Helicobacter pylori cagA and vacA gene variability in dyspeptic patients in Turkey
Türkiye'de bulunan dispeptik hastalarda Helicobacter pylori cagA ve vacA gen varyasyonu
- Tez No: 128527
- Danışmanlar: DOÇ. DR. BARIK SALİH
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoloji, Biology
- Anahtar Kelimeler: Helicobacter pylori, cagA, vacA, peptik ülser, mide kanseri, PCR, RFLP. ii, Helicobacter pylori, cagA, vacA, peptic ulcer, gastric cancer, PCR, RFLP loon*****8 ft 08
- Yıl: 2002
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Fatih Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 65
Özet
TÜRKİYE'DE BULUNAN DİSPEPTİK HASTALARDA HELICOBACTER PYLORI cagA ve vacA GEN VARYASYONU HÜSEYİN SARTOAŞAK MASTER TEZİ, 2002 TEZ DANIŞMANI: Dr. BARIK SALİH ÖZET Helicobacter pylori genetik olarak farklılaşma göstermekte olup bazı suşlann daha fazla patojenik olduğu varsayılmaktadır. CagA geni yüksek virulens için bir markör olarak düşünülmektedir. Öbür taraftan VacA s2 hariç si genide in vitro sitotoxin aktivitesi, peptik ülser hastalıkları ve cagA geni ile ilişkisi olduğu bulunmuştur. RFLP ise suş değişkenlğini ayırt etmekte kullanılan bir metoddur. Bu çalışmanın amacı PCR yöntemi ile peptik ülser, mide kanseri ve gastrit hastalarından alman mide biyopsi örneklerinde cagA ve vacA genlerini tespit etmek, bu genlerin bahsi geçen hastalılarla ilişkisini ortaya koymak ve cagA geninin farklılığını RFLP yöntemiyle değerlendirmektir. Materyal ve Yöntem: Dispepsiya ve karın ağrısından şikayet eden rastgele 73 hasta Samatya Hastanesin'de endoskopiye tabi tutuldu. Midenin antral kısmından PCR ve CLO için iki tane biyopsi alındı. Sonuçlar: cagA geni PCR yöntemiyle 27 gastrit hastasından 9'unda (33%), 6 mide ülseri hastasından 5'inde (89%), 28 onikiparmak barsağı ülseri hastasından 25'inde (83%) ve 12 kanser hastasından ll'inde (91.6%) bulunmuştur. VacA sinyal dizi genotipi sla ise sırasıyla gastrit, peptik ülser ve mide kanseri 19 (90%), 24 (86%) ve 11 (92%) oranlarında bulunmuştur. Öbür taraftan sla genine sahip olan bütün kanser ve peptik ülser hastalan cagA + iken 19 gastrit hastasından 9 tanesi cagA(+)' tir. EcoRI biri hariç hepsi için aynı şekilde bi kesim düzeni verirken, Hae III ise 3 farklı pattern ortaya çıkartmıştır. Tartışma: CagA, gatritle karşılaştırıldığında, peptik ülser, mide kanseri ve vacA-sla expresyonu ile kuvvetli bir şekilde ilgilidir. RFLP HaeIII analizi kesimi suşlar arsında farklılığı ortaya çıkartmıştır.
Özet (Çeviri)
HELICOBACTER PYLORI cagA AND vacA GENE VARIABILITY IN DYSPEPTIC PATIENTS IN TURKEY HÜSEYİN SARIBAŞAK MS thesis, 2002 Thesis Supervisor: Dr. BARIK SALİH (Associate professor) ABSTRACT Helicobacter pylori display genetic diversity and certain strains are more pathogenic than others. CagA gene is considered as a marker for increased virulence. VacA-sl, but not s2 is associated with in vitro cytotoxin activity, peptic ulcers and cagA expression. Our aims were to detect and correlate the expression of cagA and vacA genes in gastric biopsies from patients with gastritis, peptic ulcer and gastric cancer and to evaluate cagA gene diversity using RFLP-PCR. Materials and Methods: Seventy three patients attending the endoscopy unit at Samatya Hospital complaining of dyspepsia and abdominal pain were selected randomly. Two biopsies were obtained from the antral part of the stomach for CLO and PCR. Results: CagA gene was detected by PCR in 9 (33%) of 27 patients with gastritis, 30 (88%) of 34 with peptic ulcers and 11 (92%) of 12 with gastric cancer. VacA signal sequence genotype sla was detected in 18 (67%), 28 (82%) and 8 (67%) of gastritis, peptic ulcer and gastric cancer patients respectively. All peptic ulcer and gastric cancer patients who were cagA positive also expressed vacA-sla genotype. Among 18 vacA-sla gastritis patients, only nine expressed cagA gene. VacA m region subtyping gave a variable result due to the detection of multiple strains in the majority of samples. EcoRI digestion of cagA revealed similar pattern among thirty-one patients, while Haelll, showed three different patterns. Conclusions. CagA is significantly associated with peptic ulcer, gastric cancer and vacA-sla expression as compared to gastritis. RFLP analysis using Haelll enzyme revealed variability among these strains.
Benzer Tezler
- Dna sequence analysis of the caga 3' gene of helicobacter pylori strains in turkey
Türkiye'deki helıcobacter pylorı caga 3' geninin dna dizi analizi
BORA KAZIM BÖLEK
- Helicobacter pylori cagA ve vacA virülans genlerinin polimeraz zincir reaksiyonu ile tanımlanması
Detection of Helicobacter pylori cagA and vacA virulence genotypes by polymerase chain reaction
CEREN ÖZKUL
Yüksek Lisans
Türkçe
2009
MikrobiyolojiHacettepe ÜniversitesiMikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. YAKUT AKYÖN YILMAZ
- Mide kanserlerinde tespit edilen H. pylori suşlarında cagA ve vacA insidansı ile antibiyotik duyarlılıklarının belirlenmesi
Determination of cagA and vacA incidence and antibiotic susceptibility of helicobacter pylori strains in gastric carcinoma
Y. KENAN DAĞLIOĞLU
Doktora
Türkçe
2002
MikrobiyolojiÇukurova ÜniversitesiMikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF.DR. FATİH KÖKSAL
- Üst gastrointestinal sistem helicobacter pylori infeksiyonlarında caga ve vaga gen varlığının spesifik ıga üzerine etkisi
The effect of caga and vaca gene on producing of specific iga in helicobacter pylori infection the upper gastrointestinal system
MURAT MEHLİ
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2007
GastroenterolojiGaziantep ÜniversitesiMikrobiyoloji ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. TEKİN KARSLIGİL
- Üst gastrointestinal sistem helicobacter pylori infeksiyonlarında CagA ve VagA gen verlığının spesifik IgA üzerindeki etkisi
The effect of caga and vaca gene on producing of specific IgA in helicobacter pylori infection the upper gastrointestinal system
MURAT MAHLİ
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2007
MikrobiyolojiGaziantep ÜniversitesiMikrobiyoloji ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. TEKİN KARSLIGİL
