik proteinleri oluşturan bir gendir. İnsan populasyonunda 25 NAT1 aleli bilinmektedir. NAT 1*4 yabani tiptir. Çalışmada PZR- RFLP (polimeraz zincir reaksiyonuna bağlı restiriksiyon uzunluk polimorfizmi) ve RZR-SSCP (polimeraz zincir reaksiyonuna bağlı tek zincir konformasyon polimorfizmi) metodlan kullanılarak, Türk populasyonunu ait yaygın NAT1 aleleri belirlenmiştir. Akraba olmayan 201 bireyin DNA örneği çalışılmış ve NAT1*3, NAT1*4, NAT1*10, NAT1*11 alel frekansları, sırasıyla %3,73, %69.6, %17.66, %7.2 oranlarında tesbit edilmiştir. Bireylere ait genotipler ve bunların sıklıkları, NAT1M/NAT1M (%51,7), NAT1*4/NAT1*10 (%22,3), NAT1*4/NAT1*11 (%7,4), NAT1*10/NAT1*10 (%3,9), NAT1*3/NAT1*10 (%2,4), NAT1*10/NAT1*11 (%1,9), NAT1*11/NAT1*11 (%1,9), NAT1*3/NAT1*4 (%1,9), NAT1*3/NAT1*3 (%0,9), NAT1 *3/NATl * 1 1 (%0,9) olarak belirlenmiştir SSCP analizi sonucu baza aleller (%1.96) teşhis edilememiştir. Tanımlanamayan bu alellerin baz dizi bilgisi olmadan, Türk populasyonuna özgü yeni bir alel olup olmadığından emin olunamaz. NAT 1*11 alelinin sıklığı farklı populasyonlardaki çalışmalarla karşılaştırıldığında yüksek oranda görülürken, diğer alellerin sıklığı (NAT1 *3,NAT1 *4, NAT1 * 1 0) Kafkas populasyonuna daha yakın oranda bulunmuştur. Anahtar Kelimden NAT1, SSCP, RFLP, İNSAN, POLİMORFİZM.
Özet (Çeviri)
IV SUMMARY MSc Thesis Polymorphism in NAT1 (N-acetyhransferase type 1) locus in a Turkish population Serdal Arslan Cumhuriyet University Graduate School of Natural and Applied Sciences, Department of Biology Supervisor: Assoc Prof. Dr. Fevzi Bardakçı Two cytosolic isozymes showing acetyltransferase activity, so called NAT1 and NAT2, are known for the NAT enzyme. NAT1, 870 base pair long, is located on chromosome 8p21.3 and encodes for a 290 amino acids long protein, contains no introns. To date, 25 alleles have been identified in human populations. NAT 1*4 is a wild-type allel. Common NAT1 alleles in Turkish population were identified using PCR-RFLP (polymerase chain reaction- restriction fragment length polymorphism) and PCR-SSCP (polymerase chain reaction-single strand conformation polymorphism) methods. DNA from 201 unrelated individuals were studied and frequencies of NAT1*3, *4, *10 and *11 were determined as 3,73%, 69,6%, 17,66 and 7,2%, respectively. Individual genotypes and their frequencies were estimated as NAT1*4/NAT1*4 (%51,7), NAT1*4/NAT1*10 (%22,3), NAT1*4/NAT1*1 1 (%7,4), NAT1*10/NAT1*10 (%3,9), NAT1*3/NAT1*10 (%2,4), NAT1*10/NAT1*11 (%1,9), NAT1*11/NAT1*11 (%1,9), NAT1*3/NAT1*4 (%1,9), NAT1*3/NAT1*3 (%0,9), NAT1*3/NAT1*11 (%0,9). As a result of SSCP analyses, some of the alleles (%1.96) could not be identified. One cannot be sure if these unidentified alleles are new alleles specific to Turkish population without their sequence information. In comparison to other studies on different populations, while the frequency of NAT1*11 allele is the highest in Turkish population, frequency of the remaining alleles (NAT1*3, NAT1*4, NAT1*10) were close to other Caucasian populations.
Benzer Tezler
- Sivas ve çevresi Symphyta (Hymenoptera:insecta) üyelerinin saptanması
A survey on Symphyta (Hymenoptera:insecta) members in Sivas and surrounding provinces
SEVDA HASTAOĞLU
Yüksek Lisans
Türkçe
2002
BiyolojiCumhuriyet ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ.DR. HASAN HÜSEYİN BAŞIBÜYÜK
- Türk popülasyonunda sağlıklı bireylerde cirrus hd-oct ile koroidal kalınlık ve santral maküler kalınlık ölçümü
Evaluation of choroidal thickness and central macular thickness in healthy turkish subjects by cirrus HD-OCT
TUBA KARA AKYÜZ
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2015
Göz HastalıklarıTurgut Özal ÜniversitesiGöz Hastalıkları Ana Bilim Dalı
PROF. YÜKSEL TOTAN
- Türk popülasyonunda infertil erkeklerde MTHFR C677T ve A1298C gen polimorfizminin araştırılması
Başlık çevirisi yok
ULVİYE ALİYEVA
- Türk populasyonunda gastrointestinal sistem kanser olgularında fosfatidilinositol-3-kinaz katalitik alfa (PIK3CA) gen mutasyonları ve metilentetrahidrofolat redüktaz (MTHFR) C677T polimorfizminin incelenmesi
Analysis of phospathidylinositol-3-kinase catalytic alfa (PIK3CA) gene mutations and methylenetetrahydrofolate reductase (MTHFR) C677T polymorphisms in gastrointestinal cancer cases in Turkish population
ÖZGE ÖZCAN
Yüksek Lisans
Türkçe
2009
BiyolojiBalıkesir ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. FERAY KÖÇKAR
PROF. DR. LEYLA AÇIK
- Türk populasyonunda, interleukin-1 beta 511 C/T ve sitokin sinyal supresör (SOCS)-1 1478 CA/DEL gen polimorfizmi ile mide adenokarsinomu arasındaki ilişkinin saptanması
Role of host interleukin-1 beta 511C/T gene and suppressor of cytokine signaling (SOCS)-1 1478 CA/DEL polymorphisms in Turkish population with gastric carcinoma
ALLA ELDEEN KEDRAH
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2009
GastroenterolojiMarmara Üniversitesiİç Hastalıkları Ana Bilim Dalı
PROF. DR. EROL AVŞAR