Geri Dön

Helicobacter pylori cagA ve vacA virülans genlerinin polimeraz zincir reaksiyonu ile tanımlanması

Detection of Helicobacter pylori cagA and vacA virulence genotypes by polymerase chain reaction

PDF İndir

  1. Tez No: 242050
  2. Yazar: CEREN ÖZKUL
  3. Danışmanlar: PROF. DR. YAKUT AKYÖN YILMAZ
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Mikrobiyoloji, Microbiology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2009
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Hacettepe Üniversitesi
  10. Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 90

Özet

Dünya nüfusunun yarısından fazlası H. pylori ile enfektedir. H. pylori ile enfekte bütün bireyler kronik gastrik enflamasyon geliştirir ancak bu durum genellikle asemptomatiktir. Ayrıca gastrit, peptik ülser, gastrik kanser, mukoza ile ilişkili lenfoid doku (MALT) lenfoması gibi birçok gastroduodenal hastalıkla ilişkilendirilmiştir. Enfeksiyonun seyri, bakteriyel virülans faktörleri ve konak ile ilişkilidir. En önemli virülans faktörleri cagA ve vacA genleri tarafından kodlanan proteinlerdir. Genellikle cagA varlığı ve vacA allelik tiplerinin dağılımı belirgin bir coğrafi farklılık göstermektedir. Bu çalışmada cagA ve vacA allelik tiplerinin prevalansının belirlenmesi ve klinik bulgularla ilişkisinin değerlendirilmesi amaçlandı. DNA örneklerinin ekstraksiyonu için cetyltrimethyl-ammonium bromide (CTAB) yöntemi kullanıldı. Stok kültürlerde H. pylori varlığını doğrulamak amacıyla ureA geninin 411 bç'lik bölgesi PCR yöntemiyle çoğaltıldı. Daha sonra ureA geni bakımından pozitif olan 120 izolat cagA ve vacA allellerinin (s1a, s1b, s2, m1 ve m2) özgül dizilerini hedef alan primerler ile çoğaltıldı. Yüz yirmi suşun 64'ünde (%53.3) cagA saptandı. Sinyal bölgesinin s1a, s1b ve s2 varyantları sırasıyla %70.1, %2.8 ve %27.1 oranında saptandı. Orta bölge varyantlarından m2 (%65.5), m1'e (%33.6) göre daha yüksek oranda bulundu. Bir suşta hem m1 hem de m2 genotipleri birlikte bulundu. En sıklıkla s1a/m2 (%35.6) ve s1a/m1 (%33.6) allelik kombinasyonları görüldü. Ayrıca s2/m1 kombinasyonunda hiçbir suş bulunmadı. cagA pozitifliği, vacA allelleri ve klinik bulgular arasında belirgin bir ilişki bulunamadı. Ancak vacA allelik kombinasyonları ve cagA pozitifliği arasında bir ilişki saptandı.

Özet (Çeviri)

More than half of the world?s population is infected with H. pylori. All H. pylori infected individuals develop chronic gastric inflammation but this condition is usually asymptomatic. It has been also associated with several gastroduodenal diseases such as gastritis, peptic ulcer disease, gastric cancer and Mucosa Associated Lenfoid Tissue lymphoma (MALT lymphoma). Prognosis of the infection is associated with the bacterial virulence factors and host factors. The most important virulence factors are proteins which are encoded by cagA and vacA gene. Generally, the presence of cagA and distribution of vacA allelic types has shown significant geographical variation. The aim of this study was to determine the prevalence of cagA and vacA allelic types and to evaluate the association between clinical findings. The cetyltrimethyl-ammonium bromide (CTAB) method was used for the extraction of the DNA templates. In order to confirm the presence of H. pylori in stock strains, a 411 bp fragment of the ureA gene was amplified by PCR method. After that, 120 isolates which are positive for ureA gene were amplified by primers which target specific sequences of cagA and vacA alleles (s1a, s1b, s2, m1 and m2). cagA was detected in 64 (53.3%) of the 120 strains. The s1a, s1b and s2 variants of signal(s) region were detected in 70.1%, 2.8% and 27.1%, respectively. Among middle(m) region variants, m2 (65.5%) was found more prevalent than m1 (33.6%). Only one strain was found to have both vacA m1 and m2. Both m1 and m2 genotypes were found together in one strain. The most frequently seen allelic combination was s1a/m2 (35.6%) and s1a/m1 (33.6%). Furthermore, no strain with the s2/m1 combination was found. There was no significant association between cagA positivity, vacA alleles and clinical findings. However, an association between vacA allelic combinations and cagA positivity was detected.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    887306

    Bağdat hastalarında caga ve vaca virülans ve gyra antibiyotik direnç genlerinin varlığına dayalı olarak helicobacter pylori'nin moleküler tespiti

    Molecular detection of helicobacter pylori based on the presence of caga and vaca virulence and gyra antibiotic resistance genes in Baghdad patients

    NIBRAS SARHAN KHUDHAIR KHUDHAIR

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2024

    BiyolojiÇankırı Karatekin Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. TARKAN YORULMAZ

  2. Tez No

    248964

    Gastroenteroloji kliniğine başvuran hastalardan alınan mide biyopsi örneklerinde helicobacter pylori sıklığının ve virulans genlerinin araştırılması

    Investigation of the frequency and virulence genes of helicobacter pylori strains isolated from gastric biopsy from patients admitted gastroenterology clinics

    TAYLAN CALP

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2010

    MikrobiyolojiKaradeniz Teknik Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. FARUK AYDIN

  3. Tez No

    445372

    Üst gastrointestinal sistem (GİS) karsinomalı ve kronik gastritli hasta gastrik biyopsi örneklerinden hazırlanmış parafin blok örneklerinde h.pylori prevalansı ile h. pylori cagPAI ve vacA genotiplerinin histopatolojik tanı ile korelasyonunun belirlenmesi

    Determination of h. pylori prevalence and correlation between histopathologic diagnosis and h. pylori cagpai and vaca genotypes in paraffin embedded biopsy samples prepared from patients with upper gastrointestinal (gi) carcinoma and chronic gastritis

    ALI BAHADORI

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2016

    MikrobiyolojiÇukurova Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. FATİH KÖKSAL

  4. Tez No

    501835

    Helicobacter pylori'nin virulans genlerinin araştırılması ve klaritromisin direnci ile ilişkisinin belirlenmesi

    Investigation of virulance genes of Helicobacter pylory and determination of association with clarythromycin resistance

    ARZU İRVEM

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2007

    MikrobiyolojiKocaeli Üniversitesi

    Mikrobiyoloji ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. FETİYE KOLAYLI

  5. Tez No

    823936

    Investigation of helicobacter pylori virulence genes and t-cell responses in pediatric gastritis patients

    Pediatrik gastrit hastalarında helikobakter pylori virülans genleri ve t-hücre cevaplarının araştırılması

    NİRAN ÖZDEMİR

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2023

    Allerji ve İmmünolojiİstanbul Teknik Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji-Genetik ve Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. AYÇA SAYI YAZGAN

    DR. ÖĞR. ÜYESİ SİNEM ÖKTEM OKULLU

Geri Dön